Ch. 3 Les molécules Thème : La santé Les atomes sont rarement à l'état isolé dans la nature. Ils se groupent pour former des molécules : assemblages d'atomes comportant de deux à plusieurs milliers d'atomes. I_ Les molécules 1°) Liaison chimique Deux atomes peuvent mettre en commun des électrons pour former une ou plusieurs liaisons. Les molécules les plus simples comportent deux atomes : H2 ; O2 ; N2 ; HCl … La mise en commun de 2 électrons par 2 atomes (un chacun) conduit à la formation d'une liaison appelée liaison covalente. Les atomes les plus rencontrés dans les molécules du vivant comportent un nombre fixe de liaisons qu'ils peuvent engager : doc 14 p 58 Symbole H C N O F Cl Nom hydrogène carbone azote oxygène fluor chlore Nombre de liaisons 1 4 3 2 1 1 2°) Représentation des liaisons entre atomes Pour représenter ces liaisons, on dessine un trait entre les symboles des deux atomes : H – H ; O = O ; N ≡ N ; H – Cl ; H – O – H ; O = C = O … On utilise des modèles moléculaires. Chaque trait entre deux symboles d'atome représente donc deux électrons mis en commun. 3°) Formule brute d'une molécule Elle indique la nature des atomes qui composent une molécule ainsi que leur nombre. Exemples: l'éthanol (alcool à brûler) a pour formule brute: C2H6O l'acide éthanoïque (ou acétique) a pour formule brute: C2H4O2 . 4°) Formule développée On représente toutes les liaisons entre les atomes de la molécule. Exemples: Ethanol Acide éthanoïque H H H C C O H H H H H O C C O-H H 5°) Formule semi-développée On représente toutes les liaisons entre atomes de la molécule sauf celles avec des atomes d'hydrogène. Exemple: l'éthanol a pour formule semi-développée: CH3 – CH2 – OH L'acide éthanoïque a pour formule semi-développée: O // CH3 – C \ OH 6°) Molécules isomères Deux molécules sont isomères lorsqu'elles ont même formule brute mais des formules développées (ou semi-développées) différentes. Exemple: La formule brute C2H6O correspond à 2 molécules isomères: Ethanol Méthoxy-méthane H H H C C O H H H H H H C H O C H H II_ Structure des molécules organiques Les molécules organiques sont constitutives du vivant et comportent essentiellement des atomes de carbone, d'oxygène, d'azote et d'hydrogène. Elles comportent un squelette formé d'atomes de carbone sur lesquels sont fixés un ou des groupes fonctionnels qui donnent à la molécule ses propriétés chimiques. 1°) Squelette carboné Exemple : la molécule d'éthanol CH3 – CH2 – OH Son squelette comporte deux atomes de carbone liés entre eux dont un porte le groupe caractéristique – OH hydroxyle. Remarque : le squelette carboné peut contenir d'autres atomes que des atomes de carbone (ex du méthoxy-méthane plus haut). Le squelette carboné peut être ramifié : H3C – CH2 – CH – CH2 – CH3 | CH3 CH3 | H3C – C – CH2 – CH3 | CH3 2-méthylpentane 2,2-diméthylbutane Ou cyclique : cyclohexane CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 CH2 2°) Groupe fonctionnel Le tableau ci-dessous rassemble quelques groupes fonctionnels rencontrés dans les molécules organiques Nom Groupe caractéristique Exemple Hydroxyle -OH CH3 – CH2 – OH Ethanol (alcool à brûler) Carboxyle -COOH O // -C \ OH CH3 – COOH Acide éthanoïque Ester R-COO-R' O // R–C \ O–R' CH3 – COO- CH2 – CH3 Ethanoate d'éthyle Amines -NH2 CH3 – NH2 Méthanamine Amide -CO-NH2 O // -C \ NH2 CH3 – CO – NH2 Ethanamide Aldéhyde R-CHO O // -C \ H CH3 – CHO Ethanal Cétone R-CO-R' CH3 – CO – CH3 propanone ou acétone R \ C=O / R'