Offre de Doctorat CIFRE
Compétences cognitives et techniques acquises par le doctorant
Le doctorant aura une solide formation en microbiologie et biologie moléculaire associée à une
connaissance des produits carnés, ce qui est une garantie d’ouverture pour des débouchés dans le
monde non seulement académique mais aussi particulièrement dans les milieux professionnels de
l’industrie agro-alimentaire. Cette formation sera doublée d’une connaissance sur les écosystèmes
microbiens alimentaires et sur l’acquisition de fortes compétences dans l’analyse bioinformatique
des données de séquençage à haut débit et sur les tests statistiques appliqués à l’écologie
microbienne
Domaine de savoir : Microbiologie/ écologie microbienne /écosystèmes complexes
Domaines de compétences : Production de matériel biologique et données : biologie moléculaire
ADN/ARN – microbiologie/Analyses de données : analyse de données haut débit, séquençage/NGS,
Bio informatique/biostatistique
Structures & Laboratoires d'accueil
Aérial , Institut Technique Agro Industriel,250 rue Laurent Fries, 67412 Illkirch
Contact : mh.desmonts@aerial-crt.com
INRA, UMR1319 Micalis. Equipe Flore Lactique & Environnement Carné. Centre de Recherches de
Jouy-en-Josas. F-78350 Jouy-en-Josas. Contact : stephane.chaillou@jouy.inra.fr,
Titre de la thèse
Etude métagénomique
comparative
pour identifier
l'influence des cultures protectrices sur la
fonctionnalité des écosystèmes altérants de charcuteries selon leur teneur en sel et le type de
conditionnement.
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