25/11/2015 GABEN Marion L2 CR : NICOLAS Margot

GENETIQUE MEDICALE – ED Génétique des populations
25/11/2015
GABEN Marion L2
CR : NICOLAS Margot
Génétique Médicale
E. Balducci, T. Busa
10 pages
ED génétique des populations
A. Généralités
1. Définitions
Loi Hardy – Weinberg :
Dans une population de dimension infinie où les unions entre les individus se font au hasard (Panmixie), où il
n'existe ni migration, ni sélection et où le taux de mutations est constant : les proportions des différents
génotypes restent constantes d'une génération à l'autre.
Les écarts à cette panmixie passent par la consanguinité.
Il y a consanguinité lorsque les unions se réalisent entre les individus partageant au moins un ancêtre commun.
Deux individus sont apparentés s'ils ont au moins un ancêtre commun.
Un individu est dit consanguin si ses deux parents sont apparentés.
Coefficient de parenté ϕ : probabilité qu'un exemplaire d'un gène, tiré au hasard chez
le père, soit identique par ascendance à un exemplaire du même gène tiré au hasard chez
la mère.
Coefficient de consanguinité F : probabilité que les deux exemplaires d'un gène d'un
individu soient identiques par ascendance.
Le coefficient de consanguinité F d'un individu est égal au coefficient de parenté ϕ de
ses parents
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Plan
A. Généralités
I. Définitions
II. Calcul du coefficient de consanguinité
III. Exemples
B. Cas cliniques
I. Cas clinique n°1
II. Cas clinique n°2
III. Cas clinique n°3
IV. Cas clinique n°4

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II. Calcul du coefficient de consanguinité
Le coefficient de consanguinité F est égal à la somme des consanguinités induites Ci par les ancêtre communs.
F= Σ Ci
Ci = 1/2(m+p+1)
→
n = nombre d'ancêtres communs
m= nombre de chaînons qui relient la mère à l'ancêtre commun
p = nombre de chaînons qui relient le père à l'ancêtre commun
Exemple de parenté cousins germains :
n ancêtre communs = 2 (les grand parents)
m = 2
p = 2
F = Σ 1/2 (m+p+1) = 1/2(2+2+1) + 1/2(2+2+1) = 1/32 + 1/32 = 1/16
1/16 est le coefficient de consanguinité d'un individu issu d'une union entre des
cousins germains
Exemple de parenté demi frère / demi sœur :
n ancêtres communs = 1 (père)
m = 1
p = 1
F = Σ 1/2 (m+p+1) = 1/2 (1+1+1) = 1/8
Dans le cadre d'un mariage consanguin, la probabilité d'avoir un enfant homozygote est augmentée du fait de la
consanguinité. La probabilité d'avoir un enfant atteint d'une maladie autosomique récessive dans un mariage
consanguin est égale à :
q2 : fréquence de la maladie
Fq : coefficient de consanguinité
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q2 + Fq
F=∑
i=1
n
(1
2)
m+p+1

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Le risque relatif d'avoir un enfant atteint d'une maladie autosomique récessive dans un couple consanguin par
rapport à la population générale :
III. Exemples
Exemple 1: Calculer le coefficient de consanguinité : d'un individu issu d'une union frère-soeur
n ancêtres communs = 2
m =1
p =1
F = Σ 1/2(m+p+1) = 1/2(1+1+1) + 1/2(1+1+1) = 1/8 + 1/8 = 1/4
Exemple 2 : calculer le coefficient de consanguinité d'un individu issu d'une union père – fille
n ancêtres communs = 1
m = 1
p = 0
F = Σ 1/2(m+p+1) = 1/2(1+0+1) = 1/4
Exemple 3 : Calculer le coefficient de consanguinité d'un individu issu d'une union oncle/nièce
n ancêtres communs = 2
m = 2
p = 1
F = Σ 1/2(m+p+1) = 1/2(2+1+1) + 1/2(2+1+1) = 1/16 + 1/16 = 1/8
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Exemple 4 : Calculer le coefficient de consanguinité de I
n ancêtres communs = 1
m = 2
p = 2
F = Σ 1/2(m+p+1) = 1/2(2+2+1) = 1/32
n ancêtres communs = 1
m = 2
p = 1
F= Σ 1/2(m+p+1) = 1/2(2+1+1) = 1/16
Exemple 5 : Calculer le risque relatif pour des cousins germains vis-à-vis de la survenue chez leur enfant de
chacune des maladies suivantes :
–Mucoviscidose, dont la fréquence dans la population générale est 1/2500
–Galactosémie (1/40 000)
–Ataxie télangiectasie (1/90 000)
Réponses :
Le risque relatif d'avoir un enfant atteint d'une maladie autosomique récessive dans un couple consanguin par
rapport à la population générale :
- Mucovisidose
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- Galactosémie
- Ataxie télangiectasie
B. Cas cliniques
I. Cas clinique 1
Consultation de conseil génétique pour IV1 et IV2
Antécédent de maladie de Hurler (maladie récessive autosomique) dans la famille (IV3)
a) Calculer le coefficient de parenté de IV1 et IV2
b) Calculer le risque pour le couple IV1 et IV2 :
•d'avoir un enfant atteint de la maladie de Hurler ( fréquence : 1/90 000 dans la population générale)
•d'avoir un enfant atteint de phénylcétonurie, maladie récessive autosomique de fréquence 1/10 000
en sachant qu'il n'existe aucun antécédent dans la famille ?
•D'avoir un enfant atteint de trisomie 21 ?
Réponses :
a) Calculer le coefficient de parenté de IV1 et IV2
n ancêtres communs = 2 (I1 et I2)
m = 3
p = 3
Φ = Σ 1/2 (m+p+1) = 1/2 (3+3+1) + 1/2 (3+3+1) = 1/128 + 1/128 = 1/64
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