UE 8 - De l’agent infectieux à l’hôte.

UE 8 - De l’agent infectieux à l’hôte.
Date : 07/03/2017 Plage horaire : 17h15 - 18h15
Ronéistes : PALAMA Amrita / JOUVE Fanny Enseignant : JAFFAR-BANDJEE
Promo : P2 2016-2017
MYCOBACTERIES.
I. Le genre Mycobactérium.
A. Paroi bactérienne
B. BAAR
C. Taxonomie du genre mycobactérium
D. Habitat
E. Pouvoir pathogène des mycobactéries
II.M. Tuberculosis complex.
A. Rappels sur la tuberculose
B. Epidémiologie
C. Pouvoir pathogène
D. La tuberculose
1. Clinique
2. Diagnostic Biologique
3. Diagnostic direct
A. Diagnostic direct sur prélèvement direct +
4. Sensibilité aux antibiotiques
A. Antibiogrammes
5. Traitement
6. Diagnostic indirect : immunité à médiation cellulaire
A. Test IGRA
III.Mycobactéries Atypiques
A. Taxonomie du genre Mycobactérium
IV. M Leprae ou Bacille de Hansen.
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I. Le genre Mycobactérium.
La mycobactérie la plus connue en médecine est mycobactérie tuberculosis, l’agent de la
tuberculose. Mais il n’est pas le seul, car il appartient au genre Mycobactéria d’ordre
Actinomycetales.
Dans la familles des bactériacae, il y a un seul genre qui est mycobactérium, caractérisé par une
paroi qui lui donne une propriété tinctoriale. Elle possède une acido-alcoolo-résistance due à la
constitution de la paroi riche en acide glycolique (60% lipides), de ce fait ça rend les bactéries
imperméables aux colorants usuels (MGG, Gram). Mais elles fixent les colorants alcalins,
lipophiles, comme la fuchsine, du coup ce sont des colorants utilisés. Une foie colorée, cette paroi
s’oppose à la décoloration par l’acide alcool ; on va utiliser ces propriétés. Cette paroi leur
confère une grande résistance aux agents chimiques puissants et a aussi un rôle dans la
pathogénicité.
Il y a environ 50 espèces qui existent, retrouvées dans l’environnement, ou qui sont commensales
ou qui peuvent être pathogènes.
Morphologiquement, ce sont des bacilles droits ou légèrement incurvés, assez long (1-10 µm) car
les bactéries de taille normale c’est l’orde de quelques µm, mais variable !, immobiles et aérobies
strictes, ce qui est important pour la mise en culture.
A. Paroi bactérienne
La paroi bactérienne est beaucoup plus épaisse, une double paroi, avec une membrane de
peptidoglycanes et à l’extérieur il y a les acides mycoliques.
Cette paroi est traversée par des molécules de lipo-arabinomananne (symbolisés par des sortes
d’arbres) ancrée par leur partie lipidique dans la membrane cytoplasmique et dont la partie
polysaccharidique gagne la surface cellulaire, ont un rôle dans la cohésion de la paroi.
Ces parois sont bien plus compliquées des membranes que l’on connait : ici on retrouve les acides
mycoliques qui caractérisent les mycobactéries.
B. BAAR
C’est pour ça que les mycobactéries sont des BAAR pour Bactérie Acido-Alcoolo Résistante. Ce
sont des bactéries difficilement colorées par le Gram, mais qui sont quand même considérées
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comme Gram+. On utilise cette propriété pour mettre en place la coloration de Ziehl-Neelsen
ainsi que la coloration à l’auramine ; la coloration de Ziehl-Neelsen utilise de la fushine et permet
de colorer les bactéries, et ensuite de faire un lavage à l’alcool qui permet éliminer les autres
bactéries, ensuite on fait une contre-coloration.
Donc ici on a les mycobactéries en roses sur un fond bleu et ce sont des BAAR.
Pour la coloration à l’auramine, c’est un composé fluorescent que l’on va fixer sur des Ac pour faire
des Ac marqués à l’auramine. Ces Ac vont identifier bactéries.
Il faut savoir que les mycobactéries sont des BAAR, mais tous les BAAR ne sont pas des
Mycobactéries ; d’autres bactéries autres que les mycobactéries ont aussi plus ou moins cette
propriété : la famille des Nocardia et des Actinomycètes sont BAAR, mais faiblement BAAR.
Quand on fait un examen direct et qu’on fait des BAAR, il ne faut pas tout de suite dire que ce sont
des mycobactéries.
C. Taxonomie du genre mycobactérium
En terme de taxonomie, on distingue :
-les Mycobactéries Tuberculeuses qui ont un pouvoir pathogène. Mais il n’y a pas que M.
Tuberculosis, il y a un complexe tuberculosis qui comprend le M tuberculosis proprement
humain, M bovis (la tuberculose chez l’animal), M africanum (tuberculose en Afirque), M canetti
(relativement proche de Tuberculosis), M microtome (tuberculose chez les petits campagnoles,
c’est pas pathogène chez l’Homme). Néanmoins, toutes ces mycobactéries sont regroupées sous
le terme de Mycobactérie Tuberculosis.
-les Mycobactéries atypiques sont un groupe polymorphe que l’on peut rencontrer dans
l’environnement et qui donne des pathologies chez les sujets essentiellement immuno-déprimés.
-les Mycobacterium Leprae, comme son nom l’indique, c’est l’agent de la lèpre.
D. Habitat
Où est-ce qu’on trouve ces Mycobactéries ?
On retrouve ceux du « complexe tuberculosis » sur des animaux à sang chaud (hôtes animaux),
que ce soit l’Homme, les bovins, les campagnols.
Le M. Leprae est strictement humain.
Et les M. atypiques sont retrouvées dans l’environnement hydro-tellurique ; soit dans des
endroits humides, soit dans les sols. En fait il va infecter le sujet qui sera immuno-déprimé.
E. Pouvoir pathogène des mycobactéries
Très souvent, les mycobactéries vont entrainer des infections spécifiques chez l’Homme. Le
premier c’est M. Tuberculosis, M. Leprae, M. Ulcerans qui donne l’ulcère de Buruli, très morbide
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retrouvé dans les pays chauds (Afrique), M. Marinum retrouvé dans l’eau, qui chez l’Homme, peut
être à l’origine de granulome au niveau cutané qu’on attrape dans l’eau des piscines.
Ensuite, il y des infections spécifiques chez les animaux, comme M. Paratuberculosis (maladie de
Johne), M. Bovis, M. Microtti, M. Avium (elle ne dit pas celui-ci mais c’est dans le pdf).
Enfin, vous avez les infections opportunistes qui est vraiment la caractéristique des M. atypiques.
Notamment, le complexe MAC complexe avium intracellulare, de diagnostic et de traitement
difficiles.
II. M. Tuberculosis complex.
La M. tuberculosis est humaine et c’est Koch, en 1882 (bacille de Koch), qui l’avait isolée de
poumons de malades tuberculeux. C’est un réservoir humain et la contamination est
essentiellement pulmonaire.
Après, la M. Bovis a l’origine de la tuberculose chez les bovins, donne soit des lésions pulmonaires
soit des lésions mammaires. Donc, l’homme peut se contaminer par ingestion de lait cru ou par
inhalation dans les étables.
Ensuite, la M. Africanum a longtemps été limitée en Afrique noire, maintenant du fait de
l’immigration, on en voit en Europe.
Ensuite, il y a M. Canetti, un voisin de M. Tuberculosis, limité à la corne de l’Afrique.
Enfin, M. Microti qui n’est pas humain et infecte les petits rongeurs (campagnols), les cobayes,
lapins. Il est non pathogène pour l’Homme.
Il y a aussi le Bacille de Calmette et Guérin qui est le BCG ; donc le vaccin. Mr Calmette et Mr
Guérin ont vu qu’il fallait passer cette souche de Bovis, qui était pathogène, sur plusieurs cultures
de pomme de terre glycérinées. A la fin, la bactérie avait perdu son pouvoir pathogène. Du coup, on
l’utilise comme vaccin, car il est très proche de tuberculosis, et lorsqu’on est protégés par le BCG
on est protégés à 80 % contre la tuberculose, notamment contre la tuberculose grave.
A. Rappels sur la tuberculose
Son nom provient de l’aspect macroscopique des lésions, à l’époque il n’y avait pas de microscope
et quand on ouvrait les corps, on voyait des tubercules dans les poumons ou lésions
granulomateuses. Cela dit, ce ne sont pas des lésions pathognomonique de la tuberculose ; c’est-à-
dire qu’elles ne sont pas spécifiques. C’est très évocateur dans un contexte clinique, mais il y a
d’autres pathologies, comme la sarcoïdose, où on peut trouver des lésions granulomateuses.
Par contre, ce qui caractérise la tuberculose, c’est que les lésions granulomateuses ou les tubercules
font souvent de la nécrose caséeuse. La nécrose caséeuse c’est comme un liquide jaunâtre/
blanchâtre (un peu comme un pus, mais ce est pas du pus).
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La tuberculose est une maladie infectieuse contagieuse la plus répandue dans le monde
strictement humain. Ce sont surtout les pays en voie de développement qui sont touchés (Afrique,
Sud-Est asiatique, Amérique du Sud). Heureusement, dans les pays développés, globalement c’est
en baisse régulière sauf dans certaines situations (immigrés).
B. Epidémiologie
Si nous on est peu concernés, mondialement, en 2011, 8,7 millions de personnes on développé la
maladie par an, et 1,4 million de gens meurent de tuberculose.
Plus de 95% de décès dans les pays en voie de développement ; c’est un problème au niveau de la
résistance aux antibiotiques de la bactérie qui fait que l’éradication et le traitement n’est pas facile.
Le nombre de cas diminue lentement ; il y a des programmes de lutte contre la tuberculose, et du
coup le taux de mortalité a chuté de 41 % entre 1990 et 2010.
En France, l’incidence est allée de 8,1 % en 2010 soit environ 5 000 nouveau cas par an.
Alors qu’en Afrique du Sud on a 971 ; Congo 382 ; Chine 80 ; Brésil 45 ; Madagascar 261.
Madagascar est un grand pourvoyeur de tuberculose. En Afrique du Sud, il y a un taux énorme de
tuberculose du à une épidémie de VIH ; ce sont des patients fragiles et le VIH est une maladie qui
atteint l’immunité cellulaire, le M. Tuberculosis étant une bactérie intracellulaire, il va mobiliser
essentiellement l’immunité intracellulaire.
C. Pouvoir pathogène
La tuberculose est une infection nécrosante qui est chronique, elle se développe sur plusieurs
années. Ainsi, le temps de génération de la bactérie est longue de 20h, c’est une croissance lente. En
comparaison, pour le colibacille on est a 20 min ; en 18-20h on a une colonie, pour M. Tuberculosis
on a une telle colonie au bout de 7-10 jours.
C’est une bactérie aérobie stricte, donc sa croissance est favorisée dans les organes biens
oxygénés. Si elle a un tropisme pulmonaire ce n’est pas un hasard, car il y a beaucoup d’oxygène.
La pathogénicité est liée à l’immunité cellulaire antituberculeuse (bactérie à croissance
intracellulaire facultative).
C’est une bactérie résistante dans le milieu extérieur ; elle résiste au froid, à la dessication et ça lui
permet de persister longtemps dans les poussières. Ce qui explique que c’est un réel fléau dans les
pays du tiers-monde.
D. La tuberculose
La tuberculose est une maladie infectieuse transmissible due à des mycobactéries du complexe
tuberculosis ; ce ne sont pas toutes les mycobactéries qui donnent la tuberculose, c’est le complexe
tuberculosis.
-M. Tuberculosis (= bacille de Koch : BK)
-M. Bovi
-M. Africanum
Ces deux derniers sont plus rares.
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