Chapitre 1 Les acides aminés: Structures

Chapitre 1
Les acides aminés: Structures
Professeur Michel SEVE
Année universitaire 2009/2010
Université Joseph Fourier de Grenoble - Tous droits réservés.
UE1: Cycle 4 : Biomolécules (1) : Acides aminés et protéines

Qui suis-je ?
•Pharmacien, PhD en Biologie structurale, HDR
•Professeur en Biotechnologies à l’UFR de Pharmacie
•Praticien Hospitalier à l’Institut de Biologie et
Pathologie du CHU de Grenoble
•Enseignement: Biochimie, Biologie cellulaire et
biotechnologies en PACES, études de Pharmacie,
Licence et Maitrise en Biotechnologies-santé,
responsable de l’Ecole des biotechnologies à
l’Université Joseph Fourier et co-responsable du
Master européen Erasmus Mundus BioHealth
Computing.
•Recherche et activité hospitalière: Responsable de la
plateforme de protéomique Prométhée (CHU et
Institut Albert Bonniot). Développement de technique,
recherche et validation de biomarqueurs par des
approches de protéomique
Michel SEVE
Chapitre 1: Les acides aminés: Structures Introduction 2/41
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Les acides aminés: structures
Plan du cours
1. Les acides aminés: Définition et structure
2. Codage des acides aminés
3. Description des 21 acides aminés des protéines
3.1 Acides aminés à Chaines latérales aliphatiques
3.2 Acides aminés à Chaines latérales Hydroxylées, Soufrées ou hydrophiles
3.3 Acide aminé à Chaine latérale Cyclique
3.4 Acides aminés à Chaines latérales Aromatiques
3.5 Acides aminés à Chaines latérales Chargées positivement
3.6 Acides aminés à Chaines latérales Chargées négativement
3.7 Autres acides aminés et acides aminés modifiés
4. Les acides aminés essentiels
Chapitre 1: Les acides aminés: Structures Plan du cours 3/41

1. Les acides aminés: Définition
•Acides organiques contenant un groupement amine.
•Les plus communs des acides aminés sont les acides α-aminés
•Les plus communs des acides α-aminés sont ceux de la série L.
•Seulement 21 acides α-aminés L sont utilisés pour produire les
protéines (il existe en fait un 22ème acide aminé, la pyrolysine, chez
les bactéries méthanogènes).
Il existe quelques rares exceptions:
- Dans les protéines de la membrane bactérienne qui contiennent
quelques acides aminés de la série D (D-Alanine et D-glutamine)
- Des acides aminés modifiés comme l'hydroxylysine ou
l'hydroxyproline dans le collagène.
Chapitre 1: Les acides aminés: Structures 1. Les acides aminés: définition 4/41

Structure des acides α-aminés
R : Radical ou chaîne latérale.
Partie variable des AA.
Les acides α-aminés (AA) ont un motif structural
commun :
C
α
R
NH2
Groupe aminé
COOH
Groupe carboxyle
H
Dans les protéines : 21 groupes R  21 AA.
Molécule amphotère.
AAα  NH2 et COOH portés
par le même C.
C C C C C COOH
α β γ δ ε
Nomenclature
Chapitre 1: Les acides aminés: Structures 1. Les acides aminés: définition 5/41