Proposition de stage M1 / ingénieur 2011 Programmation d

Proposition de stage M1 / ing´ enieur 2011
Programmation d’une interface Java pour un mod`ele de
transmission de la tremblante dans un troupeau ovin
Contact : Suzanne Touzeau
UR341 Math´ematiques et Informatique Appliqu´ees,
INRA, F-78352 Jouy-en-Josas Cedex
T´el. : 01.34.65.22.38
[e-mail]
Descriptif
Le tremblante est une enc´ephalopathie spongiforme transmissible, ou maladie `a prions , qui
touche les ovins et les caprins. C’est une maladie neuro-g´en´erative `a issue fatale, qui entraˆıne des
pertes importantes dans les troupeaux et qui fait l’objet de mesures r`eglementaires d’´eradication.
Nous nous int´eressons `a sa propagation dans un troupeau ovin. Nous avons pour cela d´evelopp´e en
Java un mod`ele individu-centr´e qui reprend les caract´eristiques principales des animaux (ˆage, g´enotype,
´etat ´epid´emiologique, etc.) et d´ecrit leurs interactions, en particulier les processus ´epid´emiologiques de
contamination et d’incubation de la maladie [1]. Le code existant est dot´e d’une interface que nous
souhaiterions enti`erement revoir.
Les objectifs de ce stage sont de :
1. prendre en main le mod`ele et le code Java existants ;
2. d´evelopper une nouvelle interface, selon un cahier des charges pr´ecis ;
3. r´ediger une documentation technique sur le code d´evelopp´e.
Profil et pr´e-requis
– Profil ing´enieur ou universitaire niveau M1 en informatique ou ing´enierie math´ematique.
– Maˆıtrise du langage Java, avec si possible une exp´erience de programmation d’interface.
Pratique
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Equipe d’accueil Le stage aura lieu dans l’unit´e Math´ematiques et Informatique Appliqu´ees de
l’INRA Jouy-en-Josas. http://www.jouy.inra.fr/mia
Dur´ee 3 mois, d´emarrage `a partir de mi-avril 2011 (selon cursus).
R´emun´eration Stage r´emun´er´e ca. 400e/mois.
Possibilit´e de logement sur place (loyer raisonnable), sous r´eserve de disponibilit´e.
Restaurant d’entreprise, ouvert en semaine pour les repas de midi.
[1] Ziyadi, N., Touzeau, S., Bidot, C., Treuil, J.-P., and Hbid, M. L., 2008. Mod`ele individu-centr´e de
transmission de la tremblante dans un troupeau ovin. Rapport technique 2008-4, INRA, UR341 Math´ema-
tiques et Informatique Appliqu´ees (F-78350 Jouy-en-Josas, France).
http://www.inra.fr/miaj/public/nosdoc/rap2008-4.pdf.