Ecole Doctorale Chimie et Sciences du Vivant

Sujet de stage de Master 2 Recherche
Année 2009/2010
Laboratoire : Laboratoire des Protéines Membranaires, IBS; Directeur : Eva Pebay-Peyroula
Intitulé de l'équipe : Résistance aux antibiotiques et Responsable : Jean-Michel Jault
nouvelles cibles bactériennes
Nom et qualité du responsable du stage : Jault Jean-Michel, DR2-CNRS HDR oui
Adresse : Institut de Biologie Structurale, UMR 5075 CEA/UJF/CNRS, 41 Rue Jules Horowitz,
38027 Grenoble Cedex 1
Tél : 04 38 78 31 19
email : [email protected]
Spécialité MASTER :
Biologie Cellulaire et Intégrative
ou Biochimie, Biologie Structurale Titre du sujet : La résistance des bactéries aux antibiotiques : étude du mécanisme de
fonctionnement d’un transporteur ABC (“ATP-Binding Cassette”) de multiples drogues
Objectifs recherchés (3 lignes max) :
Comprendre le fonctionnement d’un transporteur de multiples drogues, et identifier les domaines
impliqués dans la fixation des drogues et dans la propagation des changements de conformation
entre le site de fixation de l’ATP et le site des drogues.
Résumé (10 lignes max) :
La multi-résistance des bactéries aux antibiotiques atteint une ampleur inquiétante et les
transporteurs de multiples drogues jouent un rôle majeur dans ce phénomène. Certains
transporteurs utilisent l’énergie fournie par l’hydrolyse de l’ATP (transporteurs ABC pour
“ATP-Binding Cassette”) pour expulser les antibiotiques hors des bactéries. De manière
intéressante, ces transporteurs bactériens sont fortement homologues à des
transporteurs eucaryotes impliqués dans la résistance de certains cancers aux
chimiothérapies (phénotype MDR pour ‘MultiDrug Resistance). Par une approche de
mutagenèse dirigée couplée à la modélisation moléculaire (basée sur des structures
connues de transporteurs homologues), nous cherchons à comprendre le mécanisme
d’action d’un transporteur ABC bactérien de multiples drogues, BmrA (pour “Bacillus
multidrug resistance ATP”).
Approches & matériel utilisés (3 lignes max) :
Surexpression et purification de protéines membranaires ; mutagenèse dirigée ; mesure
des activités de transport, de fixation de nucléotides et d’hydrolyse de l’ATP. Utilisation
des logiciels de visualisation des structures 3-D. Cristallisation 3-D
Publications pertinentes de l'équipe (3 max) :
- Dalmas et al. J. Biol. Chem. (2005) 280, 36857-36864.
- Orelle et al. Biochemistry (2008) 47, 2404-2412.
- Do Cao et al Protein Sci (2009) sous presse.
Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) :
Pour BCI indiquez aussi la sous-spécialité (Biologie Végétale, Développement et Différenciation, Immunologie, Neurosciences,
Physiologie, Microbiologie)
Biochimie, Biologie Moléculaire, Biophysique
Pour BCI, Microbiologie