Titre Etude du rôle de la phosphorylation et de l’acétylation des protéines dans la virulence d’Acinetobacter baumannii. Présentation de l'établissement recruteur Le laboratoire Polymères, Biopolymères, Surfaces (PBS - UMR CNRS 6270), Université de Rouen, est composé de 4 équipes, regroupant 21 enseignants-chercheurs, 8 chercheurs, 11 ingénieurs/techniciens et 23 doctorants. L’équipe Biofilms, Résistance, Interactions cellules-Surfaces (BRICS) du laboratoire PBS, travaillant dans le domaine de la protéomique des biofilms, bénéficiera en octobre 2013 d’une allocation de recherche pour une thèse de l’Université de Rouen. L’étudiant(e) travaillera sur la caractérisation de modifications post-traductionnelles d’Acinetobacter baumannii. Description du poste à pourvoir : Parmi les centaines de modifications post-traductionnelles, la phosphorylation et l’acétylation sont les deux modifications les plus importantes, contrôlant de nombreuses voies biochimiques et réponses physiologiques. Chez les bactéries, la phosphorylation (acides aminés sérine, thréonine, tyrosine, histidine et acide aspartique) et l’acétylation (N-terminal, lysine) des protéines joue un rôle critique dans de nombreux processus cellulaires comme la traduction du signal, l’adaptation, la résistance au stress ou encore la virulence. Malgré l’importance du rôle de ces modifications chez la bactérie, leurs caractérisations demeurent de vrais challenges (réversibilité, labilité, faible abondance…). Acinetobacter baumannii est devenu ces dernières années un agent pathogène majeur, en raison de l’augmentation importante du nombre d’épidémies nosocomiales dont il est responsable et de l’apparition de souches multi-résistantes aux antibiotiques. Malgré des taux de mortalité en constante augmentation, peu de déterminants de la virulence ont été décrits chez cet organisme. A notre connaissance, malgré la menace croissante que représente le pathogène A. baumannii, aucune étude ne s’est intéressée à son phosphoprotéome et à son « acétylprotéome ». Le sujet de thèse proposé s’inscrit dans cette problématique et portera sur la caractérisation des protéines phosphorylées et acétylées chez la bactérie A. baumannii par une approche protéomique. Pour ce sujet de recherche, le doctorant aura accès, d'une part au savoir-faire de l'équipe BRICS (laboratoire PBS, UMR 6270 CNRS), spécialiste en microbiologie, et d'autre part aux équipements de la Plate-Forme de Protéomique PISSARO de l'IRIB de Rouen (http://plateauproteomique.crihan.fr/ptp/home) équipée, entre autres, de systèmes de séparation de protéines, de quatre spectromètres de masse (trappe ionique, Q-TOF, MALDI-TOF/TOF, LTQ Orbitrap Elite), et de logiciels d’identification de protéines… Profil du candidat : Le candidat recherché, de formation physico-chimie ou biochimie, ayant eu son Master 2 cette année, possédera une bonne connaissance en spectrométrie de masse et en chimie analytique des protéines. Une expérience en microbiologie serait un plus. Les candidats devront adresser un CV détaillé et une lettre de motivation par e-mail. Une audition aura lieu courant mai 2013. Contact : Julie Hardouin (Maître de conférences, Université de Rouen) [email protected] http:// http://pbs.labos.univ-rouen.fr/