Le gène MCM6 contrôle la réplication de l’ADN.
La tolérance au lactose chez l’adulte est liée à des mutations situées
dans des introns du gène MCM6.
Le gène de la lactase chez les Vertébrés :
Homologie entre galactosidases :
Dans ce site : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3938 cliquer dans les menus à droite
sur HomoloGene
On obtient la comparaison du gène humain avec ses quatre domaines à ceux
d’autres Vertébrés.
Le gène présentant quatre domaines est conservé chez les Vertébrés.
http://h-invitational.jp/evola_main/atv.cgi?hit=HIT000321293
Autre arbre phylogénique
Certaines bactéries possèdent la capacité à hydrolyser le lactose :
La beta galactosidase d’Ecoli : modèle moléculaire
1JYN sur protein data (recherche sur google ouvrir le premier site
proposé RCBS…)
Télécharger la molécule pour l’utiliser dans rastop : cliquer sur
download files puis pdb file (gz). L’enregistrer dans un dossier qu’on
pourra ouvrir avec rastop.
La molécule présente quatre sous-unités.
Le lactose figure dans ce modèle. On peut le colorer et lui donner une forme en boules par
exemple pour bien le distinguer de la protéine.
Site de la béta-galactosidase d’Ecoli
http://www.uniprot.org/uniprot/P00722
Travail sur le site actif :
Chercher dans ce site les numéros des acides aminés du site actif. Les repérer dans la protéine
afficher dans rastop (1JYN). On aura au préalable identifié le lactose (couleur et boules).
Pour sélectionner directement les numéros d’AA : ctrlE et indiquer le numéro puis colorer et
mettre en bâtonnets. Différencier les aa de fixation (binding site) des aa catalytiques (active
site). C’est le Glu 537 qui est l’acide aminé essentiel de l’hydrolyse du lactose.
Attention, dans la séquence l’acide aminé Met est le numéro 1, alors qu’il n’est pas
comptabilisé dans le modèle 3d. Il faut donc enlever 1 à chaque numéro d’acide aminé pour
faire la mise en évidence du site actif avec rastop.
Les acides aminés du site actif sont autour du lactose. Les deux acides aminés
catalytiques sont des acides glutamiques