Laurent FINET, Dorothée OXOBY

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Laurent FINET, Dorothée OXOBY
Lille
ORGANISATION STRUCTURALE DES
PROTEINES
Travaux des Actions Académiques Mutualisées
Niveau •Première STL-BGB
Thème du
programme
•1STL CBSV, Thème 1, chapitre 1.5: Les molécules des organismes vivants
présentent des structures et des propriétés spécifiques.
•1STL ANGLAIS TECHNO: écoute et/ou lecture d'un commentaire
d'animation.
Situations
pédagogiques
•AT de CBSV : Découverte des différentes structures des protéines à travers une animation
et un commentaire en anglais.
Liens
internet
•https://mywebspace.wisc.edu/jonovic/web/proteins/Proteins.swf
Compétences
B2i
•Domaine 1 : s'approprier un environnement informatique de travail.
•Domaine 3 : créer, produire, traiter , exploiter des données.
•Domaine 4 : s'informer et se documenter.
Matériels
TICE
•Un poste PC par binôme
•Une connexion internet
•Logiciel de traitement de texte
Mots clés •Acides aminés, structures primaire, secondaire, tertiaire, quaternaire, liaisons hydrogènes,
liaisons électrostatiques, intéractions hydrophobes, ponts disulfures...
Approfondir •structure des acides aminés, ionisation des acides aminés

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Animation 1 :
Animation 2 :
Schéma 1 :
Complément : une autre animation est disponible sur la transcription (de l’ADN à l’ARN):
http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/ADN_Prot/ADN_ARN/ADN_ARN.swf
Activité n° 1 Synthèse et structure primaire des
protéines
•Découvrir l'origine de l'enchaînement des acides aminés dans
la structure primaire des protéines.
Objectifs
•15 minutes
Durée
conseillée
•Cliquer sur l'image pour accéder à l'animation sur la structure des
protéines. Répondre aux questions ci-dessous en utilisant comme
support de réponse un document de type traitement de texte.
Consignes
Questions
1- A partir de l’animation n°1, quel est l’organite qui permet la synthèse des protéines
au sein des cellules ?
2- Que représentent les lettres sur l’ARN messager ?
3- L’enchaînement des acides aminés est-il dû au hasard ? Justifier.
4- A partir du schéma n°1 qui présente la liaison peptidique, citer les fonctions
chimiques mises en jeu dans la formation de cette liaison.
5- Comment sont classés les acides aminés dans la partie acides aminés de l’animation
2 ?

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Activité n° 2 Structure secondaire des protéines
•Comprendre le mécanisme de formation des deux structures
principales (hélice alpha et feuillet béta)
Objectifs
•15 minutes
Durée
conseillée
•Poursuivre l'animation n°1 et répondre aux questions ci-dessous en utilisant
comme support de réponse un document de type traitement de texte.
Consigne
Questions
1- D’après l’animation 2, quels sont les deux types d’organisation de structure
secondaire ?
2- Quelles sont les liaisons qui permettent la formation et le maintien de ces
structures ? Entre quels atomes se forment-elles ?
3- De quel type de liaison s’agit-il ?
4- Est-ce que les 4 types d’acides aminés sont impliqués dans ce type de liaison ?
5- Que signifie le terme « antiparallèle » ?

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Activité n° 3 Les structures tertiaire et quaternaire
•Comprendre le mécanisme de formation de la structure tertiaire.
Objectifs
•15 minutes
Durée
conseillée
•Poursuivre l'animation n°1 et répondre aux questions ci-dessous en utilisant
comme support de réponse un document de type traitement de texte.
Consigne
Questions
1- D’après l’animation 2 dans la partie structure des protéines, quel est le seul acide
aminé mis en jeu dans la formation du pont disulfure ?
2- De quel type de liaison s’agit-il ?
3- Justifier la localisation des domaines hydrophobes et hydrophiles.
4- Quelles sont les deux autres interactions mises en jeu dans la formation de la
structure tertiaire ?
5- Quels sont les acides aminés impliqués dans ces deux autres interactions ?
Justifier.
6- Quel est le but de la formation de ces différentes interactions ?
7- Décrire la structure quaternaire.