Offre de Doctorat CIFRE
Compétences cognitives et techniques acquises par le doctorant
Le doctorant aura une solide formation en microbiologie et biologie moléculaire associée à une
connaissance des produits carnés, ce qui est une garantie d’ouverture pour des débouchés dans le
monde non seulement académique mais aussi particulièrement dans les milieux professionnels de
l’industrie agro-alimentaire. Cette formation sera doublée d’une connaissance sur les écosystèmes
microbiens alimentaires et sur l’acquisition de fortes compétences dans l’analyse bioinformatique
des données de séquençage à haut débit et sur les tests statistiques appliqués à l’écologie
microbienne
Domaine de savoir : Microbiologie/ écologie microbienne /écosystèmes complexes
Domaines de compétences : Production de matériel biologique et données : biologie moléculaire
ADN/ARN – microbiologie/Analyses de données : analyse de données haut débit, séquençage/NGS,
Bio informatique/biostatistique
Structures & Laboratoires d'accueil
Aérial , Institut Technique Agro Industriel,250 rue Laurent Fries, 67412 Illkirch
Contact : mh.desmonts@aerial-crt.com
INRA, UMR1319 Micalis. Equipe Flore Lactique & Environnement Carné. Centre de Recherches de
Jouy-en-Josas. F-78350 Jouy-en-Josas. Contact : stephane.chaillou@jouy.inra.fr,
Titre de la thèse
l'influence des cultures protectrices sur la
fonctionnalité des écosystèmes altérants de charcuteries selon leur teneur en sel et le type de
conditionnement.