A. Les micro-organismes du sol
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Ecologie microbienne Cours de microbiologie 2nde CSS / M. Mercier -1- Ecologie microbienne Séance 1 : Les milieux de vie des micro-organismes Objectifs 1. Énoncer les flores présentes dans le sol, l’eau, l’air les aliments 2. énoncer le rôle de ces différentes flores A. Les micro-organismes du sol Le rôle fondamental des micro-organismes présents dans le sol est le recyclage de la matière organique. Les bactéries présentes dans le sol assurent sa fertilisation. Le sol est peuplé de 3 sortes de flores spécialisées : la flore de décomposition : constituée de bactéries et de champignons permet la transformation de la matière organique morte (ex : débris de végétaux) en humus qui fertilise les sols Débris de végétaux (feuilles mortes, brindilles), cadavres d’animaux Forment la litière HUMUS La flore de minéralisation : constituée surtout de bactéries, transforme l’humus en éléments minéraux simples, en particulier en nitrates assimilés par les plantes pour leur croissance. HUMUS NITRATES La flore fixatrice d’azote atmosphérique : les racines des légumineuses (trèfle, soja,…) présentent au niveau de leurs racines des nodosités qui contiennent des bactéries capables de fixer le diazote de l’air et de le transformer en nitrates assimilables par les plantes DIAZOTE de l’air NITRATES B. Les micro-organismes de l’eau : La flore des eaux est composée de protozoaires, d’algues de mycètes, de bactéries qui font partie du plancton et de virus. Ces micro-organismes permettent l’autoépuration des eaux en éliminant la pollution naturelle grâce à la décomposition permanente des matières organiques présentes en ions minéraux. CHAINE ALIMENTAIRE : Cellules mortes provenant de cadavres animaux et végétaux, de déchets organiques Substances organiques Alimentation des animaux plus gros carnivores Alimentation des petits animaux aquatiques herbivores Ions minéraux Assimilation par les algues et plantes aquatiques Ecologie microbienne Cours de microbiologie 2nde CSS / M. Mercier -2- C. Les micro-organismes de l’air L’air n’est pas un milieu favorable à la multiplication microbienne. L’air joue le rôle de transporteur (de vecteur) dans la transmission de certains microorganismes. Les micro-organismes sont véhiculés par les poussières et les microgouttelettes. On rencontre le plus souvent des bactéries et des mycètes. D. Les micro-organismes des aliments De nombreux micro-organismes sont présents sur les aliments frais (viande, poisson, lait, fruits et légumes…) ils représentent la flore alimentaire. La flore alimentaire est composée de : La flore d’altération La flore utile a) La flore d’altération : Certains micro-organismes, sans danger pour le consommateur, modifient l’aspect et les qualités organoleptiques (goût, odeur…) de l’aliment. Ils sont responsables de la décomposition de l’aliment. Ex : le pain moisit, le poisson prend une odeur d’ammoniaque, les fruits et légumes ramollissent… Des micro-organismes pathogènes peuvent aussi coloniser les aliments. Ils peuvent se multiplier dans l’organisme et provoquer des troubles. Il s’agit d’une MIA : maladie infectieuse alimentaire (gastro-entérite à salmonelle, hépatite A, …) Ils peuvent fabriquer une toxine dans l’aliment. Cette toxine va être responsable des troubles qui se manifestent. Il s’agit d’une TIA : toxi-infection alimentaire (listériose, botulisme…) b) La flore utile : Certains micro-organismes permettent d’obtenir des produits alimentaires tels que les yaourts, les fromages, le vin, le cidre, la bière, le pain, le saucisson sec… Les micro-organismes sont introduits dans l’aliment de départ, l’aliment est alors placé dans des conditions particulières (température, teneur en eau, pH, présence d’air ou non…) il acquiert alors des propriétés organoleptiques nouvelles grâce à la multiplication microbienne. Ce sont des bactéries ou des champignons qui assurent ce processus de transformation appelé fermentation Lactose du lait Lactobacillus bulgaricus, Streptococcus thermophilus Exemple : la fermentation lactique : Acide lactique (yaourt, choucroute…) Ecologie microbienne Cours de microbiologie 2nde CSS / M. Mercier -3- Ecologie microbienne Séance 2 : Les relations des micro-organismes avec leurs milieux de vie Objectif général: Présenter les relations des micro-organismes avec leurs milieux de vie objectif 1 : énoncer les différentes relations possibles d’un micro-organisme avec son milieu il existe plusieurs types de relations entre un micro-organisme et son milieu : Le saprophytisme, La symbiose Le parasitisme Le commensalisme Objectif 2 définir les différentes relations des micro-organismes avec leur milieu Le saprophytisme : La symbiose : Le parasitisme : Le commensalisme
