Identification et caractérisation fonctionnelle de T-linc1, un
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Identification et caractérisation fonctionnelle de T-LINC1, un ARN non codant de longue taille induit par le TGFβ dans le cholangiocarcinome intrahépatique A. Merdrignac INSERM UMR 991 1 Aucun conflit d’intérêt 2 Cholangiocarcinome intrahépatique (CCI) et voie TGFβ 2ème tumeur hépatique primitive Cancérogénèse mal connue Surexpression de TGFβ dans le stroma tumoral corrélée au pronostic du CCI Sulpice et al., Hepatology, 2013 Dualité des effets du TGFβ selon le contexte cellulaire: pro-oncogénique ou suppresseur de tumeur 3 ARN non codant de longue taille et voie TGFβ exemple dans le carcinome hépato-cellulaire: ARN non codant de longue taille lncRNA-ATB médiateur des effets prométastatiques du TGFβ Yuan et al., Cancer Cell, 2014 - ARN non codants de longue taille Non codant, > 100 à 200 nucléotides Impliqués dans multiples mécanismes cellulaires et voies de signalisation Dérégulés dans le cancer ARN non codants de longue taille: médiateurs de la voie TGFβ dans le CCI? 4 Profil d’expression génique de lignées cellulaires de CCI Gènes cibles de la voie TGFβ HuCCT1 Relative mRNA level phénotype épithélial - +/- TGFβ 12h microarrays + TGFβ HuH28 phénotype mésenchymateux * * HuCCT1 HuH28 >300 gènes communs * * HuCCT1 HuH28 Nouvel ARN lnc « T-LINC1 »: TGFβ induced long intergenic non coding RNA - TGFβ + p<0.001 ; FC>2 Relative RNA level * * HuCCT1 - TGFβ +TGFβ HuH28 * p<0.001 5 Identification de T-LINC 1, ARN non codant longue taille régulé par le TGFβ Niveau d’expression basal de T-LINC1 Relative mRNA level Inhibiteur TGFβRI diminue l’expression de T-LINC1 Relative RNA level Relative RNA level Activation endogène de la voie TGFβ dans HuH28 corrélée à un haut niveau d’expression de T-LINC1 Expression de T-LINC1 dans d’autres lignées cellulaires SMAD7 * T-LINC1 * - TGFβ * p<0.05 +TGFβ 6 T-LINC 1 est localisé dans le cytoplasme et le noyau +TGFβ Ribosondes T-LINC1 sens antisens -TGFβ Hybridation in situ, cellules HuCCT1 7 T-LINC1 est surexprimé dans les CCI humains Hybridation in situ sur tissue micro array Expression de T-LINC1 dans le stroma NT T Expression de T-LINC1 dans les cholangiocytes Relative RNA level * NT T Microdissection laser sur coupes de CCI congelées Ribosonde antisens T-LINC1 Relative RNA level * NT T 8 Régulation opposée de 21 gènes après gain et perte de fonction de T-LINC1 HuH28 Relative mRNA level HuCCT1 Relative RNA level L’analyse non supervisée d’expression de gènes après modulation de T-LINC1 identifie un réseau de gènes centré sur NEAT1 et IL8 * * * * p<0,01; FC<1,5 9 paraspeckles TGFβ Expression de T-LINC1 dans des corps nucléaires spécifiques (paraspeckles?) T-LINC1 Hybridation in situ, cellules HuCCT1 Imamura et al. Cancer Cell, 2014 10 T-LINC1 Nouvel ARN non codant de longue taille régulé par le TGFβ CCI et autres types cellulaires Surexprimé dans les CCI humains Localisé dans le cytoplasme et des corps nucléaires (paraspeckles?) Régule l’expression de NEAT1 et IL8 NEAT1 est nécessaire dans la structure des paraspeckles NEAT1 médie l’expression d’IL8 dans la réponse immunitaire Imamura et al., Cancer Cell, 2014 Pourrait être un régulateur positif de NEAT1 pour médier l’expression d’IL8 dans le CCI 11 Remerciements INSERM UMR 991 G. Angenard D. Bergeat A. Fautrel B. Turlin P. Loyer B. Clément Dr Sulpice C. Coulouarn Service de Chirurgie Hépatobiliaire et Digestive, CHU Rennes Pr Boudjema 12
