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Sommaire
I
Sommaire
INTRODUCTION GENERALE ......................................................................................................................... 1
I - ETUDE BIBLIOGRAPHIQUE ...................................................................................................................... 5
INTRODUCTION ................................................................................................................................................... 5
1-LA PIERRE ET LES MICROORGANISMES ....................................................................................................... 7
1.1-Facteurs influençant la colonisation de la pierre par les microorganismes ou bioréceptivité de la
pierre ......................................................................................................................................................... 8
1.1.1-Propriétés physico-chimiques des pierres ................................................................................................... 8
1.1.2-Facteurs environnementaux ........................................................................................................................ 9
1.2-Les colonisateurs de la pierre ....................................................................................................... 10
1.2.1-Les différents colonisateurs ...................................................................................................................... 11
1.2.2-Les méthodes d’adaptation des microorganismes à la pierre et son environnement ................................. 16
1.2.3-Conclusion ................................................................................................................................................ 18
2-ETUDE DE LA BIODIVERSITE..................................................................................................................... 20
2.1-Les méthodes microbiologiques et biochimiques .......................................................................... 21
2.2-Les techniques basées sur la biologie moléculaire ....................................................................... 22
2.3-La RFLP, méthode de biologie moléculaire .................................................................................. 26
2.3.1-Extraction de l’ADN de l’échantillon environnemental ............................................................................ 27
2.3.2-Amplification par PCR et choix des amorces ........................................................................................... 28
2.3.3-Clonage et identification phylogénétique.................................................................................................. 32
2.4-Conclusion..................................................................................................................................... 33
3-LES PROCESSUS DE BIODETERIORATION DE LA PIERRE ............................................................................. 36
3.1-Importance de l’eau ...................................................................................................................... 36
3.1.1-Action directe de l’eau .............................................................................................................................. 37
3.1.2-Action indirecte de l’eau ........................................................................................................................... 38
3.2-Détérioration de la pierre par les microorganismes ..................................................................... 41
3.2.1-Effets de la croissance des microorganismes sur la pierre ........................................................................ 41
3.2.2-Les effets de la pigmentation des microorganismes sur la pierre .............................................................. 42
3.2.3-L’action des exo-polysaccharides dans la biodétérioration de la pierre .................................................... 42
3.2.4-Sécrétions d’acides par les microorganismes et solubilisation de la pierre ............................................... 43
3.3-Le rôle des sels marins .................................................................................................................. 45
3.3.1-Processus chimiques de la détérioration de la pierre en présence des sels marins .................................... 45
3.3.2-L’environnement marin et la biodétérioration .......................................................................................... 46
3.4-Les méthodes d’étude de la biodétérioration de la pierre ............................................................. 48
3.5-Conclusion sur la biodétérioration de la pierre ............................................................................ 49
4-TRAITEMENTS ET PROTECTION DE LA PIERRE ........................................................................................... 53
4.1-Traitements curatifs....................................................................................................................... 53
4.2-Méthodes préventives .................................................................................................................... 53