Laboratoire de Biologie et biotechnologie des microorganismes

LABORATOIRES
LA GAZETTE DU LABORATOIRE
n°33 - juillet 2009
P
Laboratoire de Biologie et biotechnologie des microorganismes (LBBM) de la faculté des
sciences Semlalia / Université Cadi Ayyad de Marrakech.
aquatiques. Déterminisme, taxonomie,
biodiversité, génétique, toxicologie,
aspects
sanitaires,
implications
écologiques et environnementales ;
► Structure,
fonctionnement
et
gestion des écosystèmes aquatiques
aménagés (retenues de barrage, cours
d’eau régulés et canaux d’irrigation).
Eutrophisation, qualité des eaux et
relation avec le bassin versant ;
► Taxonomie,
biodiversité
et
écologie des diatomées. Utilisation pour
l’évaluation de la qualité de l’eau et le
bio-monitoring des cours d’eau ;
► Ecophysiologie, cultures in vitro,
croissance, production et valorisation de
la biomasse des microalgues. Influence
des conditions de culture et des facteurs
environnementaux.
3.
Microbiologie et
Environnementales Doctorante en train de manipuler dans une hotte à flux laminaire vertical
Le Laboratoire de Biologie et de
Biotechnologie des Microorganismes
(LBBM) est rattaché au département
de biologie de la Faculté des Sciences
Semlalia de Marrakech (FSSM). Ce
nouveau laboratoire, accrédité par
l’université Cadi Ayyad (UCA) en début
2006, est le fruit de regroupement
volontariste de deux anciens laboratoires
de la FSSM (Laboratoire d’Algologie
et Laboratoire de Microbiologie). Cette
restructuration, initiée par l’Université, vise
une meilleure fédération et optimisation
des moyens humains et matériels et
la mise en place d’unités de recherche
avec une masse critique suffisante. Le
LBBM réunit aujourd’hui une douzaine
d’enseignants chercheurs permanents et
une vingtaine de doctorants et constitue
une structure universitaire de référence en
« Algologie, Microbiologie, biotechnologie
et environnement ». La spécificité
du laboratoire consiste à associer,
au sein d’une même structure, des
compétences et des approches variées
allant de la biochimie, la microbiologie,
l’écophysiologie, la toxicologie à l’écologie
aquatique et la biologie des populations
et des écosystèmes.
Le LBBM comporte 3 équipes de
recherche et encadre chaque année
plusieurs étudiants chercheurs dans le
cadre de la préparation de thèses de
doctorat et de Masters. Le laboratoire
est constitué des équipes suivantes :
Equipe 1 : Ecologie et Biotechnologie
Microbiennes, dirigée par le Pr. HASSANI
Lahcen (Directeur du laboratoire)
Equipe 2 : Microbiologie et Toxicologie
Environnementales, dirigée par le Pr.
IMZILN Boujamâa Equipe 3 : Algologie Fondamentale et
Appliquée, dirigée par le Pr. MOUHRI
Khadija (Directeur adjoint du laboratoire).
Axes de recherche développés au
sein du LBBM :
Ecologie et Biotechnologie Microbiennes Cette première thématique se décline en
deux volets principaux :
-Le premier concerne le rôle des
microorganismes dans l’environnement,
en
tant
qu’auteur
essentiel
et
indispensable dans l’évolution de certains
écosystèmes aquatiques et terrestres. Il
s’adresse tout particulièrement à l’étude
du comportement et de la survie des
microorganismes dans ces écosystèmes.
Les axes développés par cette équipe
concernent :
► Le rôle des microorganismes dans
le traitement des eaux usées ;
► L’étude de l’impact des eaux usées
sur le milieu récepteur et sur la santé;
► L’étude des mécanismes de
survie et des interactions entre les
microorganismes dans les milieux
aquatiques et terrestres.
- Le deuxième volet s’intéresse au rôle
des actinomycètes, notamment leur
utilisation comme outil de lutte biologique
par l’étude des différents aspects des
mécanismes impliqués. Ce travail vise :
► L’identification de la cartographie des
espèces d'actinomycètes au Maroc ;
► L’isolement et criblage de souches
solubilisatrices du phosphate naturel et
l’étude des mécanismes impliqués ;
► L’isolement et criblage des souches
actinomycétales
productrices
de
substances bioactives ;
► Et l’utilisation des actinomycètes
pour la lutte biologique (Bio-contrôle)
contre les agents phytopathogènes.
2.
Algologie
Appliquée Fondamentale
Toxicologie
Cette 3ème équipe focalise ses recherches
sur l’étude des microorganismes, en relation
avec l’environnement et leurs impacts sur
l’Homme. Leurs champs d’action peuvent
être répartis comme suit :
► Biotechnologie
microbienne
appliquée à l'environnement :
► Etudier les interactions entre les
polluants organiques et inorganiques et
les micro-organismes, afin d'enrichir les
connaissances relatives aux rôles des
micro-organismes dans la résolution des
problèmes liés à la pollution;
► Elaborer des procédés microbiologiques
pour la dépollution métallique et/ou
organique;
► Sélectionner des souches de Rhizobium
autochtones compétitifs résistantes aux
facteurs environnementaux tels que la
salinité, l’acidité, le déficit hydrique,…
► Rechercher et valoriser les substances
bioactives élaborées par des microorganismes et des végétaux.
► Aspects écologiques et sanitaires.
►Toxicologie environnementale :
►Acquérir
des
connaissances
écotoxicologiques et toxinologiques
fondamentales sur les implications
écologiques
et
sanitaires
liées
aux bactéries pathogènes et aux
cyanobactéries toxiques
► Evaluation de la contamination des
plantes par bioaccumulation, biotransfert
et biodégradation suite à l’irrigation par
des eaux contenant les cyanotoxines
► Etude
des
interactions
allélophatiques entre les Cyanobactéries
toxiques et les plantes.
► Etudes de l’impact écologique
et sanitaire des cyanotoxines sur
l’embryogenèse, la croissance et la
reproduction de certains poissons des
eaux douces.
► Microbiologie environnementale :
► Etudier la biologie et la dynamique de
Legionella dans différents écosystèmes
et niches écologiques;
► Etudier la biologie et la dynamique
de Vibrio dans différents écosystèmes
aquatiques;
► Evaluer l’impact de la pollution sur la
qualité microbiologique des écosystèmes
récepteurs
et
des
performances
épuratoires de procédés de traitement.
► Réaliser et suivre la qualité
microbiologique de certains milieux et
produits (eau, sol, produits alimentaires,
matière première,...);
► Etudier les interactions entre les
cyanobactéries et les bactéries et évaluer
leurs rôles dans le fonctionnement de la
boucle microbienne.
Equipements et moyens disponibles
du laboratoire
Afin de réussir et d’atteindre les objectifs
fixés par le LBBM, le laboratoire s’est
doté d’un équipement répondant aux
besoins des recherches menées.
En effet, il dispose notamment des
équipements suivants :
► Autoclaves ;
► Loupes binoculaires ;
► Microscope à épifluorescence ;
► Microscope inversé ;
► Spectrophotomètres UV visible ;
► Préparateur/répartiteur de milieux gélosés ;
► Hottes à flux laminaire vertical ;
et
Le Maroc bénéficie d’une grande
hétérogénéité de biotopes et de
conditions écologiques. Cette diversité
a permis l’installation d’une flore algale
riche et variée. Toutefois, Malgré
cette grande diversité biologique, son
intérêt écologique et son importance
économique, la flore algale reste
relativement méconnue, en comparaison
avec la flore phanérogame et les
recherches purement taxonomiques
sont plus rares et souvent fragmentaires.
Par conséquent, les recherches de cette
équipe se concentrent particulièrement
sur les axes suivants :
► Etude des Blooms toxiques des
cyanobactéries dans différents milieux
Fermenteur
LABORATOIRES
► Cuves d’électrophorèse ;
► Transilluminateur ;
► Lyophilisateur ;
► Oxymètre de terrain ;
► DBO-mètre et DCO-mètre;
► Tamiseuse « Vibro » ;
► Electrophorèse capillaire ;
► Sonificateur ;
► Salle de culture des microalgues ;
► Chambre de culture thermostatée ;
► Hottes à flux laminaire
► Hottes de minéralisation,
►Analyseur
multi-paramètres
(pH,
température, O2 dissous, conductivité),
► Microscope Zeiss à épifluorescence,
► Spectrophotomètre à flamme,
► Microbalance de précision,…etc.
Des collaborations dans des domaines
variés
Les travaux menés par le LBBM sont
soutenus par des partenaires régionaux,
nationaux et internationaux de renom :
► Pour les organismes régionaux, on
peut citer: l’hôpital Militaire Avicenne,
Marrakech (Maroc), Agence de bassin
hydraulique de Tensift (ABHT), Centre
de Développement de la Région de
Tensift (CDRT),…etc.
► Pour les organismes nationaux :
IAV - HASSAN II (Rabat), Misobiop (Pôle
de compétence : Microbiologie du sol et
biotechnologie des plantes) Rabat Point
focal, l’Institut scientifique de Rabat, le
laboratoire de Microbiologie et Biologie
Moléculaire de la faculté des Sciences
(Rabat)…etc.
► Et
pour
les
organismes
internationaux : Laboratoire Eau et
Environnement de l’Institut National de
LA GAZETTE DU LABORATOIRE
n°33 - juillet 2009
Recherche Scientifique et Technique de
Tunis (Tunisie), l’Université de Clermont
Ferrand (France), l’Institut de l’Eau,
Granada (Espagne), laboratoire de
santé publique et environnement de la
Faculté de pharmacie / Université Paris
Sud, l’Institut de Chimie de substances
naturelles Gottigen Allemagne …etc.
Le financement du laboratoire est assuré
par l’université, mais aussi grâce aux
programmes thématiques d’appui à la
recherche scientifique notamment : PARS,
PROTARS, INCO et actions intégrées, ainsi
que par des conventions avec la faculté des
sciences Semlalia et certains organismes,
tels que l’OCP, la Société Impériale Des
Thés et Infusions de Marrakech…etc.
Plusieurs travaux de recherche du
laboratoire ont fait l’objet de publication
dans
des
revues
scientifiques
internationales de référence.
Le laboratoire a été également
représenté dans plusieurs manifestations
scientifiques, entre autres :
• Congrès méditerranéen WATMED 2
(Marrakech, novembre 2005) ;
• Colloque ADLAF (Bordeaux, septembre
2005 ;
• Conférence des Limnologues d’Expression
Française : CILEF 8 (Tunisie, mars 2006) ;
• First Mediterranean Congress on
Biotechnology: MCB1 (Hammamet,
Tunisie, 2006);
• WATMED 3 (Algérie 2007) ;
• Et la Conférence des Limnologues
d’Expression Française : CILEF 9
NM
Marrakech, Maroc
Chimie Tex : société spécialisée dans le
domaine du textile
Créée en 1994 par un docteur en
chimie appliquée, Chimie Tex est
une société ayant pour activité la
formulation, le conditionnement et
la commercialisation de produits
chimiques
utilisés pour le
traitement des textiles.
personnes, réparties entre le service
transit et logistique (import export),
le service laboratoire, le service de
production, le service de livraison ainsi
que la direction et l’administration.
Pendant les années quatre-vingt dix,
le secteur textile tunisien a connu une
forte dépendance à l’importation, dans
le domaine des produits chimiques.
Le défi à relever était de taille pour
pouvoir substituer aux produits
importés des produits fabriqués
localement, répondant aux besoins de
la profession (produits à base d’eau
à 90%, produits très sensibles à la
chaleur, problème de péremption des
produits importés (jusqu’à 50%) avant
leur utilisation en production, problème
évoqué par tous les industriels du
secteur.
Parmi les objectifs de la société :
Située dans la Zone Industrielle de
Sousse, au Centre Est de la Tunisie,
la société Chimie Tex dispose de 3
grands dépôts de 600m² chacun, de
2 bâtiments pour la production et la
formulation, ainsi que d’un laboratoire
pour la recherche et développement
concernant l’activité des textiles et des
produits chimiques.
Activité de la société
Chimie Tex travaille principalement
avec les sociétés de délavage, de
traitements spéciaux pour les jeans
ainsi que l’ennoblissement des
textiles. Les clients sont répartis sur
tout le territoire tunisien.
L’effectif de la société est de 30
P
Les objectifs de Chimie Tex
-
-
-
-
-
-
une meilleure compétitivité sur le
plan qualité et prix, sur le marché
des produits chimiques pour
le secteur textile ;
création d’un laboratoire à
l’échelle pilote ;
création d’une salle d’exposition
des produits développés ;
collaborations
avec
des
fabricants de tissus pour les
innovations ;
collaborations
avec
des
donneurs d’ordre dans le
secteur ;
meilleur respect du coté
environnemental et écologique,
tant avec les fournisseurs
qu’avec les clients.
Chimie Tex possède des accords
de partenariat et de représentation
avec des entreprises internationales
spécialisées dans le développement
et le traitement dans le secteur de
jeans, l’ennoblissement de textiles et
le finissage de textiles.
Chimie Tex souhaite consolider et
poursuivre le développement de ses
activités en Tunisie et vise également
l’export.
N. K
TUNISIE
Automate préparateur et répartiteur de milieux de culture gélosés
Bain-Marie et Autoclave de paillasse