Bactéries anaérobies

LABOKLIN LABOR FÜR KLINISCHE DIAGNOSTIK GMBH & CO.KG
Steubenstraße 4 • 97688 Bad Kissingen • Telefon: [phone] • Fax: [phone] • E-Mail: [email protected]
www.laboklin.de
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Bactéries anaérobies : tester aussi leur résistance !
Les bactéries anaérobies représentent toujours
une problématique particulière en médecine
vétérinaire. Lors de suspicion d’infections à
anaérobies, des examens bactériologiques
ciblés restent indispensables. Il faut tenir
compte du fait que leur recherche n’est en
routine pas réalisée; celle-ci doit être demandée
à part au laboratoire car c’est une procédure
longue et coûteuse nécessitant des techniques
inhabituelles. En effet, leur culture, en géné-
ral difcile et lente, impose des réensemence-
ments successifs sur des milieux de culture
sélectifs. Ainsi, la patience du praticien
attendant l’antibiogramme est rudement mise à
l’épreuve (durée d’analyse pouvant aller jusqu’à
14 jours).
Sont présentés succintement ci-dessous les
bactéries anaérobies strictes d’importance
clinique en médecine vétérinaire.Leur classica-
tion est basée sur leur morphologie et la colora-
tion de Gram.
1 .Bacilles sporulés à Gram négatif
Bacteroides fragilis - B. du groupe fragilis
Fusobacterium sp.
Prevotella sp.
Porphyromonas sp.
2. Bacilles (non) sporulés à Gram positif
Clostridium sp.
Actinomyces sp. (non sporulés)
Propionibacterium sp. (non sporulés)
3. Coques à Gram positif
Peptostreptococcus sp.
Généralités / Les maladies
Les anaérobies sont rarement rencontrés
en monoculture,il s’agit en règle générale
d’infections polymicrobiennes associant
des anaérobies strictes à des aéro-anaérobies
facultatives. L’ infection est la plupart du temps
d’origine endogène, à l’exception de certaines
clostridioses, car ce sont des commensaux
naturellement présents au sein de la ore
endogène de l’hôte. Les anaérobies ne vivent
jamais dans les tissus sains mais d’ordinaire
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info 5/2013
associés à d’autres micro-organismes pro-
ducteurs d’oxygène au sein des muqueuses des
cavités naturelles (digestive,buccale, génitale).
Certaine des espèces présentes possèdent des
facteurs de virulence tels que adhésines, toxines
et enzymes et peuvent entraîner, lors d’ altération
de la barrière muqueuse (chirurgie, blessure),un
processus infectieux dans les tissus voisins,
seuls ou en compagnie d’ aérobies. De telles
infections opportunistes sont décrites dans tous
les organes et appareils. En voici quelques ex-
emples.
L’espèce Bacteroides fragilis resp. les Bacte-
roides du groupe fragilis peuvent se trouver
en quantité importante à l’état physiologique au
niveau du tractus intestinal. Cette espèce peut
toutefois provoquer des infections intra-abdo-
minales, génitales et de plaies, des péritonites,
abcès du cerveau, septicémies. Les Fusobacte-
rium sp., une famille très importante en médecine
vétérinaire, sont largement répandus et respon-
sables d’ inammations suppurées nécrotiques.
Sont également décrites des mammites d’été,
pneumonies, et infections mixtes des onglons.
Prevotella sp. appartient à la ore bucco-pha-
ryngée et génitale mais peut aussi causer des in-
fections dans l’abdomen et le tractus respiratoire.
Porphyromonas gingivalis est un agent réputé
de parodontite et de suppurations odontologiques
(mâchoire) et pharyngées, tant chez l’homme
que chez l’animal. Dans des co-infections avec
des bactéries Gram positif sont souvent rencon-
trés Peptostreptococcus, Actinomyces et les
clostridies. Un exemple d’affection: les kératites
ulcéreuses. En 2008, Scarlett et col. isolèrent
chez des chiens des anaérobies dans 14 % des
cas. Plus récemment,dans des kératites ulcéreu-
ses chez l’homme et le cheval ont aussi été iden-
tiés des anaérobies, jusqu’à 13 % des cas chez
le cheval (Plummer et col.).
Prévalence des anaérobies
Depuis novembre 2012, chez différentes es-
pèces (chien, chat, cheval, rongeur), le labo-
ratoire de bactériologie de LABOKLIN a isolé
des anaérobies sur 242 prélèvements d’origine
variée: plaies (12,4%),abcès (29,8 %) et di-
vers (57,8 %). En tête de liste des isolats arrive
le groupe Bacteroides (69,8 %), puis Fusobac-
terium (9,9 %). La répartition des espèces est
détaillée sur le graphique 1 ci-après.
L’ antibiothérapie des infections à anaérobies
Apprécier l’activité des anti-infectieux sur les
anaérobies est problématique, techniquement
difcile et coûteux. Une appréciation adéquate
de la sensibilité des bactéries aux antimicrobiens
disponibles est donnée par la CMI (Concentrati-
on Minimale Inhibitrice) pour chaque couple bac-
térie/antimicrobien testé. Ainsi, depuis environ un
semestre, LABOKLIN utilise pour déterminer les
CMI une méthode de microdilution en bouillon, le
Micronaut -S anaérobies MIC (Sekisui Virotech).
Dans le graphique 2 sont rassemblés les résul-
tats des antiobiogrammes de cette série de 242
prélèvements.
L’amoxicilline + ac.clavulanique présente vérita-
blement une bonne efcacité (89,3 %), suivi loin
derrière par la pradooxacine et l’imipénème, ce
dernier étant de recours exceptionnel car faisant
partie de la réserve hospitalière humaine. Il est
à noter que des molécules éprouvées comme
la pénicilline et le métronidazole montrent ici un
taux de résistance élevé. Au vu des délais parti-
culièrement longs nécessaires à l’isolement puis
à l’identication des anaérobies, les infections
seront la plupart du temps traitées en l’absence
de documentation bactériologique. Baser un
traitement uniquement sur des données issues
d’études rétrospectives sans recourir à un an-
tibiogramme peut conduire à un échec théra-
peutique. L’antibiothérapie probabiliste mise en
place sans attendre les résultats des tests de
résistance pourrait aussi favoriser dans le futur
l’émergence de multirésistances, phénomène
déjà bien connu chez les Staphylocoques méti-R
SARM/SPRM et les Entérobactéries BLSE.
Graphique 1: Répartition des espèces bactériennes isolées
Graphique 2: Prols de résistance des anaérobies isolées
(n=242)
Anaérobies 2012-mars 2013 (n=242)
divers
Prol de résistance des anaérobies (n=242)
sensible
Métronidazole
Imipénème
Pénicilline G
Amox/Clavu.
Amoxicilline
Clindamycine
Ampicilline
Pradooxacine
intermédiaire résistant
LA_Anaerobier_FR.indd 1 23.05.13 14:53

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Les bactéries anaérobies représentent toujours
une problématique particulière en médecine
vétérinaire. Lors de suspicion d’infections à
anaérobies, des examens bactériologiques
ciblés restent indispensables. Il faut tenir
compte du fait que leur recherche n’est en
routine pas réalisée; celle-ci doit être demandée
à part au laboratoire car c’est une procédure
longue et coûteuse nécessitant des techniques
inhabituelles. En effet, leur culture, en géné-
ral difcile et lente, impose des réensemence-
ments successifs sur des milieux de culture
sélectifs. Ainsi, la patience du praticien
attendant l’antibiogramme est rudement mise à
l’épreuve (durée d’analyse pouvant aller jusqu’à
14 jours).
Sont présentés succintement ci-dessous les
bactéries anaérobies strictes d’importance
clinique en médecine vétérinaire.Leur classica-
tion est basée sur leur morphologie et la colora-
tion de Gram.
1 .Bacilles sporulés à Gram négatif
Bacteroides fragilis - B. du groupe fragilis
Fusobacterium sp.
Prevotella sp.
Porphyromonas sp.
2. Bacilles (non) sporulés à Gram positif
Clostridium sp.
Actinomyces sp. (non sporulés)
Propionibacterium sp. (non sporulés)
3. Coques à Gram positif
Peptostreptococcus sp.
Généralités / Les maladies
Les anaérobies sont rarement rencontrés
en monoculture,il s’agit en règle générale
d’infections polymicrobiennes associant
des anaérobies strictes à des aéro-anaérobies
facultatives. L’ infection est la plupart du temps
d’origine endogène, à l’exception de certaines
clostridioses, car ce sont des commensaux
naturellement présents au sein de la ore
endogène de l’hôte. Les anaérobies ne vivent
jamais dans les tissus sains mais d’ordinaire
page 1/2
info 5/2013
associés à d’autres micro-organismes pro-
ducteurs d’oxygène au sein des muqueuses des
cavités naturelles (digestive,buccale, génitale).
Certaine des espèces présentes possèdent des
facteurs de virulence tels que adhésines, toxines
et enzymes et peuvent entraîner, lors d’ altération
de la barrière muqueuse (chirurgie, blessure),un
processus infectieux dans les tissus voisins,
seuls ou en compagnie d’ aérobies. De telles
infections opportunistes sont décrites dans tous
les organes et appareils. En voici quelques ex-
emples.
L’espèce Bacteroides fragilis resp. les Bacte-
roides du groupe fragilis peuvent se trouver
en quantité importante à l’état physiologique au
niveau du tractus intestinal. Cette espèce peut
toutefois provoquer des infections intra-abdo-
minales, génitales et de plaies, des péritonites,
abcès du cerveau, septicémies. Les Fusobacte-
rium sp., une famille très importante en médecine
vétérinaire, sont largement répandus et respon-
sables d’ inammations suppurées nécrotiques.
Sont également décrites des mammites d’été,
pneumonies, et infections mixtes des onglons.
Prevotella sp. appartient à la ore bucco-pha-
ryngée et génitale mais peut aussi causer des in-
fections dans l’abdomen et le tractus respiratoire.
Porphyromonas gingivalis est un agent réputé
de parodontite et de suppurations odontologiques
(mâchoire) et pharyngées, tant chez l’homme
que chez l’animal. Dans des co-infections avec
des bactéries Gram positif sont souvent rencon-
trés Peptostreptococcus, Actinomyces et les
clostridies. Un exemple d’affection: les kératites
ulcéreuses. En 2008, Scarlett et col. isolèrent
chez des chiens des anaérobies dans 14 % des
cas. Plus récemment,dans des kératites ulcéreu-
ses chez l’homme et le cheval ont aussi été iden-
tiés des anaérobies, jusqu’à 13 % des cas chez
le cheval (Plummer et col.).
Prévalence des anaérobies
Depuis novembre 2012, chez différentes es-
pèces (chien, chat, cheval, rongeur), le labo-
ratoire de bactériologie de LABOKLIN a isolé
des anaérobies sur 242 prélèvements d’origine
variée: plaies (12,4%),abcès (29,8 %) et di-
vers (57,8 %). En tête de liste des isolats arrive
le groupe Bacteroides (69,8 %), puis Fusobac-
terium (9,9 %). La répartition des espèces est
détaillée sur le graphique 1 ci-après.
L’ antibiothérapie des infections à anaérobies
Apprécier l’activité des anti-infectieux sur les
anaérobies est problématique, techniquement
difcile et coûteux. Une appréciation adéquate
de la sensibilité des bactéries aux antimicrobiens
disponibles est donnée par la CMI (Concentrati-
on Minimale Inhibitrice) pour chaque couple bac-
térie/antimicrobien testé. Ainsi, depuis environ un
semestre, LABOKLIN utilise pour déterminer les
CMI une méthode de microdilution en bouillon, le
Micronaut -S anaérobies MIC (Sekisui Virotech).
Dans le graphique 2 sont rassemblés les résul-
tats des antiobiogrammes de cette série de 242
prélèvements.
L’amoxicilline + ac.clavulanique présente vérita-
blement une bonne efcacité (89,3 %), suivi loin
derrière par la pradooxacine et l’imipénème, ce
dernier étant de recours exceptionnel car faisant
partie de la réserve hospitalière humaine. Il est
à noter que des molécules éprouvées comme
la pénicilline et le métronidazole montrent ici un
taux de résistance élevé. Au vu des délais parti-
culièrement longs nécessaires à l’isolement puis
à l’identication des anaérobies, les infections
seront la plupart du temps traitées en l’absence
de documentation bactériologique. Baser un
traitement uniquement sur des données issues
d’études rétrospectives sans recourir à un an-
tibiogramme peut conduire à un échec théra-
peutique. L’antibiothérapie probabiliste mise en
place sans attendre les résultats des tests de
résistance pourrait aussi favoriser dans le futur
l’émergence de multirésistances, phénomène
déjà bien connu chez les Staphylocoques méti-R
SARM/SPRM et les Entérobactéries BLSE.
Graphique 1: Répartition des espèces bactériennes isolées
Graphique 2: Prols de résistance des anaérobies isolées
(n=242)
Anaérobies 2012-mars 2013 (n=242)
divers
Prol de résistance des anaérobies (n=242)
sensible
Métronidazole
Imipénème
Pénicilline G
Amox/Clavu.
Amoxicilline
Clindamycine
Ampicilline
Pradooxacine
intermédiaire résistant
LA_Anaerobier_FR.indd 1 23.05.13 14:53