UE 2V424 - Licence SdV

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U.E.2V424
SDV
Sciences de la Vie
APPROCHESEXPERIMENTALESENMICROBIOLOGIE
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Responsablesdel’U.E.:HoussainBENABDELHAK([email protected]),BrunoDASSY([email protected])
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Naturedel’U.E:complémentaire
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Semestreoùl’enseignementestproposé:S4
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Nombred’ECTS:3ECTS
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Nombred’heuresdecours:6heures
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Nombred’heuresdeTD:aucunTD
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Nombred’heuresdeTP:24heures
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Evaluation:comptes-rendusdeTP(100%)
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Capacitéd’accueil:80étudiants
Enseignementdespratiquesexpérimentalesdebaseenmicrobiologie.
a)Objectifsdel'Unitéd'Enseignement
Le module s’adresse à tous les étudiants souhaitant acquérir des connaissances sur les principales techniques de manipulation des
microorganismes. L'enseignement est organisé autour de séances de travaux pratiques, accompagnées des cours de 30 minutes par sujet
permettant d'introduire les principales notions de microbiologie. Les étudiants appréhenderont les bases de manipulations de divers
microorganismes incluant plusieurs espèces utilisées comme modèles dans les laboratoires de recherche : les bactéries Escherichiacoli et
Staphylococcusepidermidis, l'archée halophile Haloferaxvolcanii, la levure Saccharomycescerevisiae. Les étudiants pourront aussi acquérir
desnotionsdebaseindispensablespourtouteslesdisciplinesdelabiologieimpliquantlamanipulationdesmicroorganismes.Lesétudiants
seront également amenés à identifier plusieurs microorganismes provenant d'échantillons de sol, de prélèvement d’eau ou d’autres
environnements.Ilsréaliserontquelquesexpériencesdebiologiemoléculaire,notammentl'amplificationparPCRdesgènescodantlesARNr
16Schezplusieursespèces.Lesbactériophages(virusdebactéries)fontégalementpartiedesmodèlesbiologiquesabordésdanscetteUE,ce
quipermettrad'aborderlesdiversesproblématiquesetexpérimentationsliéesàl'utilisationetl'étudedesvirus.
b)Thèmesabordés
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Lesmilieuxdeculture:delafabricationàl’isolementdesmicroorganismes.
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Les méthodes classiques d’identification des microorganismes : croissance, observation au microscope, colorations diverses (e.g.
Gram),milieuxsélectifs.
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Courbedecroissanceettempsdegénérationdeplusieursmicroorganismes.
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Les microorganismes de notre environnement: isolement, caractérisation et représentation dans différents écosystèmes. L’homme
commeporteurdesmicroorganismes.
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Identificationdesbactériesetdesarchéesparl'approchedePCRappliquéeàlaséquencecodantpourl'ARNr16S.
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Antibiotiques : visualisation de leur action au cours de la croissance; antibiogrammes; antibiotiques bactéricides et/ou
bactériostatiques.
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Les bases de l'expérimentation en virologie : titrage d’un bactériophage; lyse des bactéries en culture liquide et solides (plages de
lyse).Notionsdeprophagesetlysogénieetétudedesconditionsetdesconséquencesd’inductiond’unprophagechezE.coli.
c)Connaissancesetcompétencesattendues
Acquisition des connaissances des principales techniques de manipulation des microorganismes et bactériophages. Formation du socle de
connaissancesurlesnotionsetlesprincipesdebasedemicrobiologie.Initiationàlavirologie.Initiationàlamicrobiologieexpérimentale,
capacitéàréaliserdesexpériencessimplesavecdesmicroorganismesmodèles.
d)Organisationpratique
Lemodulefonctionnerasur5semainesàraisonde6heuresd’enseignementsparsemaine.Lanaturedesexpériencesproposéesnécessite
desséancesd’unedemi-journée(3-4hparjour)sur2joursconsécutifsdurantchaquesemainedefonctionnementdel’UE(e.g.jeudimatinet
vendredi après-midi). Le module peut accueillir au maximum 5 groupes (3 puis 2) de 16 étudiants pour être répété sur deux blocs de 5
semaines.chacun.Lenombretotald’étudiantsselimitedoncà80inscrits.
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