Communication/Signalisation • Organisme pluricellulaire • Objectif: conservation de l ’individu et de l ’espèce • Moyen: matière et énergie prélevées du milieu extérieur • Structure hiérarchisée • nécessité : des communications soit un échange d ’informations en relation avec l ’environnement – Coordination des changements adaptatifs – assurer le développement de l ’individu » Formation de l ’organisme à partir du zygote (conservation de l ’individu) » reproduction (conservation de l ’espèce) Communication/Signalisation • Société cellulaire – Organisme humain 10 000 milliards de cellules intégrées dans un réseau de communications • émission de signaux – provenant des autres cellules – destiné à d ’autres cellules – informant sur la matrice extracellulaire et sur le milieu extérieur Communication/Signalisation Survie différenciation division Mort 20% des gènes codent pour des protéines de la communication Communication/Signalisation Messager chimique Cellule émettrice réponse récepteur Cellule réceptrice Communication/Signalisation • Communication par voie nerveuse – transmission synaptique • Communication par voie humorale – transmission endocrine ou neuroendocrine • Communication par voie locale – transmission paracrine et autocrine Communication/Signalisation Locale Paracrine Autocrine Médiateurs locaux: Cytokines, NO, PG Communication/Signalisation circulation Cellule endocrine/neuroendocrine Cellule cible Messagers : hormones sécrétées dans le sang par les cellules endocrines et agissent à distance sur les cellules cibles la distance rend les communications assez lentes. la diffusion est large donc la spécificité doit être extrême Communication/Signalisation Messager: neurotransmetteur ou neuromédiateur, les faibles distances (messager/récepteur) sont responsables de la vitesse de communication Communication/Signalisation Communication par jonctions lacunaires Jonction GAP (connexons) Communication par les molécules d ’adhérences (juxtacrine) protéine CAM (cell adhesion molecules) intégrines, sélectines …. Communication/Signalisation Messager chimique X Cellule émettrice Réponse Y récepteur Cellule réceptrice Rétrocontrôle négatif ou positif (moins fréquent) Communication/Signalisation Messager chimique X Cellule émettrice Réponse Y récepteur Cellule réceptrice Rétrocontrôle par X Communication/Signalisation régulation Cellule émettrice 1 Cellule émettrice 2 Cellule émettrice 3 X Réponse Y récepteur Cellule réceptrice Messagers chimiques • Une cellule émettrice peut produire plusieurs messagers • Un même messager peut être impliqué dans différentes communications • Un messager impliqué dans un type de communication peut produire des effets différents selon le type cellulaire • Une cellule réceptrice peut produire les mêmes effets avec différents messagers Messagers chimiques • Les messagers interagissent avec des récepteurs membranaires ou cytoplasmiques – les molécules hydrosolubles avec les récepteurs membranaires • hormones peptidiques , cytokines, neurotransmetteurs…. – Les molécules liposoluble avec les récepteurs cytoplasmisques • hormones stéroïdes, thyroïdienne, rétinoïde, NO – Exceptions • les dérivés du tétrahydrocannabinol et certains stéroïdes ont des récepteurs membranaires – Conséquences • Les hormones liposolubles sont véhiculées dans le sang sous forme liées et leurs demi-vie est longue • Les hormones hydrosolubles sont sous formes libres leurs demi-vie est courte • seules les formes libres sont actives Messagers chimiques • La liaison d ’un messager à son récepteur active une voie de signalisation intracellulaire • Les messagers hydrophobes sur les récepteurs cytoplasmiques est directe par activation d ’un facteur de transcription – augmentation de la synthèse de protéine • Les messagers hydrophiles sur les récepteurs membranaires mettent en jeux des voie d ’activation intracellulaire complexe – modification des propriétés de canaux ioniques, du métabolisme, du cytosquelette • toutes ces modification affectent soit le métabolisme , la division la différenciation ou l ’apoptose des cellules Les récepteurs • Caractéristiques • spécificité, affinité,saturabilité,réversibilité, couplage • Deux groupes – les récepteurs nucléaires ou cytoplasmiques (solubles) – Les récepteurs membranaires Les récepteurs • Les récepteurs cytoplasmiques sont des facteurs de transcription activés par un ligand, ils forment une superfamille de récepteurs dont certains ne possèdent pas de ligand connu: les récepteurs orphelins • L ’activation de ces récepteurs cytoplasmiques entraîne une translocation nucléaire • un récepteur nucléaire est nommé par l ’initiale du ligand avant R pour récepteur • récepteurs aux glucocorticoïdes ou GR Les récepteurs membranaires • Récepteurs récepteurs ionotropiques • Récepteurs non canaux ioniques ou métabotropiques (une enzyme qui produit un second message) – RTK (enzyme intrinsèque) – (RCPG) Récepteurs couplés aux protéines G (enzyme associée) Les récepteurs membranaires • Récepteur transduisant le signal par l ’intermédiaire de protéine G • On estime que 40% des cibles pharmacologiques sont des RCPG signaux • Augmentation d ’AMPc • Diminution d ’AMPc • Augmentation d ’IP3 et de Ca++ Ligand Récepteur Transducteur Effecteur Second messager Les protéines G sont des hétérotrimères avec 3 SU , , . Une protéine G qui active la formation d'AMPC est une G stimulatrice ou Gs avec une SU Gs. Gs épinéphrine, glucagon, vasopressine. Le récepteur pour l'épinéphrine est le récepteur adrenergique Plusieurs récepteurs peuvent lier un même ligand et un même ligand peut stimuler différentes voies de signalisation Gs, sa liaison au GTP, activate l'Adenylate cyclase. Gi, sa liaison au GTP, inhibe l'Adenylate cyclase. Des effecteurs et récepteurs différents induisent les echanges de GDP des proteines G stimulatrices ou inhibitrices. Quelquefois G qui est libéré lors de l'échange est un effecteur qui interagit et active d'autres protéines. Small GTP-binding proteins include (roles indicated): initiation & elongation factors (protein synthesis). Ras (growth factor signal cascades). Rab (vesicle targeting and fusion). ARF (forming vesicle coatomer coats). Ran (transport of proteins into & out of the nucleus). Rho (regulation of actin cytoskeleton) All GTP-binding proteins differ in conformation depending on whether GDP or GTP is present at their nucleotide binding site. Generally, GTP binding induces the active state. hormone signal outside La SU de G fixe le GTP, et peut l'hydrolyser en GDP + Pi. GPCR plasma membrane AC GDP GTP GTP GDP cytosol ATP cAMP+PPi & sont modifiés par des lipides (ancres lipidiques) qui les fixent à la surface interne de la membrane Adenylate Cyclase (AC) est une protéine transmembranaire avec un domaine catalytique cytosolyque hormone signal outside GPCR Le complexe G inhibe G. plasma membrane AC GDP GTP GTP GDP cytosol ATP cAMP+PPi 1-Non activé Gest lié au GDP et les SU forment le complexe hétérotrimérique. hormone signal outside GPCR plasma membrane AC GDP GTP GTP GDP cytosol ATP cAMP+PPi 2. La liaison de l'hormone au RCPG correspondant induit un changement conformationel extracellulaire qui ce propage à l'interface de fixation de la protéine G intracellulaire. Le site nucleotide-binding site devient plus accessible dans le cytoplasme ou [GTP] > [GDP]. G libére GDP & fixe GTP (GDP-GTP exchange). hormone signal outside GPCR plasma membrane AC GDP GTP GTP GDP cytosol ATP cAMP+PPi 3. Substitution de GTP pour GDP provoque un autre changement conformationnel de G. G-GTP est libéré du complexe inhibiteur et peut activer une enzyme permettant la formation d'un second messager. hormone signal outside GPCR plasma membrane AC GDP GTP GTP GDP cytosol ATP cAMP+PPi 4. Adenylate Cyclase,activée par G-GTP, catalyse la synthèse d' AMPc. 5. Proteine Kinase A (cAMP Dependent Protein Kinase) catalyse la phosphorylationde nombreuses protéines et modifie leur activité. • ADP-ribose est transfére du NAD+ to à une arginine présente dans le site actif GTPase de Gs. • ADP-ribosylation empèche l'hydrolyse du GTP par Gs . • La proteine G stimulatrice est en permance activée et stimule la sécétion ionique et d'eau. La Pertussis toxine (coqueluche) catalyses l'ADPribosylation d'une cysteine Gi, elle devient incapable d'échanger le GDP pour le GTP • La voie inhibitrice est bloquée donc l'adénylate cyclase est augmentée et inhibe les sécrétions bronchiques . ADP-ribosylation est un mécanisme générale de régulation des protéines ADP ribosylation H O C protein NH2 O + N O P O CH2 O H H H H OH OH NH2 O N (CH2)3 NH C O NH O P O CH2 O H H H H OH OH NH2 O N N O P O CH2 N O O H H H H + NAD OH OH (nicotinamide adenine dinucleotide) N protein (CH2)3 NH Arg C residue NH2 NH2+ NH2+ N N N O P O CH2 O H H O H H OH OH H O ADP-ribosylated C protein NH2 + N H nicotinamide Les seconds messagers Adenylate Cyclase (Adenylyl Cyclase) catalyse: ATP cAMP + PPi NH2 cA M P N N certaines hormones à la surface d'une cellule catalysent la formation d'AMPc intracellulaire N N H2 5 'C 4 ' l'AMPc est considéré comme un second messager O H P O O H 3' O O- H H OH 2' 1' Phosphodiestérase catalyse cAMP + H2O AMP N N Les phosphodiesterases hydrolysent l'AMPc Le second messager stimule sa propre dégradation permettant un arrêt du signal NH2 cA M P N N H2 5 'C 4 ' O H P O O H 3' O O- H H OH 2' 1' Protein Kinase A (cAMP-Dependent Protein Kinase) transfert Pi de l' ATP à une Ser or Thr Protein Kinase A à l'état de repos est un complexe de • 2 SU catalytiques (C) • 2 SU régulatrices (R). et forme une structure quaternaire R2C2 Chaque SU régulatrice contient une séquence pseudosubtrat qui mime le domaine substrat d'une proteine mais avec une Ala substituant Ser/Thr. Ce pseudosubstrat de R qui ne peut etre phosphorylé est lié au site actif de la SU C et ainsi bloque son activité R2C2 + 4 cAMP R2cAMP4 + 2 C Quand R fixe 2 AMPc il y changement conformationnel et libération de la SU C La SU peut ainsi catalyser la phosphorylation de Ser/Thr des protéines cibles. PKIs, Protein Kinase Inhibitors, modulent l'activité de la SU catalytique . Phosphatidylinositol Signal O O R1 C H2C O O C CH H2C R2 O O P O O OH 2 phosphatidylinositol H H 1 6 H OH OH H OH 5 H 3 H 4 OH O O R1 C H2C O O C CH H2C R2 O O P O O OH 2 H PIP2 phosphatidylinositol4,5-bisphosphate H 1 H OH 3 H 6 OH H 4 OPO32 5 H OPO32 Kinases catalysent le transfert de Pi de l'ATP en position 4 et 5 de l'inositol pour former phosphatidylinositol4,5-bisphosphate (PIP2). PIP2 est hydrolysé par la Phospholipase C. O Différentes formesde PLC ayant différents domaines de régulation peuvent etre impliquées G-protein, Gq active une forme de PLC O R1 C H2C O O C CH H2C cleavage by Phospholipase C R2 O O P O O OH 2 H PIP2 phosphatidylinositol4,5-bisphosphate H 1 6 H OH OH H 3 H OPO32 5 H 4 OPO32 Quant un RCPG est activé il échange le GDP pour du GTP et le complexe Prot Gq GTP active la PLC Ca++, est nécessaire à l'activité de la PLC OPO32 H OH 2 H 1 6 H OH OH H 3 H OPO32 O 5 H 4 OPO32 IP3 inositol-1,4,5-trisphosphate R1 O H2C C O CH H2C O C R2 OH diacylglycerol Hydrolyse de PIP2, catalysée par Phospholipase C, produit 2 second messagers: inositol-1,4,5-trisphosphate (IP3) diacylglycerol (DG). Diacylglycerol, avec Ca++, activent la Protein Kinase C, qui catalyse la phosphorylation de nombreuses protéines intracellulaires Ca++ calmodulin Ca++-release channel IP3 ++ Ca endoplasmic reticulum Ca++-ATPase ATP ++ ADP + Pi Ca IP3 active Ca++-release channels dans la membrane du réticulum. Ca++ stocké est libéré dans le cytoplasme et aide à l'activation de la Proteine Kinase C. Signal turn-off diminution du Ca++ du cytoplasme via les Ca++-ATPase pompes, & degradation de IP3. Cellules photoréceptrices segment interne synthèse des molécules mises en jeu dans la vision segment externe ≈ 2000 disques dans la membrane desquels se trouve la rhodopsine cône bâtonnet membrane pigments pigments membrane Les cellules photo-réceptrices sont situés dans le segment externe formés de disques empilés contenant la rhodopsine rétinal membrane Rhodopsine = protéine (opsine) + chromophore (rétinal) Récepteurs photoniques opsine rétinal Rhodopsine opsine + chromophore 11-cis-rétinal La rhodopsine protéine qui transforme l’énergie lumineuse en signal électrique hn Vertébrés = vision stimulation de la protéine G ‘transducine’ Bactéries = production d’énergie hn bactériorhodopsine gradient de H+ synthèse de l’ATP Rhodopsine : récepteur visuel des bâtonnets Opsine chaîne de 348 acides aminés formant 7 hélices trans- membranaires extrémité extra cellulaire Protéine trans-membranaire extrémité intra-cellulaire Récepteurs photoniques Bâtonnets = rhodopsine opsine rétinal Rhodopsine opsine + chromophore 11-cis-rétinal Le chromophore est le rétinal Aldéhyde de la vitamine A opsine rétinal lié par une base de Schiff à un groupement lysine de l’opsine H+ RCHO + H2N-(CH2)4cis-rétinal opsine RCH=NH-(CH2)4rhodopsine L’activation de la rhodopsine est due à la photo isomérisation du rétinal forme repliée rotation de 180° entre les carbones C11 et C12 temps de commutation ≈ picoseconde (10-12 s) Transformation du signal photonique en signal électrique à l’obscurité à la lumière GMPc rhodopsine inactive canaux ioniques ouverts (GMPc) -40 mV photo-isomérisation du rétinal hydrolyse du GMPc fermeture des canaux ioniques -80 mV blocage des cations passage des cations = dépolarisation hyperpolarisation fermeture des canaux ioniques Na+ potentiel récepteur La famille des protéines G hétérotrimériques comprend: Transducine, impliquée dans la détection de la lumière par la rétine G-proteins impliquées la transduction Et une grande famille de petites protéines G analogues à G alpha Structure tridimensionnelle à 2,8 Å de résolution, d'un cristal de rhodopsine. D'après Palczewski K., Kumasaka T., Hori T., Behnke CA., Motoshima H., Fox BA., Le Trong I., Teller DC., Okada T., Stenkamp RE., Yamamoto M., and Miyano M. (2000) Science 289, 739-45. Arrêt du signal Rapide Lent Hydrolyse des seconds messagers Turn off ou arrêt du: 1. G hydrolyse GTP to GDP + Pi. (GTPase). La presence of GDP sur G permet la liaison avec le comlexe inhibiteur . Adenylate Cyclase n'est plus activée 2. Phosphodiesterase catalyse l' hydrolyse de cAMP AMP. 2 O PO 3 H O H 2 O PO 3 O H H O H O H H H H 2 O PO 3 H IP 3 (3s te p s ) H O H O H H O H O H H +3P i H H H O H in o sito l désensibilisation Désensibilisation La stimulation du récepteur apres stimulation del'adenylate cyclase permet le recrutement de GRK2 à la membrane elle phosphoryle le récepteur et recrute bg c ce complexe recrute la PDE qui hydrolyse l 'AMPc et augmente la désensibilisation Organisation structurale des arrestines. Désensibilisation et pistes thérapeutiques Arrêt du signal : La desensibilisation intervient . Certains récepteur sont phosphorylés via des kinases spécifiques . Le récepteur phosphorylé peut être lié à une protéine la -arrestine, qui permet l'internalisation du récepteur par un processus d'endocytose clathrine dependant Proteines Phosphatases catalyse hydrolyse les phosphates associées par la PKA Endocytose clathrine dépendante • Puits et vésicules recouverts de clathrine Fig 13-6 83 Clathrine • Une sous-unité de clathrine = – 3 grosses chaînes + – 3 petites chaînes • Une sous-unité = un triskélion • Assemblage des triskélions en un panier d'hexagones et pentagones • Triskélions peuvent s'assembler spontanément en panier meme sans membrane 84 Clathrine • Manteau de clathrine (B) Deux triskélions chaînes lourdes en gris ou rouge chaînes légères en jaune (C) Cryo-électromicrophotographie Fig 13-7 (A) Ombrage au platine 86 Adaptine • • • • Protéine de manteau à clathrine Complexe multiprotéique Lie la clathrine à la membrane Piège les protéines transmembranaires dont les récepteurs qui capturent les cargos solubles • Au moins 4 types d'adaptine pour les différents récepteurs de cargo 87 • Assemblage et désassemblage d'un manteau de clathrine – Les adaptines se lient à la clathrine et au complexe cargo/cargo-r – Dynamine = GTPase Fig 13-8 88 Rôle de la dynamine Fig 13-9 Puits à clathrine dans les cellules nerveuses de drosophiles shibire ayant une mutation du gène de la dynamine entraînant une paralysie. Anneau correspondant à la dynamine mutée 89 Perte du manteau • La vésicule quitte la membrane • Le manteau de clathrine est perdu immédiatement – intervention de chaperonne de la famille des hsp70 (ATPase) – auxilline active l'ATPase • La vésicule doit attendre d'être constituée pour que le manteau se retire 90 Spécificité du manteau • Mécanismes généraux identiques • Mais chaque membrane a ses spécificités – membrane plasmique (riche en cholestérol) : nécessité de beaucoup d'énergie – autres membranes : existence de bourgeonnements 91 Deux modèles 1-RCPG produisent leurs vésicules 2-RCPG colocalisent avecdes vésicules préxistants Si le modèle 1 est correct, l’activation va conduire à la formation de nouvelles zones ponctuelles qui vont apparaître colorées en vert (dans le cas où elles ne contiennent que la b-arrestine 2-GFP) ou en jaune (en cas de colocalisation avec RFP-Eps-15) dans une image superposée. Si le modèle 2 est juste, on s’attend à ce que la b-arrestine 2GFP s’accumule en totalité dans les puits recouverts préexistants, dont la coloration apparente va passer du rouge au jaune après superposition Vrai si EPS15 marque de facon stable l'endocytose constitutive