étudiants seront également amenés à identifier plusieurs microorganismes provenant
d'échantillons de sol, de prélèvement d’eau ou d’autres environnements. Les
bactériophages (virus de bactéries) font également partie des modèles biologiques abordés
dans cette UE. Ceci permettra d'aborder les diverses problématiques et expérimentations
liées à l'utilisation et l'étude des virus.
b) Thèmes abordés
Les milieux de culture : de la fabrication à l’isolement des microorganismes.
Les méthodes classiques d’identification des bactéries (croissance, observation au
microscope, galeries biochimiques, colorations diverses (e.g. Gram).
Courbe de croissance et temps de génération chez les bactéries et les archées.
Les microorganismes de notre environnement : isolement, caractérisation et
représentations dans différents écosystèmes. L’homme comme porteur des
microorganismes.
Antibiotiques : visualisation de leur action au cours de la croissance ; antibiogrammes ;
antibiotiques bactéricides et/ou bactériostatiques.
Les bases de l'expérimentation en virologie : titrage d’un bactériophage ; lyse des bactéries
en culture liquide et solides (plages de lyse). Notions de prophages et lysogénie et étude des
conditions et des conséquences d’induction d’un prophage chez E. coli.
c) Connaissances et compétences attendues
Acquisition des connaissances des principales techniques de manipulation des
microorganismes et bactériophages. Formation du socle de connaissance sur les notions et
les principes de base de microbiologie. Initiation à la virologie. Initiation à la microbiologie
expérimentale, capacité à réaliser des expériences simples avec des bactéries modèles.
d) Particularités pédagogiques
Le module fonctionnera sur 3 semaines à raison de 10h d’enseignements par semaine. La
nature des expériences proposées nécessite des séances d’une demie journée (3-4 h par
jour) sur 3 jours consécutifs durant chaque semaine de fonctionnement de l’UE (e.g.
mercredi après-midi, jeudi après-midi et vendredi après-midi). Le module peut accueillir au
maximum 3 à 4 groupes de 20 étudiants et peut éventuellement être répété sur un autre
bloc de 3 semaines. Le nombre total d’étudiants se limite donc à 150 inscrits.