td5 - travaux pratiques biochimie structurale

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Universite Sidi Mohamed Ben Abdellah
Faculté Polydisciplinaire de Taza
Filiere : SVI
Semestre : S3
Module : Biochimie structurale
Pr : DAHMANE El Montassir
Année universitaire : 2016/2017
Travaux dirigés 5
Exercice 1 :
1 Les acides aminés possèdent les caractères généraux suivants (vrai ou faux?):
0 a. Ce sont des molécules amphotères.
0 b. Tous les acides aminés possèdent un atome de carbone asymétrique
0 c. La plupart des acides aminés naturels appartiennent à la série L.
0 d. Ils se différencient par la nature de leur chaîne latérale.
0 e. Ils entrent dans la composition des protéines.
2- Le pKa de la fonction. acide carboxylique de la glycine est de 2,4, celui de la fonction amine
de 9,8. Indiquer la (les) proposition(s) juste(s).
0 a. Le pHi vaut 2,4
0 b. Le pHi vaut 9,8
0 c. Le pHi vaut 6,1.
0 d. À pH 1,0, on a 50% de la fonction acide sous forme COO- et 50% de la fonction amine sous
forme NH3+
0 e. À pHi, la charge globale de la glycine est nulle.
3- Parmi les propositions suivantes, laquelle ou lesquelles sont exactes?
0 a. Les acides aminés standards possèdent tous un groupement carboxyle et un groupement
amine portés par le même atome de carbone.
0 b. Des D-acides aminés ont été trouvés dans de petits peptides des parois bactériennes et dans
certains peptides à propriété antibiotique.
0 c. La forme zwittérionique de la glycine est chargée positivement et migre vers la cathode dans
un champ électrique
0 d. La L-Leucine est un acide aminé qui n'existe pas dans la nature
4- Parmi les propositions suivantes, laquelle (lesquelles) est (sont) exacte(s)?
0 a. La valine est un acide aminé possédant une chaîne latérale R aromatique non polaire
0 b. La phénylalanine est un acide aminé possédant une chaîne latérale R aliphatique
0 c. Le tryptophane est un acide aminé possédant une chaîne latérale R aliphatique
0 d. À pH 7, l'arginine est un acide aminé possédant une chaîne latérale R chargée négativement
0 e. À pH 7, l'acide glutamique est un acide aminé possédant une chaîne latérale R chargée
positivement

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Universite Sidi Mohamed Ben Abdellah
Faculté Polydisciplinaire de Taza
Filiere : SVI
Semestre : S3
Module : Biochimie structurale
Pr : DAHMANE El Montassir
Année universitaire : 2016/2017
Exercice 2 :
- un peptide P contient douze résidus d’acides aminés, deux d’entre eux étant présents chacun
deux fois. Il contient de la lysine et pas d’arginine. Le réactif d’Edman détache un diacide à 4
carbones. Le clivage par le bromure de cyanogène donne deux peptides, un peptide A de 5
résidus et un peptide B de 7 résidus.
a- du peptide A le réactif d’Edman détache successivement le diacide de 4 carbones, puis le plus
simple des acides aminés.
La typsine coupe A en deux peptides, A1 et A2, dont l’un a comme acide aminé N-terminal un
acide alcool à 3 carbones.
b- du peptide B le réactif d’Edman détache un acide aminé faiblement basique contenant 3
atomes d’azote et la carboxypeptidase un acide aminé alcool à 3 carbones.
La chymotrypsine détache un peptide terminé par un acide aminé porteur d’une fontion
phénol.
La trypsine sépare B en deux peptides, B1 et B2. Le peptide B1 donne par hydrolyse acide 3
acides aminés et 4 par hydrolyse alcaline.
Du peptide B2 le réactif d’Edman enlève Ile puis un acide alcool à 4 carbones.
Donner la séquence du peptide P.