Partie 1 : le phénotype à l`échelle macroscopique (organisme) Un

TP5
Du génotype au phénotype, étude d’une maladie génétique : la drépanocytose ou anémie falciforme
CORRECTION
Partie 1 : le phénotype à l’échelle macroscopique (organisme)
Un patient vient consulter un médecin :
Il est très fatigué, essoufflé, il
souffre d’infections pulmonaires
chroniques, il est victime de crises
douloureuses très invalidante. Son
oncle maternel présente les mêmes
symptômes.
Le médecin fait un premier
diagnostic de drépanocytose, une
maladie génétique très répandue
dans la zone intertropicale.
Le médecin s’appuie sur le tableau
clinique de la maladie : les
symptômes caractérisent le
phénotype à l’échelle de
l’organisme (macroscopique)
! Remplissez la ligne 1 du tableau : phénotype à l’échelle de l’organisme
- Une anémie chronique : manque de globules rouges qui " fatigue, problèmes pulmonaires
(essoufflement), retard de croissances) et
- Une obstruction des capillaires sanguins " déficits nutritionnels, douleurs, diminution de la fonction
immunitaire (" infections chroniques)
Partie 2 : le phénotype à l’échelle microscopique. (Cellulaire)
Le médecin demande une analyse de sang et un frottis sanguin
Observations :
- déficit en hématies et
hémoglobine (anémie)
- # global en globules
blancs (infections
chroniques)
! Titrez et légendez :
Frottis d’une personne normale
Globules(blancs(
Globules(rouges(
Précision : 3 : chez la personne normale : les GR sont ronds, souples, déformables, tandis que chez la
personne malade des GR sont déformés en forme de faucille, rigides, peu déformables.
Test d’Emmel
Les principes du test
Observation
Résultats +/- ?
Résultat négatif
Les GR conservent leur forme et leurs
propriétés
Résultat positif
Les GR se déforment, en milieu pauvre
en O2. (" obstruction)
Elles peuvent aussi être détruites si
leur déformation a provoqué des
dommages de la membrane ("
anémie)
(résultats du patient)
le diagnostic de drépanocytose se confirme.
! Remplissez la ligne 2 du tableau. : les globules rouges se déforment en forme de faucille ce qui
- provoque une obstruction des capillaires sanguins
- entraîne la destruction et l’élimination de nombreux GR ("anémie)
Partie 3 : le phénotype à l’échelle moléculaire
Les globules rouges sont des cellules qui perdent leur noyau au cours de leur vie, ils sont pauvres en
organites et leur cytoplasme est riche en hémoglobine dissoute.
L’Hémoglobine (Hb) est une protéine complexe constituée de 4 chaînes protéiques (2α et 2ß) chacune
associée à un Hème contenant un atome de fer qui fixe l’O2, de façon réversible assurant ainsi sa fixation
au niveau pulmonaire, son transport dans le sang et sa libération au niveau des cellules.
$ Découvrir l’hémoglobine : http://pedagogie.ac-
toulouse.fr/svt/serveur/lycee/gutjahr/molec3D/molec3d/dossiers/hemoglob_p4.htm
$ choisir « l’hémoglobine la plus fréquente » et utilisez les fonctionnalités pour montrer :
2 chaînes α
2 chaînes ß
associée chacune à un
hème, portant en son centre un
atome de fer
le choix de colorer par acide
aminés montre bien que
chaque chaîne est une séquence
d’acides aminés.(ici, une chaîne
α)
Le médecin demande une électrophorèse de l’Hb du patient, comparé à celle d’une personne normale
(HbA) et malade (HbS)
! Quel est le principe de l’électrophorèse ? (aide page 396) : c’est la séparation des composants d’un
mélange, dans un champs électrique en fonction de la charge électrique. (cette charge dépend, ici,
des acides aminés composants de la protéine)
Electrophorèse HbA/HbS/Patient
! Analysez les résultats. : nous voyons que
HbS et HbA présentent 2 migrations
différentes et l’Hb du patient correspond à
HbS.
! Interprétez-les.
La migration étant différente, on peut en
déduire que HbA et HbS ne présentent pas
la même séquence d’acides aminés : ces 2
protéines sont différentes.
Le patient possède l’HbS .
Pour confirmation de notre hypothèse, nous réalisons un séquençage de la ßglobine
$ En utilisant les fonctionnalités du logiciel anagène, comparer les séquences des 2 ßglobines
Affichage
Comparaison
! Analysez les résultats : on observe 2 séquences différentes, l’AA n°6 (7 si on compte la Met) est
différent : Glu"Val
$ Aller http://pedagogie.ac-
toulouse.fr/svt/serveur/lycee/gutjahr/molec3D/molec3d/dossiers/hemoglob_p4.htm
$ Choisir « constat d’une mutation », « HbA » et utilisez les fonctions pertinentes pour illustrer vos
observations : repérez le début de la protéine, mettez en évidence vos observations en comparant
avec « HbS » : en colorant les traces des protéines et colorant par acide aminé les 10 premiers : on
voit bien une différence de séquence et de forme.
ßglobine A
ßglobineS
Patient
$ choisir « polymérisation Hbs » et mettez en évidence l’implication de l’acide aminé muté.
Image obtenue avec RASTOP :
Les chaînes α : en vert et bleu
Les chaînes ß : en jaune et cyan
En rouge : les Valines mutés qui entraînent une
interaction entre les molécules d’HbS : cette liaison
entraîne la polymérisations des molécules d’HbS,
elles forment des fibres à l’intérieur des GR et les
déforment.
La modification de la séquence de la ßglobine "
modification de forme et de fonction de la protéine :
elle peut établir des liaisons avec les autre Hb qui se
polymérisent entraînant la formation de fibres qui
déforment, voir altèrent les GR, les rendent plus
rigides et plus fragiles
! Remplissez la troisième ligne du tableau.
Partie 4 : le génotype.
Les chaînes de Hb sont codées par des gènes.
La drépanocytose étant une maladie héréditaire,
on suppose une anomalie au niveau génétique.
Le médecin demande un séquençage ADN du
gène de la ßglobine
! En utilisant les fonctionnalités du logiciel
anagène, comparer les séquences des 2
gènes des ßglobines
! Analysez les résultats : on observe une
mutation au niveau du 20° nucléotide :
A"T
Comparaison :
! Interprétez-les : la mutation a " une modification du 7° AA (GAG"Glu alors que GTG "Val)
! Comment nomme-t-on les 2 versions du gène de la ßglobine ? des allèles
! Remplissez la quatrième ligne du tableau : c’est une mutation ponctuelle du gène de la ßglobine qui
a entrainé l’apparition d’un allèle de ce gène, ave une séquence différente. Cet allèle code pour une
protéine modifiée : la ßglobine S
Echelle
génétique
Echelle moléculaire
Echelle cellulaire
Echelle
organisme
Gène de la ß
globine :
Allèle
ß globine
normal
Allèle
ß globine
muté
Une mutation
ponctuelle.
Hémoglobine dissoute GR normaux, ronds, souples déformables,
dans le cytoplasme pouvant circuler normalement dans les
des GR capillaires
ßglobine normale
Phénotype
normal
Phénotype
drépanocytaire
"accidents
vasculaires
" anémie
Hémoglobine en fibres GR déformés en forme de faucille, rigides, peu
polymérisées déformables, ils se coincent dans les capillaire
ß globine mutée " forme et " des obstructions
différente " propriété Ils peuvent être endommagés et détruits
nouvelle
On notera que l’intensité de la maladie est liée à l’environnement : # en milieu pauvre en O2
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