TRAVAUX DIRIGES DE BIOCHIMIE

UNIVERSITE JOSEPH FOURIER GRENOBLE I
MODULE BIO 241
Deuxième année de LICENCE
(L2, S4)
ANNEE 2012-2013
TRAVAUX DIRIGES DE BIOCHIMIE

TD BIO 241 2012-2013 AVANT-PROPOS
1
AVANT-PROPOS
Ce fascicule est organisé de façon à illustrer les différents thèmes abordés en cours
magistral et en travaux pratiques. La préparation personnelle des exercices qui
nécessite une maîtrise préalable du cours est vivement recommandée afin de tirer le
meilleur profit des séances de travaux dirigés.
La plupart des thèmes sont précédés de quelques rappels théoriques des notions
abordées en cours et qui vous seront utiles pour résoudre les exercices. En aucun
cas, ces rappels théoriques très succincts ne remplacent le cours.
Les thèmes 1 et 2 sont des révisions des notions que vous devez avoir acquises en
Licence 1ère année dans le module BIO 121. Les thèmes suivants illustrent
directement le programme abordé en Licence 2ème année dans le cadre de ce
module BIO 241.
CONTROLE DES CONNAISSANCES
Dans le cadre du module BIO 241, deux notes de contrôle continu et une note
d’épreuve terminale nous permettront d’évaluer vos connaissances. La première note
de contrôle continu (CC1) sera une note de travaux pratiques. Le deuxième contrôle
continu (CC2) sera réalisé sous forme d’un examen écrit (1h), au cours du semestre,
et portera sur des notions abordées en cours magistral et travaux dirigés. Enfin, une
épreuve terminale écrite (2h) se déroulera à la fin du module et portera sur
l’ensemble des connaissances devant être acquises dans ce module.
La note finale de l’UE = CC1(25%) + CC2(25%) + ET (50%)

TD BIO 241 2012-2013 AVANT-PROPOS
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EQUATIONS UTILES
Equation de Henderson-Hasselbalch
pH = pKa + log ([A-] / [AH])
Variation d’énergie libre dans les conditions non standard
G’ = Go’ + RT ln )
[B][A]
[D][C]
(
Variation d’énergie libre et potentiel redox
Go’ = - n F E0’
Potentiel redox dans une réaction d’oxydo-réduction
E0’ = E0’ (accepteur) – E0’ (donneur)
Equation de Michaelis-Menten
KM[S]
[S]
VV max0 
QUELQUES UNITES
Masse molaire, poids moléculaire, dalton
- Masse molaire : masse d’une mole de molécules de la substance, c’est-à-dire
la masse de 6,022.1023 molécules.
Elle s’exprime en g.mol-1.
- Poids moléculaire : correspond au rapport entre la masse d’une molécule de
la substance et le douzième de la masse d’un atome de carbone 12.
C’est un nombre sans dimension.
- Dalton : unité introduite pour définir la masse de certaines particules
biologiques pour lesquelles le terme de poids moléculaire est impropre.
Le dalton est le douzième de la masse d’un atome de carbone 12, soit
1/6,022.1023 grammes.
Les 3 modes d’expression font apparaître la même valeur numérique pour un
composé donné.
Exemple pour l’hémoglobine : on dira que cette protéine a un poids
moléculaire de 64 000, ou une masse molaire de 64 000 g.mol-1, ou encore
qu’une molécule de cette protéine possède une masse de 64 000 Da ou 64
kDa.

TD BIO 241 2012-2013 AVANT-PROPOS
3
TERME ABBREVIATION UNITE
Variation d’énergie libre
Potentiel redox
Vitesse initiale d’une réaction
Activité enzymatique
Activité spécifique
Vitesse maximale d’une réaction
Constante de Michaelis
Constante catalytique
Efficacité catalytique
G
E0
Vo
AE
AS
Vmax
KM
kcat
kcat / KM
J.mol-1
Volts (V)
mol.L-1.s-1 (ou M.s-1)
nmol.s-1 (nanokatals, nkat)
nkat.mg-1
mol.L-1.s-1 (ou M.s-1)
mol.L-1 (ou M)
s-1
s-1.M-1

TD BIO 241 2012-2013 RAPPELS
4
THEME N°1 : RAPPELS
CONCENTRATIONS
SPECTROPHOTOMETRIE
CONCEPT ACIDES / BASES FAIBLES