Problèmes prép CHM1007 intraI solution

SOLUTIONNAIRE
Problèmes préparatoires à l'examen intratrimestriel I
CHM-1007 Biochimie
Hiver 2011
1. Les substances chimiques qui se dissolvent rapidement dans l'eau sont dites
hydrophiles. Celles qui ne se dissolvent pas ou qui "craignent" l'eau sont dites
hydrophobes. Les composés qui possèdent ces deux propriétés sont dites
amphiphiles.
2. Quel élément parmi la liste suivante n'est pas essentiel à la vie?
A. Carbone
B. Oxygène
C. Rubidium XXXX
D. Soufre
E. Phosphore
F. Zinc
3. Les procaryotes ou bactéries sont des organismes unicellulaires. Les plantes
et les levures sont constituées de cellules eucaryaotes.
4. Sur la figure suivante d'une cellule procaryotes, identifiez les différentes
éléments:
Ribosomes ____E______
Nucléoïde ____A______
Membrane cellulaire____C____
Cytoplasme _____D_____
Paroi cellulaire ____B______
Flagelles ______F____
6. Les acides aminés L sont les constituants des protéines. Donnez le nom de
l'acide aminé qui correspond à chacune des descriptions ci-dessous:
A. L'acide aminé qui n'a pas de chaîne latérale: glycine
B. Le seul acide aminé qui n'a pas d'hydrogène sur le carbone alpha proline
C. L'acide aminé contenant une chaîne hydrophobe de 4 carbones et ayant deux
méthyle à l'extrémité: leucine
D. L'acide aminé qui un groupe acide ayant un pKa de 6: histidine
E. Le seul acide aminé avec une structure bicyclique: tryptophane
7. Déterminez quel acide aminé possède la courbe de titrage suivante:
A.
B.
C.
D.
E.
Tyrosine XXX
Aspartate
Cysteine
Glycine
Lysine
8. Les acides aminés sont liés entre eux par un lien peptidique. Ce lien est
formé par la condensation de deux acides aminés et résulte en la perte d'une
d'une molécule d'eau.
9. Dans une protéine, les acides aminés ou résidus sont notés par convention du
groupe N-terminal au groupe C-terminal. La masse des protéines est rapportée
en Dalton plutôt qu'en grammes.
10. Au sujet de la liaison peptidique, quel énoncé est vrai:
A. Il est plan
B. Il a un fort caractère de double liaison
C. Il est rigide
D. Il adopte surtout une conformation trans
E. Toutes ces réponses XXX
11. Au sujet des hélice alpha, parmi les énoncés suivants, lequel est vrai?
A. Elles sont stabilisées par des liens H entre un résidus n et celui placé à n+4
B. Les acides aminés L favorisent les hélices de pas droit
C. La proline brise les hélices
D. Elles contiennet 3,6 résidus par tour
E. Toutes ces réponses XXX
12. Au sujet des feuillets ß, parmi les énoncés suivants, lequel est vrai?
A. Les feuillets peuvent être parallèle ou anti-parallèle
B. Ils sont stabilisés par des liens H interchaînes
C. Ils sont riches en glycine
D. Le pas de ces hélices varie de 0,6 à 0,7 nm
E. Toutes ces réponses XXX
13. Dites si les énoncés suivants sont vrais ou faux:
A. Une réaction est dites "spontanée" lorsqu'elle procède dans les deux sens
rapidement Faux
B. Une réaction spontanée procède toujours très rapidement Vrai
C. Une réaction spontanée procède toujours avec une perte d'entropieFaux
D. Une réaction peut être favorisée par l'enthalpie ou l'entropie Vrai
14. Pour une réaction du type A donne B à 298 K, on a observé un changement
d'enthalpie de -7 kJ/mol et un chagement d'entropie de -25 J/K. Est-ce que cette
réaction est spontanée? Non car le Delta G est +0,45 KJ/mol
15. Décrivez brièvement mais d'une manière convaincante les forces de London
en donnant leurs caractéristiques particulières.
Il y a deux façons de visualiser les Forces de London. 1) Dans toutes les
molécules, même les non polaires, on a un dipôle au moment x à cause des
mouvements de vibration. Le dipôle d'une molécule va induire un dipôle sur une
autre molécule en s'en approchant. Ces deux dipôles vont s'attirer et créer une
forces d'attraction de London.
2) L'approche de deux molécules conduit toujours à l'induction d'un dipôle
complémentaire sur chacune des molécules, ce qui mène à une attraction
favorable, soit une Force de London.
16. Pour le peptide ATLDAK: Pour ce peptide, le N-terminal est libre , l'acide
aspartique à un acide sur la chaîne latérale, la lysine a un NH2 sur la chaîne
latérale et son COOH libre... le pKa de ces fonctions sont respectivement: 9,7 ,
3,9 , 10,8 et 2,2. À ph 3,9, 50% du peptide a une charge de +1 et 50% est neutre
(0). À ph 9,7, 50% du peptide est neutre (0) et 50% du peptide est -1.
A. Quel est son pI approximatif? (3,9 + 9,7) /2 = 6,8
B. Quel est sa charge nette à pH 7? Donc environ 0!
17. La structure de l'acétaminophène (Tylénol) est illustrée ci-dessous.
Quelles sont les groupes de l'acétaminophène qui peuvent jouer un rôle dans sa
liaison à son récepteur biologique et quelles types d'interactions non-covalentes
peuvent-ils faire? Répondez dans l'espace ci-dessous.
Le noyau aromatique peut faire des interactions aromatique-aromatique et être
impliqué dans des forces hydrophobes.
Les fonctions NH, OH et C=O peuvent faire des liens H de multiples façons étant
donneur (NH et OH) et accepteurs (N, O, et C=O) de liens H.
On peut aussi avoir plusieurs interactions électrostatiques de types dipôle-dipôle
de par la présence de groupes polaires (O-H, N-H, C=O) ayant un pipôle
permanent et des interactions dipôle-dipôle induit.
Évidemment, on retrouve de nombreuses forces de Van der Waals.