Mycobacterium tuberculosis
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Mycobacterium tuberculosis complexe Les agents responsables de la tuberculose sont Mycobacterium tuberculosis, M. bovis, M. africanum et M. microti (= M. tuberculosis-complexe). L'OMS estime 2 à 3 millions le nombre des décès et 8 millions des nouvelles infections par année. Environ 1/3 de la population globale a subi une infection primaire (initiale) par M. tuberculosis. Infection primaire chez 95% des individus inaperçue, peut devenir active à chaque âge, le risque de recrudescence (ou de tuberculose post-primaire) augmente en présence de conditions immunosuppressives (infection au VIH, abus d'alcool, vieillissement, thérapie aux corticoïdes, chimiothérapie). Dans les pays industrialisés, 70% des cas de tuberculose sont dus à la réactivation d'anciennes infections initiales. En Suisse, 1000 à 1200 de cas de tuberculose sont déclarés par année. La moitié des cas est observée chez des migrants de pays à incidence élevée et chez des personnes âgées. Le SIDA n'a pas influencé l'incidence de la maladie dans notre pays. La transmission aérogène par l'inhalation de gouttelettes contaminées est la plus fréquente, la tuberculose pulmonaire donc la manifestation clinique la plus courante (75%). Tuberculose extra pulmonaire par dissémination hématogène souvent observée chez les patients VIH positifs ou atteints de SIDA (70%). Localisations plutôt rares: ganglions 6%, tractus urogénital 5%, os et articulations 2.5%. Diagnostic de laboratoire conventionnel: identification de BAAR au microscope (M. tuberculosis, mycobactéries atypiques, Nocardia), décelables à condition que le prélèvement contienne 103 à 104 germes par millilitre. Culture en parallèle obligatoire, prend plusieurs jours ou semaines (temps de génération de M. tuberculosis 24 heures). La PCR prend nettement moins de temps (2 heures), elle est un moyen utile de diagnostic rapide complémentaire aux méthodes conventionnelles. La sensibilité pour les prélèvements positifs au microscope est >95%, dans les négatifs environ 60%. Spécificité >99%. L'emploi de routine de la PCR est avantageux sur un prélèvement positif au microscope de patients atteints de SIDA, de tumeurs malins ou d'autres maladies immunosuppressives (où différenciation entre tuberculose et mycobactériose atypique d'intérêt vital) pour confirmer (ou infirmer) rapidement une tuberculose avant le dépistage des membres du collectif autour du patient index (famille, école, asile, prison etc.), indiqué en cas de tuberculose seulement pour les prélèvements extra pulmonaires, en majorité négatifs au microscope et de culture très longue sur un aliquote du liquide d'une culture mycobactérienne signalant croissance (Bactec, MGIT etc.) ou sur une suspension d'organismes prélevés d'une gélose) voir aussi Mycobacterium spp.). La PCR ne remplace pas la culture actuellement, l’antibiogramme nécessitant des germes vivants.
