UE 2V424 - Licence SdV

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U.E.!2V424!
APPROCHES!EXPERIMENTALES!EN!MICROBIOLOGIE!
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− Responsables!de!l’U.E.!:!Houssain!BENABDELHAK!(houssain.benabdel[email protected]),!Bruno!DASSY!(b[email protected])!
− Nature!de!l’U.E!:!complémentaire!!
− Semestre!où!l’enseignement!est!proposé!:!S4!
− Nombre!d’ECTS!:!3!ECTS!
− Nombre!d’heures!de!cours!:!6!heures!
− Nombre!d’heures!de!TD!:!aucun!TD!
− Nombre!d’heures!de!TP!:!24!heures!
− Evaluation!:!comptes-rendus!de!TP!(100%)!
− Capacité!d’accueil!:!80!étudiants!
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Enseignement!des!pratiques!expérimentales!de!base!en!microbiologie.!
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!a)!Objectifs!de!l'Unité!d'Enseignement!
Le! module! s’adresse! à! tous! les! étudiants! souhaitant! acquérir! des! connaissances! sur! les! principales! techniques! de! manipulation!des!
microorganismes.!L'enseignement!est! organisé! autour! de! séances! de! travaux! pratiques,! accompagnées! des! cours! de! 30! minutes!par! sujet!
permettant! d'introduire! les! principales! notions! de! microbiologie.! Les! étudiants! appréhenderont! les! bases! de! manipulations! de! divers!
microorganismes!incluant!plusieurs! espèces!utilisées!comme! modèles! dans!les! laboratoires!de!recherche! :!les!bactéries!Escherichia)coli!et!
Staphylococcus)epidermidis,! l'archée!halophile!Haloferax)volcanii,!la! levure!Saccharomyces)cerevisiae.!Les! étudiants! pourront!aussi!acquérir!
des!notions!de!base!indispensables!pour!toutes!les!disciplines!de!la!biologie!impliquant!la!manipulation!des!microorganismes.!Les!étudiants!
seront! également! amenés! à! identifier! plusieurs! microorganismes! provenant! d'échantillons! de! sol,! de! prélèvement! d’eau! ou! d’autres!
environnements.!Ils!réaliseront!quelques!expériences!de!biologie!moléculaire,!notamment!l'amplification!par!PCR!des!gènes!codant!les!ARNr!
16S!chez!plusieurs!espèces.!Les!bactériophages!(virus!de!bactéries)!font!également!partie!des!modèles!biologiques!abordés!dans!cette!UE,!ce!
qui!permettra!d'aborder!les!diverses!problématiques!et!expérimentations!liées!à!l'utilisation!et!l'étude!des!virus.)
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!b)!Thèmes!abordés!!
• Les!milieux!de!culture!:!de!la!fabrication!à!l’isolement!des!microorganismes.!
• Les! méthodes! classiques! d’identification! des! microorganismes! :! croissance,! observation! au! microscope,! colorations! diverses! (e.g.!
Gram),!milieux!sélectifs.!
• Courbe!de!croissance!et!temps!de!génération!de!plusieurs!microorganismes.!
• Les! microorganismes! de! notre! environnement!:! isolement,! caractérisation! et! représentation!dans! différents! écosystèmes.! L’homme!
comme!porteur!des!microorganismes.!!
• Identification!des!bactéries!et!des!archées!par!l'approche!de!PCR!appliquée!à!la!séquence!codant!pour!l'ARNr!16S.!
• Antibiotiques! :! visualisation! de! leur! action! au! cours! de! la! croissance!;! antibiogrammes!;! antibiotiques! bactéricides! et/ou!
bactériostatiques.!
• Les! bases! de! l'expérimentation! en! virologie! :! titrage! d’un! bactériophage!;! lyse! des! bactéries! en! culture! liquide! et! solides! (plages! de!
lyse).!Notions!de!prophages!et!lysogénie!et!étude!des!conditions!et!des!conséquences!d’induction!d’un!prophage!chez!E.)coli.!
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!c)!Connaissances!et!compétences!attendues!
Acquisition!des!connaissances!des!principales!techniques!de!manipulation!des!microorganismes!et!bactériophages.!Formation!du!socle!de!
connaissance!sur!les!notions!et!les!principes!de!base!de!microbiologie.!Initiation!à!la!virologie.!Initiation!à!la!microbiologie!expérimentale,!
capacité!à!réaliser!des!expériences!simples!avec!des!microorganismes!modèles.!
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! d)!Organisation!pratique!
Le!module!fonctionnera!sur!5!semaines!à!raison!de!6!heures!d’enseignements!par!semaine.!La!nature!des!expériences!proposées!nécessite!
des!séances!d’une!demi-journée!(3-4!h!par!jour)!sur!2!jours!consécutifs!durant!chaque!semaine!de!fonctionnement!de!l’UE!(e.g.!jeudi!matin!et!
SDV
Sciences de la Vie

vendredi! après-midi).! Le! module! peut! accueillir! au! maximum! 5! groupes! (3! puis! 2)!de! 16! étudiants! pour!être! répété! sur! deux!blocs! de! 5!
semaines.!chacun.!Le!nombre!total!d’étudiants!se!limite!donc!à!80!inscrits.!