Ecologie microbienne
Chapitre 1 : milieux de vie et relations avec ces milieux
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Chapitre 1 : milieux de vie et relation avec ces milieux.
Les micro-organismes sont présents partout : dans le sol, dans l’air, dans leau, dans les aliments,
dans les organismes vivants animaux et végétaux, sur les surfaces
Flore microbienne : ensemble des micro-organismes présents dans un milieu
Milieu
Composition de la flore
Rôle ou effet
Océans
Plancton : c’est la population microscopique
aquatique. Il comprend une grande variété de micro-
organismes (bactéries, algues protozoaires et
levures) mais aussi d’autres organismes comme de
minuscules méduses ou des larves.
Quand la population de plancton est à
prédominance dalgues, on parle de phytoplancton.
Si les protozoaires sont majoritaires, on parle de
zooplancton
Fertilisation des océans
Alimentation de la faune -
Eaux
douces
Bactéries
Protozoaires
algues
élimination des déchets et
de la pollution naturelle
alimentation des vairons et
petits poissons
Sol
La flore microbienne tellurique est très variée et
comprends des bactéries, des champignons, des
algues, des protozoaires, des virus.
Décomposition d’animaux et
de végétaux morts pour
former l’humus.
Fertilisation des sols grâce à
la production de sels
minéraux.
air
- air extérieur : bactéries et champignons plus
nombreux en été, dans les villes et à la surface des
eaux usées
- air confiné (hôpitaux, usines…) : très contaminé
par des micro-organismes qui sont transportés par
des poussières, des gouttes d’expectoration, la
vapeur d’eau.
Responsables d’infections,
dallergies.
1. Les micro-organismes du sol.
Dans le sol, deux flores bactériennes transforment la matière organique :
Les bactéries de la flore de décomposition produisent de lhumus à partir de cadavres
d’animaux et de débris végétaux. L’humus est précieux pour le sol car il retient l’eau et les sels
minéraux nécessaires à la croissance des plantes.
Les bactéries de la flore de minéralisation transforment lhumus en sels minéraux (nitrates)
assimilables par la plante.
2. Les micro-organismes de leau
Ils assurent la décomposition et la minéralisation des matières organiques polluantes. Cette propriété
des eaux de surface est appelée l’autoépuration
Objectif 1 : indiquer les différents milieux de vie des micro-organismes
Objectif 2 : classer les différentes flores du milieu naturel
Objectif 3 : indiquer le rôle des micro-organismes de l’eau et du sol dans le recyclage de la
matière.
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Chapitre 1 : milieux de vie et relations avec ces milieux
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Il existe plusieurs types de relations entre un micro-organisme et un hôte.
Le commensalisme est le mode de vie d’un micro-organisme vivant avec son hôte sans lui nuire.
Une bactérie commensale est une bactérie qui est hébergée dans l’organisme et qui ne cause pas de
troubles. Les bactéries commensales sont présentes sur notre peau, dans notre intestin, dans le
vagin, la bouche, le pharynx.
Exemples : streptocoques, staphylocoques dans la bouche, lactobacilles dans le vagin, coliformes
dans l’intestin…
La symbiose est le mode de vie dun micro-organisme vivant avec un hôte, chacun tirant des
avantages de l’association.
Une bactérie symbiotique est hébergée dans un organisme vivant, elle y trouve refuge et y est utile.
exemple : les bactéries de la panse des vaches : ces micro-organismes trouvent là un refuge idéal
pour proliférer, mais, «en échange», réalisent la digestion des végétaux et alimentent ainsi la vache
en sucres.
Le saprophytisme est le mode de vie d’un micro-organisme vivant dans le milieu naturel et n’étant
pas associé à un autre organisme vivant.
Une bactérie saprophyte vit sur des matières en décomposition.
Exemple : les bactéries de la putréfaction décomposent les cadavres, les aliments
Le parasitisme est le mode de vie d’un micro-organisme qui vit et se nourrit aux dépens de son hôte.
Il est parasite, et de plus pathogène lorsqu’il nuit à l’hôte. c’est un mode de relation déséquilibré : seul
le parasite tire profit de l’association.
La plupart des micro-organismes pathogènes pour l’homme ou l’animal sont des parasites.
Exemple : le plasmodium responsable du paludisme, le toxoplasme responsable de la
toxoplasmose
Objectif 4 :
finir symbiose, parasitisme, saprophytisme et commensalisme
Citer un exemple de micro-organisme pour chaque définition en précisant leffet bénéfique
ou néfaste.
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1. les micro-organismes utiles :
Les bactéries lactiques provoquent la fermentation lactique, grâce à laquelle on peut faire du
fromage et des yaourts, la choucroute, le saucisson sec
les acétobactéries transforment l’alcool en acide acétique, substance essentielle du vinaigre.
Les moisissures utilisées pour la réalisation des fromages. Chaque fromage est produit par une
flore qui lui est propre, lui donnant sa texture et son goût : penicillium roqueforti dans le roquefort,
penicillium camemberti,candidum dans le camembert
La levure de bière transforme lamidon en alcool et en gaz carbonique (fermentation alcoolique),
elle permet la levée de la pâte à pain, la fabrication de la bière...
2. Les micro-organismes altérant les aliments :
Levures et moisissures responsables du pourrissement des fruits et légumes.
Bactéries provoquant le rancissement du beurre
Bactéries provoquant le ramollissement, l’acidification des fruits et légumes voir TD
3. Les micro-organismes responsables de maladies lorsquils sont dans les aliments
Salmonella enteritidis : ce sont des entérobactéries, c’est à dire des bactéries présentes dans
l’intestin. Lorsquelles se retrouvent dans un aliment elles provoquent une toxi-infection
alimentaire : gastro-entérite se manifestant par une diarrhée, des douleurs intestinales,
vomissements, frissons, fièvre.
Staphylocoques dorés : ils produisent des toxines dans l’aliment. Ils provoquent des toxi-infections
1 à 4 heures après l’ingestion : douleurs abdominales, vomissements, diarrhée, maux de tête
Clostridium perfringens : répandu dans la nature, il devient pathogène quand il se multiplie dans
laliment. La toxi-infection résulte le plus souvent de la prolifération du germe dans de la viande
cuite laissée à refroidir lentement.
Objectif 5 : indiquer le rôle des micro-organismes sur ou dans les aliments.
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