Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie Sujet de stage de

Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie
Sujet de stage de Master 2 Recherche
Année 2010/2011
Laboratoire : Laboratoire des Protéines Membranaires, IBS Directeur : Eva Pebay-Peyroula
Intitulé de l'équipe : Résistance aux antibiotiques et Responsable : Jean-Michel Jault
nouvelles cibles bactériennes
Nom et qualité du responsable du stage : Jault Jean-Michel, DR2-CNRS HDR
oui
non
Adresse : Institut de Biologie Structurale, 41 Rue Jules Horowitz, 38027 Grenoble Cedex 1
Tél : 04 38 78 31 19
email : [email protected]
Spécialité MASTER :
Biologie Cellulaire et Intégrative
Biodiversité - Ecologie – Environnement
Biochimie, Biologie Structurale
Titre du sujet : Mécanisme de fonctionnement de transporteurs ABC (“ATP-Binding Cassette”) de
multiples drogues : rôle des nucléotides.
Objectifs recherchés (3 lignes max) :
Comprendre pourquoi deux transporteurs ABC de multiples drogues bactériens, l’un homodimérique et
l’autre hétérodimérique, possèdent des spécificités différentes pour les nucléotides.
Résumé (10 lignes max) :
La multi-résistance des bactéries aux antibiotiques atteint une ampleur inquiétante et les transporteurs de
multiples drogues jouent un rôle majeur dans ce phénomène. Certains transporteurs utilisent l’énergie
fournie par l’hydrolyse de l’ATP (transporteurs ABC pour “ATP-Binding Cassette”) pour expulser les
antibiotiques hors des bactéries. Ces transporteurs bactériens sont fortement homologues à des
transporteurs eucaryotes impliqués dans la résistance de cancers aux chimiothérapies (phénotype MDR
pour ‘MultiDrug Resistance). Chez les bactéries, certains transporteurs MDR fonctionnent sous la forme
d’un homodimère et d’autres sous la forme d’un hétérodimère, bien qu’ils soient capables de transporter
des drogues similaires. Par ailleurs, certains semblent utiliser indifféremment l’ATP ou le GTP comme
source d’énergie alors que d’autres seraient spécifiques pour le GTP. Nous chercherons à identifier les
bases moléculaires responsables de cette différence de spécificité.
Approches & matériel utilisés (3 lignes max) :
Surexpression et purification de protéines membranaires ; mutagenèse dirigée ; mesure
des activités de transport, de fixation de nucléotides et d’hydrolyse de l’ATP. Utilisation
des logiciels de visualisation des structures 3-D. Cristallisation 3-D
Publications pertinentes de l'équipe (3 max) :
- Orelle et al. Biochemistry (2008) 47, 2404-2412
- Do Cao et al. Protein Sci (2009)
- Torres et al. BBA-Biomembranes (2009)
Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) :
Pour BCI indiquez aussi la sous-spécialité (Biologie Végétale, Développement et Différenciation, Immunologie, Neurosciences,
Physiologie, Microbiologie)
Biochimie, Biologie Moléculaire,Microbiologie