Inventaire des champignons endophytes des feuilles de Pistacia

REPUBLIQUE ALGERIENNE DEMOCRATIQUE ET POPULAIRE
MINISTERE DE L’ENSEIGNEMENT SUPERIEUR ET DE LA RECHERCHE
SCIENTIFIQUE
UNIVERSITE MOULOUD MAMMERI DE TIZI OUZOU
FACULTE DES SCIENCES BIOLOGIQUES ET DES SCIENCES AGRONOMIQUES
DEPARTEMENT DES SCIENCES BIOLOGIQUES
MEMOIRE DE MAGISTER
Spécialité : Sciences Biologiques
Option: Ecologie Végétale Appliquée et Gestion de l’Environnement
THEME
Présenté par : Melle BENFODDIL Ouiza
Le : 03 / 10 / 2015
Devant le jury composé de :
Mr HOUALI K. Professeur à l’Université Mouloud Mammeri de Tizi-Ouzou Président
Mme SMAIL-SAADOUN N. Professeur à l’Université Mouloud Mammeri de Tizi-Ouzou Promotrice
Mme BELHADJ S. Professeur à l’Université de Ziane Achour de Djelfa Examinatrice
Mr MEDDOUR R. MCA à l’Université Mouloud Mammeri de Tizi-Ouzou Examinateur
2014/2015
Inventaire des champignons endophytes des feuilles
de Pistacia atlantica Desf. de dayate El Gouffa
(Laghouat, Algérie).

Remerciements
Mes sincères remerciements sont à Madame SMAIL-SAADOUN Noria
(Professeur à l’UMMTO), pour m’avoir encadré pendant mon mémoire de
Magister. Merci aussi pour les précieuses informations, votre disponibilité et
votre compréhension. Merci d’avoir pris le temps de corriger et m’aider à
finaliser ce travail.
Je remercier aussi Monsieur HOUALI K. d’avoir accepté de présider le
jury de soutenance et d’examiner mon travail.
Mme BELHADJ S., Mr MEDDOUR R. qui ont accepté de faire partie du
jury afin d’examiner ce travail. Qu’ils en soient remerciés.
Je remercie aussi le personnel du laboratoire « Ressources Naturelles » de
l’université Mouloud Mammeri de Tizi-Ouzou, où j’ai effectué mon mémoire.
Je remercie également Melle. MECHIAH F ; ZAREB A et Monsieur
HAMITOUCHE pour leur soutien et le partage du savoir et des informations.

Table des matières
Liste des figures
Liste des tableaux
Introduction générale……………………………………………………………………………...1
Chapitre 1 : Mycoendophytes…………………………………………………………………...4
1. Introduction…………………………………………………………………………………...4
2. Origine et évolution…………………………………………………………………………..5
3. Reproduction et transmission…………………………………………………………….......5
4. Taxonomie et diversité des mycoendophytes …………………………………………..........6
4.1. Clavicipitaceae (C)………………………………………………………………………….10
4.2. Non Clavicipitaceae (NC)…………………………………………………………………...11
4.2.1. Classe 2 …………………………………………………………………...………............11
4.2.2. Classe 3……………………………………………………………………...….................11
4.2.3. Classe 4……………………………………………………………………………............21
5. Facteurs influençant la diversité des mycoendophytes…………...……………………........21
6. Interactions entre la plante hôte et les mycoendophytes……………………………………23
7. Rôles des mycoendophytes…………………………………………………………….........26
7.1. Rôles écologiques…………………………………………………………………………...27
7.2. Champignons producteurs de métabolites biologiquement actifs ………………….............29
7.3. Producteurs de phytohormones…………………………………………...…………….......32
8. Conclusion…………………………………………………………………………………..33
Chapitre 2 : Description de la feuille………………………………………………………….33
1. Introduction…………………………………………………………………………………33
2. Morphologie externe …………………………………………………….…………………..33
2.1. Limbe………………………………………………………………………………………..34
2.2. Pétiole…………………………………………...………………………………………......36
3. Organisation anatomique……………………………………………………...…………........36
3.1. Epiderme …………………………………………………………………...……….............37

3.1.1. Cuticule…………………………………………………..………………………..............38
3.1.2. Stomates………………………………………………...…………………………………39
3.1.3. Trichomes…………………………………………………………………………............40
3.2. Mésophylle…………………………………………………………………………………..44
3.3. Système vasculaire…………………………………………………………………………..46
Chapitre 3 : Matériels et Méthodes …………………………………………………………...48
1. Description de la zone d’étude…………………………………………………………..........48
1.1. Situation géographique…………………………………………………………………..48
1.2. Bioclimat……………………………………………………………………………........49
2. Echantillonnage sur terrain………………………………………………………………….52
3. Stérilisation superficielle……………………………………………………………………...54
4. Coloration des feuilles………………………………………………………………………..55
5. Mise en culture des feuilles…………………………………………………………………...55
6. Identification des isolats fongiques…………………………………………………………...56
6.1. Identification macroscopique………………………………………………………………..57
6.2. Identification microscopique………………………………………………………………..57
7. Analyse statistique……………………………………………………………………………58
Chapitre 4 : Résultats et discussion………………………………………………………........59
1. Mise en évidence des mycoendophytes………………………………………………………59
1.1. Colonisation des tissus foliaires par les champignons endophytes………………………….59
1.2. Inventaire des champignons endophytes présents…………………………………………..66
1.2.1. Diversité et abondance de l’ensemble des mycoendophytes recensés…………………...66
1.2.2. Diversité et abondance des mycoendophytes par classe d’âge des arbres……………….72
1.2.3. Diversité et abondance des mycoendophytes selon les sujets échantillonnés de Pistacia
atlantica Desf. au niveau spécifique……………………………………………………………..73
1.3. Discussion générale……………………………………………………………………........90
2. Fréquence de colonisation…………………………………………………………………102
2.1. Résultats………………………………………………………………………………...102
2.1.1. Fréquence moyenne de colonisation par rapport aux organes de l’ensemble des
sujets……………………………………………………………………………………………102
2.1.2. Fréquence de colonisation des sujets immatures ………………………………………105
2.1.3. Fréquence de colonisation des sujets moyens……………………………………….107

2.1.4. Fréquence de colonisation des sujets de la nebkhas…………………………………..109
2.1.5. Fréquence de colonisation des sujets âgés…………………………………………..110
2.1.6. Fréquence de colonisation pour les sujets par classe d’âge…………………………….112
2.2. Discussion générale…………………………………………………………………..........115
Conclusion générale et perspectives ……………………………………………………........118
Références bibliographiques………………………………………………………………….121
Résumé
Annexes