La banque UniprotKB et
le logiciel Blast
UniProtKB
•Disponible depuis n’importe quel navigateur web
Un exemple de recherche de protéine
Histoire d’UniProtKB
1986 : SwissProt
+2002 : UniProtKB
Institut Européen
de Bioinformatique Protein
Information
Ressource
Organisation de la banque de données
•Données entrées à la main
•Résultats vérifiés, issus d’articles
scientifiques, références systématiques.
•541000 protéines, +600/mois
45 000 000 protéines
•Données entrées automatiquement,
par analyse informatique de génomes
•Résultats parfois peu fiables
(identification des séquences codantes
automatiques et déductions des
fonctions par comparaison aux
protéines connues)
•44 500 000 protéines, +2M le mois
dernier
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