Qu`est-ce que le microbiote intestinal

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Présentation à l’Association Des Allergologues de la Région Toulousaine
28 mars 2015
Qu’est ce que le microbiote intestinal?
Simon NICOLAS
[email protected]
Equipe d’accueil dirigée par Rémy BURCELIN et Xavier COLLET
« Facteurs de risques intestinaux, diabète, dyslipidémie »
L’homme est un hybride!
Nous sommes davantage constitués de bactéries que de nos propres cellules.
Microbiote littéralement « petit vivant »
Cavité nasale
Cavité buccale
Tube digestif
Organes génitaux
Peau
Main sur une boite de pétri
C’est dans l’intestin que ce concentre la majeure partie des bactéries qui nous habite .
Le microbiote intestinal
Cela représente 1 à 2 kilos du poids du corps!
Bactéries
coques
Levures
bâtonnets
Virus
Champignons
Le microbiote intestinal est principalement constitué de bactéries mais il contient
également des virus, des levures et des champignons.
Où se trouve le microbiote intestinal?
La colonisation segmentaire de l’intestin.
Estomac
101-103 CFU/g
3 grands groupes bactériens majeurs (phyla).
• Les Firmicutes
Concentration croissante
• Les Bactéroidetes
Duodénum
104-105 CFU/g
Jéjunum/Iléon
108 CFU/g
Côlon
1012-1014 CFU/g
Fèces
1012-1014 CFU/g
L’outil de travail!
• Les Actinobactéria
Peut-on vivre sans microbiote?
Oui mais… Pas toutes les espèces et pas sans « effets secondaires »…
Isolateurs pour souris axéniques
Le microbiote participe activement à la maturation complète de l’organisme.
Comment le microbiote nous colonise-t-il?
La colonisation est inévitable!
Colonisation est un processus stochastique et chaque individu possède un microbiote unique.
L’allaitement
Anaérobies strictes ↗
Bifidobactéries
Lactobacilles
104 CFU/g
naissance
Relativement stable au cours du
temps en l’absence de maladies.
109 CFU/g
48h
Anaérobies facultatives
Streptocoques
Enterobactéries
Staphylocoques
1014 CFU/g
6 mois
2 ans
Augmentation de la diversité
Clostridiae
Diversification alimentaire
Mode d’accouchement
Traitements antibiotiques
Génétique de l’individu
Alimentation
Conditions d’hygiènes
Le microbiote est-il stable?
Le microbiote est pris « en tenaille »
Régime Alimentaire
de l’Hôte
Régime
standard
Système immunitaire
Intestinal
Régime
hyperlipidique
Microbiote
Epithélium
Rachel N. Carmody et al cell host microbe 2015
Lymphocytes
Cellules dendritiques
De quoi se nourrit le microbiote intestinal?
De bactéries mortes
D’acides biliaires
Aliments non digérés dans les parties
hautes de l’intestin (fibres, amidon,
protéines…)
De mucus et de
cellules mortes
La digestion de certains composants du régime par le microbiote n’est pas neutre elle peut
aboutir à la production de substances actives absorbables par l’hôte.
De quoi se nourrit le microbiote intestinal?
Formation d’une véritable « chaine alimentaire »
Fibre alimentaire
(pectine…)
Mucus
Bactéries
fibrolytiques
Bactéries
mucolytiques
fragments
Bactéries
fibrolytiques
Bactéries
glycolytiques
Acides gras à chaines courtes + H2
Bactéries
hydrogénotrophes
Gaz (méthane…)
Tiré de Bonnes bactéries et bonne santé, Gérard cortier
L’hydrolyse par le microbiote de certains composés issus du régime
alimentaire n’est pas sans effets.
Foie
Carnitine
Triméthylamine
Triméthylamine oxydée
Choline
Microbiote
Epithélium
Artère
Athérosclérose
L’hydrolyse par le microbiote de certains composés issus du régime
alimentaire n’est pas sans effets.
sucralose
aspartame
saccharine
Emulsifiants alimentaires
Fibres alimentaires et production d’acides gras à chaines courtes
Estomac
90% des apports caloriques quotidiens
Nutriments digestibles par l’Homme
(glucides, lipides, protéines)
5-8% des apports caloriques quotidiens
Acides gras à chaines courtes
Intestin grêle
Côlon
Des modifications du microbiote peuvent-elles impacter sa
production de métabolites?
Comparaison du microbiote d’enfants burkinabé avec celui d’enfants italien
Les acides gras à chaines courtes influencent le système immunitaire.
Acides gras à chaines courtes et allergie
extrait d’acariens
Fibres (Pectine)
Vaisseau sanguin
Inflammation
allergique
AGCC (Propionate)
Lumière intestinale
Epithélium
intestinal
La flore intestinale est-elle une cible thérapeutique?
Le microbiote
Les probiotiques
Les prébiotiques
Les antibiotiques
Les probiotiques sont des bactéries vivantes qui exercent un effet bénéfique sur la santé.
Un aliment présente un effet prébiotique s'il favorise la croissance ou l'activité des
bactéries intestinales bénéfiques à notre santé.
Nouvelle approche : la transplantation fécale
Réintroduire le microbiote d’un patient sain dans l’intestin d’un individu malade.
Modes d’administration :
La transplantation fécale
Sonde colique
Technique émergente utilisée dans le traitement des infections à Clostridium difficile.
Conclusions
Unique = carte d’identité d’un individu
Véritable organe complexe et riche
Microbiote intestinal
Interactions majeures avec l’hôte
Produit de nombreux métaboliques actifs
De nombreuses implications restent à découvrir…Gigantesque et
passionnant défi à relever !
Le microbiote est à la mode!
Source pubmed
Mullard A et al, Nature, (2008)
Longtemps ignoré par la communauté scientifique, le microbiote intestinale
est maintenant très étudié.
Merci de votre attention
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