Sujet : Analyses phénotypiques et moléculaires de bactéries isolées

Sujet : Analyses phénotypiques et moléculaires de bactéries isolées de parois de deux sites
préhistoriques ornés classés au patrimoine mondial
Ce sujet de master recherche s’inscrit dans la suite du projet collaboratif GAODETER
« Implication de sels et de microorganismes dans la détérioration de grottes et d’abris ornés » entre
le groupe BCMI (Biofilms et Comportement Microbien aux Interfaces) du laboratoire ERRMECe--‐
EA1391 et le LRMH (Laboratoire de Recherche sur les Monuments Historiques). Ce projet a obtenu le
soutien financier du LabEx Patrima et du Ministère de la Culture et de la Communication. La roche
des parois des grottes et abris ornés de la préhistoire subit des altérations liées à des processus
physicochimiques mais également liés à l’activité biologique des microorganismes. Ces altérations se
caractérisent par des écaillages, desquamations, pertes de matière par désagrégation, apparition
d’efflorescences et développement de biofilm créant des problèmes majeurs de conservation tels
que la perte ou le recouvrement d’informations archéologiques. L’objectif du programme GAODETER
visait à déterminer la part des processus biologiques dans la formation et l’accumulation de sulfates
sur les parois d’une grotte et d’un abri ornés proches géographiquement. Dans les premières étapes
du projet, des microorganismes susceptibles d’être impliqués dans la cristallisation du soufre ont été
isolés à partir de deux sites préhistoriques inscrits sur la liste du Patrimoine Mondial et identifiés : la
grotte du Sorcier sur la commune de Saint-Cirq et l’abri de Laugerie-Haute-Est sur la commune des
Eyzies de Tayac-Sireuil. Le sujet de Master Recherche proposé porte sur la caractérisation de ces
isolats : étude de leur capacité à adhérer et former des biofilms in vitro, recherche par approche
moléculaire de marqueurs métaboliques impliqués dans les voies de métabolisation du soufre chez
ces mêmes microorganismes.
L’étudiant(e) en Master Recherche recruté devra avoir des compétences en microbiologie et
en biologie moléculaire. Les principales approches utilisées seront l’étude de la croissance
bactérienne en culture planctonique et en biofilm des isolats à différentes températures et dans
différents milieux de culture, l’observation des biofilms par imagerie ainsi que la recherche par PCR
de marqueurs métaboliques des voies de métabolisation du soufre. Le stagiaire sera basé à Cergy-
Pontoise dans le laboratoire ERRMECe.
Responsables de stage : Agnès Mihajlovski (agnes.mihajlovski@u-‐‐cergy.fr, ERRMECe).
Laboratoire ERRMECe, Université de Cergy--‐Pontoise.
Ces travaux seront menés en collaboration avec le LRMH, ministère de la culture, situé à Champs-sur-
Marne.