UE 2V424 - Licence SdV
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U.E.2V424 SDV Sciences de la Vie APPROCHESEXPERIMENTALESENMICROBIOLOGIE − Responsablesdel’U.E.:HoussainBENABDELHAK([email protected]),BrunoDASSY([email protected]) − Naturedel’U.E:complémentaire − Semestreoùl’enseignementestproposé:S4 − Nombred’ECTS:3ECTS − Nombred’heuresdecours:6heures − Nombred’heuresdeTD:aucunTD − Nombred’heuresdeTP:24heures − Evaluation:comptes-rendusdeTP(100%) − Capacitéd’accueil:80étudiants Enseignementdespratiquesexpérimentalesdebaseenmicrobiologie. a)Objectifsdel'Unitéd'Enseignement Le module s’adresse à tous les étudiants souhaitant acquérir des connaissances sur les principales techniques de manipulation des microorganismes. L'enseignement est organisé autour de séances de travaux pratiques, accompagnées des cours de 30 minutes par sujet permettant d'introduire les principales notions de microbiologie. Les étudiants appréhenderont les bases de manipulations de divers microorganismes incluant plusieurs espèces utilisées comme modèles dans les laboratoires de recherche : les bactéries Escherichiacoli et Staphylococcusepidermidis, l'archée halophile Haloferaxvolcanii, la levure Saccharomycescerevisiae. Les étudiants pourront aussi acquérir desnotionsdebaseindispensablespourtouteslesdisciplinesdelabiologieimpliquantlamanipulationdesmicroorganismes.Lesétudiants seront également amenés à identifier plusieurs microorganismes provenant d'échantillons de sol, de prélèvement d’eau ou d’autres environnements.Ilsréaliserontquelquesexpériencesdebiologiemoléculaire,notammentl'amplificationparPCRdesgènescodantlesARNr 16Schezplusieursespèces.Lesbactériophages(virusdebactéries)fontégalementpartiedesmodèlesbiologiquesabordésdanscetteUE,ce quipermettrad'aborderlesdiversesproblématiquesetexpérimentationsliéesàl'utilisationetl'étudedesvirus. b)Thèmesabordés • Lesmilieuxdeculture:delafabricationàl’isolementdesmicroorganismes. • Les méthodes classiques d’identification des microorganismes : croissance, observation au microscope, colorations diverses (e.g. Gram),milieuxsélectifs. • Courbedecroissanceettempsdegénérationdeplusieursmicroorganismes. • Les microorganismes de notre environnement: isolement, caractérisation et représentation dans différents écosystèmes. L’homme commeporteurdesmicroorganismes. • Identificationdesbactériesetdesarchéesparl'approchedePCRappliquéeàlaséquencecodantpourl'ARNr16S. • Antibiotiques : visualisation de leur action au cours de la croissance; antibiogrammes; antibiotiques bactéricides et/ou bactériostatiques. • Les bases de l'expérimentation en virologie : titrage d’un bactériophage; lyse des bactéries en culture liquide et solides (plages de lyse).Notionsdeprophagesetlysogénieetétudedesconditionsetdesconséquencesd’inductiond’unprophagechezE.coli. c)Connaissancesetcompétencesattendues Acquisition des connaissances des principales techniques de manipulation des microorganismes et bactériophages. Formation du socle de connaissancesurlesnotionsetlesprincipesdebasedemicrobiologie.Initiationàlavirologie.Initiationàlamicrobiologieexpérimentale, capacitéàréaliserdesexpériencessimplesavecdesmicroorganismesmodèles. d)Organisationpratique Lemodulefonctionnerasur5semainesàraisonde6heuresd’enseignementsparsemaine.Lanaturedesexpériencesproposéesnécessite desséancesd’unedemi-journée(3-4hparjour)sur2joursconsécutifsdurantchaquesemainedefonctionnementdel’UE(e.g.jeudimatinet vendredi après-midi). Le module peut accueillir au maximum 5 groupes (3 puis 2) de 16 étudiants pour être répété sur deux blocs de 5 semaines.chacun.Lenombretotald’étudiantsselimitedoncà80inscrits.
