CV - Institut Camille Jordan

Curriculum Vitæ
Fabien Crauste
Docteur en Math´ematiques Appliqu´ees
Charg´e de Recherches Premi`ere Classe au CNRS
Habilit´e `a Diriger des Recherches
36 ans, n´e le 17 janvier 1980 `a St-Gaudens (31)
Nationalit´e : Fran¸caise
Affiliation
1/ CNRS UMR5208 Institut Camille Jordan
Universit´e Claude Bernard Lyon 1, Villeurbanne
Site web : http ://math.univ-lyon1.fr/
2/ ´ Equipe-Projet Inria Dracula
Centre Inria Grenoble Rhˆone Alpes, Antenne Inria de la Doua, Villeurbanne
Site web : http ://dracula.univ-lyon1.fr/
Num´ero de t´el´ephone : [phone] [UCBL] / [phone] [Inria]
Num´ero de t´el´ecopie : [phone]
Adresses ´electroniques : [email protected], [email protected]
Page web : http ://math.univ-lyon1.fr/∼crauste/
Activit´es Professionnelles
depuis le Charg´e de Recherches Premi`ere Classe au CNRS
1/10/2010 CNRS UMR5208 Institut Camille Jordan, UCBL, Villeurbanne
1/10/2006 Charg´e de Recherches Deuxi`eme Classe au CNRS
au 30/09/2010 CNRS UMR5208 Institut Camille Jordan, UCBL, Villeurbanne
09/2005 - 09/2006 ATER, `a l’universit´e de Pau et des Pays de l’Adour (UPPA)
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Formation
2014 Habilitation `a Diriger des Recherches en Math´ematiques Appliqu´ees.
Soutenue le 1er d´ecembre 2014.
Titre : ´ Equations `a Retard et Mod`eles de Dynamiques de Populations
Cellulaires.
Rapporteurs de l’habilitation :
M. J. Wu – Distinguished Prof. `a York University (Toronto, Canada)
Mme. B. Laroche – DR INRA `a Jouy-en-Josas
M. K. Pakdaman – Prof. `a l’Universit´e Paris Diderot
2005 Doctorat en Math´ematiques Appliqu´ees.
Th´ese de doctorat de l’UPPA, soutenue le 21 juin 2005, mention : Tr´es Hono-
rable.
Directeur de th`ese : Mostafa Adimy (Maˆıtre de Conf´erences HDR).
Titre de la th`ese : Etude math´ematique d’´equations aux d´eriv´ees par-
tielles hyperboliques mod´elisant les processus de r´egulation des cel-
lules sanguines - Applications aux maladies h´ematologiques cycliques.
Rapporteurs de la th`ese :
M. B. Perthame – Prof. `a l’´ Ecole Normale Sup´erieure de Paris
M. V. Volpert – DR CNRS `a l’Universit´e Lyon 1
M. G. F. Webb – Prof. `a l’Universit´e Vanderbilt (Nashville, USA)
Allocataire du Minist`ere de la Recherche et des Nouvelles Technologies et moni-
teur de l’enseignement sup´erieur, attach´e au CIES d’Aquitaine et d’Outre-Mer.
2002 Diplˆome d’´ Etudes Approfondies de Math´ematiques Appliqu´ees `a la
R´esolution de Probl`emes de la Physique et de la M´ecanique `a l’UPPA.
Mention : Tr`es Bien, avec les f´elicitations du jury.
Principaux th`emes de recherche
IMod´elisation math´ematique du vivant / Biomath´ematiques
IMod`eles multi-´echelles (intra-cellulaire/extra-cellulaire/population de cellules)
IMod´elisation en immunologie (r´eponse T CD8, infection grippale, vaccination)
IMod´elisation en physiologie (production des cellules du sang, r´egulation de la prise
alimentaire)
IDynamique des populations
IMod`eles `a base d’agents
IMod`eles structur´es en ˆage et/ou maturit´e
I´ Equations diff´erentielles ordinaires et `a retard
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Responsabilit´es administratives et collectives
En cours
IMembre du comit´e de pilotage du S´eminaire de Mod´elisation du Vivant (SeMoVi,
http ://www.biosyl.org/resources/semovi) de la F´ed´eration de Biologie Syst´emique de
l’Universit´e de Lyon (depuis 2014)
Pr´ec´edemment
IMembre ´elu du comit´e de pilotage de l’Institut des Syst`emes Complexes
(IXXI) en Rhˆone Alpes (http ://www.ixxi.fr) (2010-2016)
IOrganisateur du s´eminaire de biomath´ematiques de l’Institut Camille Jordan UMR
5208 (2009 - 2012)
ICo-organisateur du s´eminaire INRIabcd, s´eminaire commun aux ´equipes Inria ”Dra-
cula” et ”Beagle” de l’Antenne de Lyon la Doua du Centre Inria Grenoble Rhˆone Alpes
(2011 - 2012).
IMembre ´elu du conseil de laboratoire de l’Institut Camille Jordan UMR 5208 (2010
- 2015)
IMembre nomm´e du conseil de laboratoire de l’Institut Camille Jordan UMR 5208
(2007 - 2010)
IMembre ´elu du comit´e consultatif 25/26 de l’UCB Lyon 1 (2007 - 2011)
IResponsable du Groupe de Travail Biomath´ematiques du Laboratoire de Math´ematiques
Appliqu´ees de Pau UMR 5142 (2005 - 2006)
IMembre ´elu du Conseil de Laboratoire de l’unit´e CNRS UMR 5142, Laboratoire de
Math´ematiques Appliqu´ees de Pau (2005 - 2006)
IMembre ´elu du Conseil Scientifique de l’Universit´e de Pau et des Pays de l’Adour
(2005 - 2006)
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Implication dans des contrats de recherche
ANR Recherches Partenariales et Innovation Biom´edicale (RPIB) ” PrediVac”
(jan 2013 - jui 2016). Budget : 990 540 ¤
.Titre : Outils de mod´elisation innovants pour la pr´ediction de l’efficacit´e de vaccins
bas´es sur les lymphocytes T CD8.
.Responsable du projet : Jacqueline Marvel (U1111 Inserm).
.Responsable du partenaire Inria : Fabien Crauste.
ANR Jeunes Chercheuses Jeunes Chercheurs (JCJC) ”ProCell” (sep 2009 - fev
2014). Budget : 90 000 ¤
.Titre : Mathematical Methods for Erythropoiesis Modelling : from Proteins to Cell
Populations.
.Responsable du projet : Fabien Crauste.
ANR Jeunes Chercheuses Jeunes Chercheurs (JCJC) ”Madcow” (2008 - 2013).
.Titre : Modelling amyloid dynamics and computation output work : applications to
prion and Alzheimer’s disease.
.Responsable du projet : Laurent Pujo-Menjouet (ICJ UMR 5208, Lyon).
ANR Blanc ”Anatools” (2007 - 2010).
.Titre : Analytical Tools for Cancer Chemotherapy Improvement.
.Responsable du projet : Ch. Perigaud (LCOBS, Montpellier).
.Responsable du partenaire math : V. Volpert (ICJ UMR 5208, Lyon).
Projet ANUBIS, INRIA Futurs (de 2004 `a 2006).
.Titre : Outils de l’automatique pour le Calcul Scientifique, Mod`eles et M´ethodes en
Bio-Math´ematique.
.Responsable du projet : Jacques Henry (Directeur de Recherche, INRIA).
Action Int´egr´ee Brˆancusi n◦08810RJ (2005 et 2006).
Partenaires : LMA de l’universit´e de Pau / D´epartement de Math´ematiques, universit´e Poly-
technique de Bucarest (Roumanie)
.Titre : Stabilit´e, bifurcation et contrˆole pour des ´equations diff´erentielles `a retard issues
de mod`eles biologiques.
.Responsable du projet : Mostafa Adimy (Maˆıtre de Conf´erences HDR, Pau).
Convention internationale du CNRS (2005).
Partenaires : LMA de l’universit´e de Pau / Laboratoire des Processus Stochastiques et des
Syst`emes Dynamiques de l’universit´e de Marrakech (Maroc).
.Titre : Etude des ´equations diff´erentielles `a retard en dimension finie et infinie et
applications `a des mod`eles de dynamique de populations.
.Responsable du projet : Mostafa Adimy (Maˆıtre de Conf´erences HDR, Pau).
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Encadrement de Post-Docs, Th`eses et Stages de M2
Encadrement de Post-Docs
Xuefeng Gao
PhD de University College Cork (supervisors : Sabin Tabirca and Mark Tangney)
Post-Doc sur contrat ANR PrediVac, d’avril 2014 `a octobre 2015.
Sotiris Prokopiou
PhD de Nottingham University (supervisors : Helen Byrne and Markus Owen)
Post-Doc sur contrat ANR PrediVac, d’avril 2013 `a f´evrier 2014.
Floriane Lignet
PhD de l’ENS de Lyon (supervisors : Emmanuel Grenier et Benjamin Ribba)
Post-Doc sur contrat ANR PrediVac, de f´evrier 2013 `a janvier 2014.
Encadrement de Th`eses
Ronan Duchesne
Th`ese d´ebut´ee en septembre 2016, sur le th`eme : ”Vers un mod`ele multi-´echelle de la
diff´erenciation cellulaire : application `a la diff´erenciation ´erythrocytaire”
Direction : Olivier Gandrillon (DR CNRS), Fabien Crauste.
Simon Girel
Th`ese d´ebut´ee en septembre 2015, sur le th`eme : ”Contribution `a la mod´elisation multi-
´echelles de la r´eponse immunitaire : Analyse d’´equations aux d´eriv´ees partielles et
identifiabilit´e param´etrique”
Direction : Fabien Crauste.
Marine Jacquier
Th`ese soutenue le 5 f´evrier 2016, sur le th`eme : ”Contribution `a l’´etude de mod´eles `a
retards mod´elisant l’impact physiologique du comportement de prise alimentaire”
Direction : Fabien Crauste, Hedi Soula (MCH INSA Lyon), Mostafa Adimy (DR Inria).
Emmanuelle Terry
Th`ese soutenue le 12 novembre 2012, sur le th`eme ”Mod´elisation math´ematique des
dynamiques de la r´eponse immunitaire T CD8, aux ´echelles mol´eculaire et cellulaire”
Direction : Fabien Crauste, Olivier Gandrillon (DR CNRS).
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