La structure des protéines I

La structure des protéines I
Pr Eric Chabriere
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Les protéines peuvent avoir plusieurs fonctions
-Catalytique (enzyme)
-Reconnaissance moléculaire (anticorps)
-Transport (hémoglobine)
-Structurale (collagène)
En raison de leur implication dans le vivant, leur étude est importante en médecine
(médicament: un enantiomere peut être un medicament alors que l’autre peut être
toxique).
Par leurs activités: reconnaissance moléculaire, enzyme, nanotechnologie … Elles ont
de très nombreux intérêt en biotechnologie.
De plus par leurs structures, elles livrent des informations cruciales sur l'évolution du
monde vivant (relation bruité au niveau de la séquence) et sur les mécanismes du vivant
L'étude des protéines est à la fois utile
en recherche appliquée et en recherche fondamentale

La structure des protéines se décompose en 4 parties
•La structure primaire.
La structure primaire est la séquence en acide aminé.
Elle est codée par le génome.
•La structure secondaire
La chaine polypeptidique adopte des repliements préférentiels. Hélice ou
feuillet. 80% de precision
•La structure tertiaire
La chaine polypeptidique se replie en domaines plus ou moins globulaires.
Prediction facile si un modèle existe déjà (similarité de sequence).La
bioinformatique n’est pas suffisante, l’etude de la structure est essentielle
•La structure quaternaire
Plusieurs chaines polypeptidiques (différentes ou non) s'associent.
Oligomères, homo-oligomère. Formation de complexes.
Parfois, il faut aussi l'ajout d'autres groupes prosthétiques. (Cofacteurs,
métaux,…).
Pour garder l'intégrité de la fonction, il faut que le repliement soit correct donc que
la structure soit conservée.

La structure primaire

La chaîne peptidique:
Une protéine est un hétéro-polymère linéaire d’acides
aminés. Cette chaine est codée par le génome
Séquence du gène
Séquence de la protéine en acide aminé
(chaîne peptidique)
La plupart des séquences des protéines sont connues (génomique systématique)