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UNIVERSITE TOULOUSE III PAUL SABATIER
FACULTE DES SCIENCES PHARMACEUTIQUES
ANNEE : 2014 THESE 2014/TOU3/2018
THESE
POUR LE DIPLOME D’ETAT DE DOCTEUR EN PHARMACIE
Présentée et soutenue publiquement par
ROFES Camille
INTERETS DU MICROBIOTE INTESTINAL
ET PROBIOTIQUES
28 Mars 2014
Directeur de thèse : Mr Campistron Gérard
JURY
Président : Mr Campistron Gérard
1er assesseur : Mr Gairin Jean-Edouard
2ème assesseur : Mr Cussac Daniel
3ème assesseur : Mr Amouroux Noël

Intérêts du microbiote intestinal et probiotiques
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UNIVERSITE TOULOUSE III PAUL SABATIER
FACULTE DES SCIENCES PHARMACEUTIQUES
ANNEE : 2014 THESE 2014/TOU3/2018
THESE
POUR LE DIPLOME D’ETAT DE DOCTEUR EN PHARMACIE
Présentée et soutenue publiquement par
ROFES Camille
INTERETS DU MICROBIOTE INTESTINAL
ET PROBIOTIQUES
28 Mars 2014
Directeur de thèse : Mr Campistron Gérard
JURY
Président : Mr Campistron Gérard
1er assesseur : Mr Gairin Jean-Edouard
2ème assesseur : Mr Cussac Daniel
3ème assesseur : Mr Amouroux Noël

Intérêts du microbiote intestinal et probiotiques
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Remerciements :
Au jury de ma thèse :
A mon directeur de thèse, Mr Gérard Campistron d’avoir accepté de présider ce jury de
thèse et d’avoir suivi mon travail.
Aux membres du jury, Mr Gairin, Mr Cussac et Mr Amouroux, d’avoir accepté de juger mon
travail, et de venir siéger dans mon jury.
A mes parents :
Maman et Jean-Claude, Papa et Rose,
Je vous remercie de m’avoir permis de faire ces études et surtout de m’avoir poussé à m’y
engager. Merci de m’avoir supporté en première année et de m’avoir motivé tout au long
des autres examens !
A ma sœur :
Merci Cléclé d’avoir été là au quotidien pendant toutes mes études, de m’avoir donné tes
cours et astuces, de m’avoir soutenue et motivée ! Merci également pour nos moments
partagés.
A mes grands-parents :
Mamie Jo, Papy Jacques et Mamie Pap’, merci pour votre soutien notamment à travers vos
bons petits plats !
A Jérôme :
Merci de m’avoir encouragée et supportée pendant les périodes d’examens, où j’ai parfois
pu être pénible. Merci pour ton aide au niveau informatique pour cette thèse. Et enfin merci
d’être à mes côtés.
A mes amis :
Mayka, Rodrigue, Julie, Ben, Sarah, merci pour nos bons moments de complicité, nos
périodes de révisions pour les filles, nos repas et nos parties de jeu, vivement les prochaines.
Marion, Camille, Maëlle, merci pour nos moments partagés ensemble et le soutien que vous
m’avez apporté pendant ces deux années lors des examens et plus récemment pour la thèse.

Intérêts du microbiote intestinal et probiotiques
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Table des matières
INTRODUCTION ................................................................................................................ 7
LE MICROBIOTE ................................................................................................................ 9
1. DEFINITION ......................................................................................................................... 9
2. LES DIFFERENTS TYPES DE BACTERIES ......................................................................................... 9
Formes des bactéries : .................................................................................................. 10
Types de survie des bactéries ....................................................................................... 10
Coloration de Gram : ..................................................................................................... 11
3. COMPOSANTS DU MICROBIOTE INTESTINAL .............................................................................. 12
4. MISE EN PLACE DU MICROBIOTE INTESTINAL CHEZ L'ETRE HUMAIN ................................................ 14
A partir du génotype de l’hôte : ........................................................................................ 14
A partir de l’environnement : ............................................................................................ 14
Comparaison du microbiote chez des enfants nourris au lait maternel par rapport à des
enfants nourris avec des préparations industrielles : ....................................................... 16
Diversification alimentaire : .............................................................................................. 17
Modification du microbiote digestif avec l’âge : .............................................................. 18
5. BENEFICES DU MICROBIOTE INTESTINAL ................................................................................... 19
Rôle de barrière : ........................................................................................................... 19
Digestion des aliments : ................................................................................................ 19
Synthèse de facteurs vitaminiques : ............................................................................. 20
Développement du système immunitaire intestinal : .................................................. 21
6. INCONVENIENTS DU MICROBIOTE INTESTINAL : ......................................................................... 24
7. DOMAINES D’ACTION DU MICROBIOTE INTESTINAL A TRAVERS DES ETUDES CLINIQUES : ..................... 25
1. Obésité ....................................................................................................................... 25
2. Tabac ......................................................................................................................... 27
3. Stress .......................................................................................................................... 27
4. Allergie ....................................................................................................................... 28
5. Maladies inflammatoires chroniques de l’intestin .................................................... 31
6. Syndrome de l’intestin irritable ................................................................................. 32
PROBIOTIQUES ............................................................................................................... 34
1. DEFINITION ....................................................................................................................... 34
2. DECOUVERTE ..................................................................................................................... 35
3. NOMENCLATURE : .............................................................................................................. 36
4. IMPORTANCE DE LA CONCENTRATION DES PROBIOTIQUES : .......................................................... 36
5. PRODUCTION ..................................................................................................................... 36
6. RESISTANCE DES PROBIOTIQUES : ........................................................................................... 39
7. DANS QUELS ALIMENTS TROUVER DES PROBIOTIQUES ? .............................................................. 40
1. Le yaourt : .................................................................................................................. 40
2. Le fromage : ............................................................................................................... 41
3. La choucroute : .......................................................................................................... 41
4. Les grains de Kéfir : .................................................................................................... 41

Intérêts du microbiote intestinal et probiotiques
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5. Autres : ....................................................................................................................... 41
8. STATUT JURIDIQUE DU PROBIOTIQUE ...................................................................................... 42
En Europe : ........................................................................................................................ 42
 En France : .............................................................................................................. 43
Dans le monde : ................................................................................................................. 44
9. INTERET DES PROBIOTIQUES .................................................................................................. 44
Critères d’efficacité : ......................................................................................................... 44
Différents effets des probiotiques : ................................................................................... 45
 Amélioration de la digestibilité des protéines, du lactose et des nutriments ...... 45
 Synthèse de certaines vitamines ........................................................................... 46
 Rôle dans l’inhibition compétitive de l’adhésion des bactéries pathogènes ........ 46
 Régulation du transit intestinal ............................................................................. 47
 Rôle dans l’accompagnement d’un traitement par antibiotiques ........................ 48
10. RISQUES DES PROBIOTIQUES .............................................................................................. 49
ETAT DES LIEUX DES ETUDES CLINIQUES ETUDIANTS LES PATHOLOGIES POUVANT ETRE
AMELIOREES PAR UN TRAITEMENT A BASE DE PROBIOTIQUES ........................................ 49
Diarrhée infectieuse du nourrisson : .......................................................................... 57
Rôle contre l’eczéma atopique .................................................................................. 58
Prévention de l’entérocolite ulcéro-nécrosante du nourrisson : ................................ 58
 Rôle antitoxique : ................................................................................................... 60
 Rôle des probiotiques sur l’activité cérébrale ....................................................... 60
 Rôle dans les maladies comportementales ? ........................................................ 61
 Rôle dans la cirrhose hépatique :........................................................................... 61
QUELS PRODUITS TROUVER EN OFFICINE ?...................................................................... 63
CONSEILS GENERAUX SUR LA PRISE DE PROBIOTIQUES :.................................................. 74
CONCLUSION .................................................................................................................. 75
SOURCES .................................................................................................................................. 77