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ACTIVITE 2 : LA CONSTITUTION D’UNE FAMILLE MULTIGENIQUE
Bordas Edition 2011
3. Pourquoi considère-t-on que les gènes des opsines codant pour les pigments rétiniens ont une origine commune ?
4. Présentez sous forme d’un schéma les mécanismes aboutissant à la formation de cette famille multigénique
ACTIVITE 3 : PIGMENTS RETINIENS ET PLACE DE L’HOMME PARMI LES PRIMATES
Comparaison des séquences de l’opsine S de l’Homme et de certains Primates à l’aide d’un logiciel , « Phylogène », permettant de tracer
un arbre phylogénétique
Il s’agit de comparer les séquences des opsines S de l’Homme, du Bonobo, du Chimpanzé, du Gorille, du Macaque, du Cebus et du Saïmiri
(ces deux dernières espèces vivant au niveau du continent sud américain), afin de tracer un arbre établissant les relations de parenté
existant entre ces espèces.
Les opsines S du Cebus, du Saïmiri et du Macaque comportent 349 acides aminés, celles de l’Homme, du Gorille, du Chimpanzé et du
Bonobo, 348.
Le logiciel « Phylogène » , utilisé lors de l’activité 12, permet aussi, de tracer un arbre, dont les branches définissent les parentés entre
les molécules, et par la même, entre les espèces auxquelles elles appartiennent.
Procédure permettant d’établir des relations de parenté :
5. Présenter l’organisation générale commune des Vertébrés (cours de Seconde).
6. Quelles sont les caractéristiques des molécules utilisées pour établir des relations de parenté?
7. Justifier le choix de l’utilisation de l’opsine S pour établir des relations de parenté entre l’Homme et certains Primates.
8. Dans l’échantillon à étudier, citer les Primates dichromates et les Primates trichromates.
9. Relever dans l’ensemble des documents produits grâce au logiciel Phylogène les informations qui permettent de conforter la
place de l’Homme au sein des Primates.
10. Proposez un bilan à l’ensemble du TP
- Pour charger le fichier des molécules d’opsine S
• Fichier
• Ouvrir
• Fichier de molécules
• Archontes (Primates)
• Molécules opsine-Bleu-Primates.
- Pour sélectionner uniquement certaines molécules afin de les
comparer
• Cliquer sur les espèces à conserver : Cebus, Saïmiri, Homme, Gorille,
Bonobo, Chimpanzé et Macaque
• Edition : supprimer les séquences non sélectionnées.
- pour repérer les acides aminés communs aux différentes
séquences :
• Couleur : colorer les séquences
Chaque lettre désigne conventionnellement un acide aminé. Un tiret
signale l’absence d’un acide aminé dans la séquence.
- pour afficher la matrice puis l’arbre, cliquer
successivement sur les boutons Matrice des
distances (options/ pourcentage) puis Arbre
(options/UPGMA).