1ère S – Chap III : La représentation visuelle du monde TP19
Activité 5 : Histoire évolutive des opsines
Toujours dans le même logiciel De Visu, choisissez maintenant le répertoire opsine. On se propose de comparez les
séquences d’ADN (séquences en nucléotides ATGC) des différents types d’opsines. Pour cela, sélectionner dans la
partie du bas le gène d’une opsine. Par un clic droit sur le nom de cette opsine, vous pouvez obtenir le nombre de
différences avec l’opsine située en début de liste. Faite glissez le nombre ainsi obtenu dans le tableau de comparaison
(appelé matrice de distance). Vous pouvez également changer l’ordre des séquences grâce aux flèches situées à côté des
noms d’opsines.
Complétez ainsi l’ensemble du tableau. Lorsque cela est fait, « vérifier la matrice ». Une fois validée, recopiez cette
matrice.
Il s’agit ensuite de reconstituer l’histoire évolutive de ces opsines. On sait aujourd’hui qu’au départ, il n’existait qu’un
seul gène de pigment photorécepteur (le gène ancestral commun) et que, au cours de l’évolution, les gènes des autres
pigments sont apparus mais dans quel ordre ?
Pour reconstituer cet ordre, on partira du principe que plus deux séquences sont différentes, plus elles sont apparus il y a
longtemps l’une par rapport à l’autre. A l’inverse lorsque deux séquences sont proches, cela signifie qu’elles découlent
l’une de l’autre de manière récente. Sur l’arbre situé à droite, déplacez les noms des gènes afin de reconstituer l’histoire.
Lorsque celui-ci est validé, recopiez-le.
Précisez quels types de pigments possédaient les espèces A qui sont apparus au tout début de l’arbre, c'est-à-dire à
l’époque ou seul le gène ancestral devait exister ?
Pour les espèces B apparus à « mi-chemin » de l’arbre ?
Pour les espèces H apparues récemment comme l’Homme ?
Faites une hypothèse quant à la perception des couleurs de chacune ?
Activité 5 : Histoire évolutive des opsines
Toujours dans le même logiciel De Visu, choisissez maintenant le répertoire opsine. On se propose de comparez les
séquences d’ADN (séquences en nucléotides ATGC) des différents types d’opsines. Pour cela, sélectionner dans la
partie du bas le gène d’une opsine. Par un clic droit sur le nom de cette opsine, vous pouvez obtenir le nombre de
différences avec l’opsine située en début de liste. Faite glissez le nombre ainsi obtenu dans le tableau de comparaison
(appelé matrice de distance). Vous pouvez également changer l’ordre des séquences grâce aux flèches situées à côté des
noms d’opsines.
Complétez ainsi l’ensemble du tableau. Lorsque cela est fait, « vérifier la matrice ». Une fois validée, recopiez cette
matrice.
Il s’agit ensuite de reconstituer l’histoire évolutive de ces opsines. On sait aujourd’hui qu’au départ, il n’existait qu’un
seul gène de pigment photorécepteur (le gène ancestral commun) et que, au cours de l’évolution, les gènes des autres
pigments sont apparus mais dans quel ordre ?
Pour reconstituer cet ordre, on partira du principe que plus deux séquences sont différentes, plus elles sont apparus il y a
longtemps l’une par rapport à l’autre. A l’inverse lorsque deux séquences sont proches, cela signifie qu’elles découlent
l’une de l’autre de manière récente. Sur l’arbre situé à droite, déplacez les noms des gènes afin de reconstituer l’histoire.
Lorsque celui-ci est validé, recopiez-le.
Précisez quels types de pigments possédaient les espèces A qui sont apparus au tout début de l’arbre, c'est-à-dire à
l’époque ou seul le gène ancestral devait exister ?
Pour les espèces B apparus à « mi-chemin » de l’arbre ?
Pour les espèces H apparues récemment comme l’Homme ?
Faites une hypothèse quant à la perception des couleurs de chacune ?