Fiche d`U - Licence SdV

SDV
Sciences de la Vie
Fiche d’U.E. -2V424
APPROCHES EXPERIMENTALES EN MICROBIOLOGIE
-
Responsables de l’U.E.
Guennadi SEZONOV, [email protected]
Bruno DASSY, [email protected]
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Nature de l’U.E :
Complémentaire
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Semestre où l’enseignement est proposé :
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Nombre d’ECTS –
S4
3 ECTS
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Nombre d’heures de cours :
6h de cours
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Nombre d’heures de TD :
0h de TD
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Nombre d’heures de TP :
24h de TP
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Evaluation: (modalités des CDC) –
Comptes rendus (TP) -100%,
Enseignement des pratiques expérimentales de base en microbiologie.
a) Objectifs de l'Unité d'Enseignement
Le module s’adresse à tous les étudiants souhaitant acquérir des connaissances sur les
principales techniques de manipulation des microorganismes. L'enseignement est organisé
autour de séances de travaux pratiques accompagnées des cours permettant d'introduire
les principales notions de microbiologie. Les étudiants appréhenderont les bases de
manipulations de divers microorganismes, essentiellement des bactéries et des archées
incluant plusieurs espèces microbiennes utilisées comme modèles dans des laboratoires de
recherche : Escherichia coli, Bacillus subtilis, Streptomyces, une archée halophile Haloferax
volcanii. Les étudiants pourront aussi acquérir des notions de base indispensables pour
toutes les disciplines de la biologie impliquant la manipulation des microorganismes. Les
étudiants seront également amenés à identifier plusieurs microorganismes provenant
d'échantillons de sol, de prélèvement d’eau ou d’autres environnements. Les
bactériophages (virus de bactéries) font également partie des modèles biologiques abordés
dans cette UE. Ceci permettra d'aborder les diverses problématiques et expérimentations
liées à l'utilisation et l'étude des virus.
b) Thèmes abordés

Les milieux de culture : de la fabrication à l’isolement des microorganismes.

Les méthodes classiques d’identification des bactéries (croissance, observation au
microscope, galeries biochimiques, colorations diverses (e.g. Gram).

Courbe de croissance et temps de génération chez les bactéries et les archées.

Les microorganismes
représentations dans
microorganismes.

Antibiotiques : visualisation de leur action au cours de la croissance ; antibiogrammes ;
antibiotiques bactéricides et/ou bactériostatiques.

Les bases de l'expérimentation en virologie : titrage d’un bactériophage ; lyse des bactéries
en culture liquide et solides (plages de lyse). Notions de prophages et lysogénie et étude des
conditions et des conséquences d’induction d’un prophage chez E. coli.
de notre environnement : isolement, caractérisation et
différents écosystèmes. L’homme comme porteur des
c) Connaissances et compétences attendues

Acquisition des connaissances des principales techniques de manipulation des
microorganismes et bactériophages. Formation du socle de connaissance sur les notions et
les principes de base de microbiologie. Initiation à la virologie. Initiation à la microbiologie
expérimentale, capacité à réaliser des expériences simples avec des bactéries modèles.
d) Particularités pédagogiques

Le module fonctionnera sur 3 semaines à raison de 10h d’enseignements par semaine. La
nature des expériences proposées nécessite des séances d’une demie journée (3-4 h par
jour) sur 3 jours consécutifs durant chaque semaine de fonctionnement de l’UE (e.g.
mercredi après-midi, jeudi après-midi et vendredi après-midi). Le module peut accueillir au
maximum 3 à 4 groupes de 20 étudiants et peut éventuellement être répété sur un autre
bloc de 3 semaines. Le nombre total d’étudiants se limite donc à 150 inscrits.