La Loi de Dieu. Histoire philosophique d’une alliance, Paris, Gallimard, 2005, 398p. ; Paris, Gallimard (Folio-essais), 2008,
572p. [traductions en anglais, portugais, brésilien, slovène, espagnol, italien, polonais, allemand]
Au moyen du Moyen Age. Philosophies médiévales en chrétienté, judaïsme, islam, Chatou, La Transparence, 2006, 317p. ;
Paris, Flammarion (Champs), 2008. [traductions en anglais, brésilien, espagnol]
Du Dieu des chrétiens et d’un ou deux autres, Paris, Flammarion, 2008, 256p. ; (Champs), 2009. [traductions en italien,
anglais, tchèque, espagnol]
Image vagabonde. Essai sur l’imaginaire baudelairien, Chatou, La Transparence, 2008, 144p.
Les Ancres dans le ciel. L’infrastructure métaphysique, Paris, Seuil, 2011, 139p. ; Flammarion (Champs), 2013 [traductions
en catalan, italien, brésilien, anglais]
Le Propre de l’homme. Sur une légitimité menacée, Paris, Flammarion, 2013, 259p. ; (Champs), 2015. [traductions en
espagnol, anglais, tchèque]
Modérément moderne, Paris, Flammarion, 2014, 380p. [traductions en anglais, espagnol, polonais]
Le Règne de l’homme. Genèse et échec du projet moderne, Paris, Gallimard, 2015, 403p. [traduction en espagnol]
Où va l’histoire ? Dilemmes et espérances, entretiens avec G. Brotti, Paris, Salvator, 2016, 182p. [traductions en italien et
espagnol].
Recueils inédits en français
(avec P. Koslowski) Vaterland Europa, Europäische und nationale Identität im Konflikt, Passagen Verlag, Vienne, 1997,
77p.
El passat per endavant, traduction catalane par J. Galí y Herrera, Barcelone, Barcelonesa d'edicions, 2001, 184p.
Contro l’umanismo e il cristianismo. Il perdono dell’Occidente, a cura di E. Grimi, Sienne, Cantagalli, 2015, 333p.
Traductions
(De l’allemand et de l’anglais) Leo Strauss, Maïmonide. Essais recueillis et traduits, Paris, P.U.F., 1988, 376p.
(De l'arabe) Maïmonide, Traité de logique, Paris, DDB, 1996, 158p.
(De l'anglais et de l'hébreu) Shlomo Pinès, La Liberté de philosopher. De Maïmonide à Spinoza, Paris, DDB, 1997, 484p.
(De l'hébreu et de l'arabe) Thémistius, Paraphrase de la Métaphysique d'Aristote, Livre Lambda, Paris, Vrin, 1999, 175p.
(De l'arabe) Maïmonide, Traité d'éthique, Paris, DDB, 2001, 186p.
(De l’arabe) Razi, La Médecine spirituelle, Paris, Garnier-Flammarion, 2003, 206p.
Directions d’ouvrages collectifs
(avec J.-F. Courtine) Herméneutique et ontologie. Mélanges en l'honneur de P. Aubenque à l'occasion de son 60e
anniversaire, P.U.F., Paris, 1990, XXI-388p.
Saint Bernard et la Philosophie, P.U.F., Paris, 1993, 195p.
(avec T. Schabert) Die Macht des Wortes, ERANOS, N.F., Bd. 4, Munich, Fink, 1996, 347p.
(avec M. Morange), Le Progrès, Parole et Silence, 2012, 168p.
Culture et Evangélisation. 2016 : Le Sens spirituel des cultures, Paris, Parole et Silence, 2016, 141p.
Éditions
P. Kraus, Alchemie, Ketzerei, Apokryphen im frühen Islam. Gesammelte Aufsätze, Hildesheim, Olms, 1994, XIII-346p.
I. Goldziher, Sur l’islam. Origines de la théologie musulmane, Paris, DDB, 2003, 290p.
Environ 120 articles et contributions à des ouvrages collectifs.