Introduction La fréquence de l`infection à Helicobacter

Introduction
La fréquence de l’infection à Helicobacter pylori (Hp) est élevée dans tous les
pays [96,162, 212, 246].
Une plus grande fréquence de l’infection à Hp a été observée dans les classes à
faible revenu et dans les régions à niveau de développement faible,
particulièrement en Afrique [96].
Au Sénégal, la prévalence hospitalière est estimée à 82% [146,147].
Aujourd'hui, l'éradication de Hp est clairement indiquée dans la maladie
ulcéreuse gastro-duodénale où elle modifie son histoire naturelle et, susceptible
de guérir le lymphome gastrique de type MALT. Elle ne semble pas réaliste
dans le but de prévenir l'adénocarcinome gastrique car le cancer de l’estomac est
multifactoriel. Par contre elle reste controversée dans la dyspepsie ulcéreuse.
Le traitement d’éradication de l’infection à Hp fait appel à une association
d’antibiotiques et son succès dépend de la sensibilité des souches [101].
Des études sur la sensibilité des souches de Hp effectuées en Europe, en Asie et
en Amérique ont montré l'apparition de résistances au fil du temps. Par contre
en Afrique, il existe peu de données concernant la sensibilité des souches de Hp
même si on estime que le taux de résistance doit y être élevé [81].
Au Sénégal, aucune souche de Hp n'avait été jusque là isolée par les laboratoires
de microbiologie.
Le but de notre étude est d’isoler et tester la sensibilité des souches de Hp vis-à-
vis des antibiotiques utilisés au Sénégal.
Pour ce faire nous nous proposons d'atteindre les objectifs suivants :
• Diagnostiquer l'infection à Hp au cours de la maladie ulcéreuse gastro-
duodénale ;
• Isoler et identifier Hp à partir des biopsies gastriques de malades
porteurs d'ulcère gastrique et duodénal ;
• Tester la sensibilité des souches isolées avec certains antibiotiques les
plus couramment utilisés dans les schémas d’éradication au Sénégal
( Imidazolés, Macrolides, Cyclines Amoxicilline) ;
• Evaluer le Clo-test
®
comme milieu de transport des biopsies pour la
culture.

I - Historique
La présence incidente de bactéries spiralées au niveau de l’estomac considéré
comme stérile du fait de son pH bas a été rapportée dans des observations
isolées très anciennes.
Ces bactéries ont d'abord été observées dans l’estomac des chiens puis des rats
et des chats à la fin du XIX
e
siècle.
Au début du XX
e
siècle, ces bactéries avaient été mises en évidence dans
l’estomac de patients atteints de cancer gastrique, puis chez des patients atteints
de pathologie ulcéreuse gastro-duodénale.
En 1954, les travaux de PALMER ED à partir de 1180 biopsies conclurent en
l’absence de spirochètes dans l’estomac [189], ceci avait mis un point final à la
théorie de l'infection chronique de l'estomac. Ainsi l’intérêt sur le sujet déclina
rapidement.
En 1975, STEER et COLIN JONES rapportaient la présence d’une bactérie à la
partie profonde de la couche de mucus chez des patients présentant un ulcère.
Mais la culture des biopsies aboutissait à l’identification de Pseudomonas
aeruginosa . Il s'agissait en fait d'une contamination des canaux à biopsie [221].
En 1979, Robert WARREN remarqua la présence de bactéries incurvées et
spiralées dans des biopsies d’estomac.
En 1982, il obtint avec Barry MARSHALL des colonies sur des cultures
oubliées pendant 5 jours dans l’incubateur. Les bactéries cultivées furent
dénommées successivement Campylobacter pyloridis en raison de leur
ressemblance avec Campylobacter jejuni, puis Campylobacter pylori ; et plus
tard le genre Helicobacter fut créé avec Helicobacter pylori ( Hp) comme chef
de file[155].
Ils posent alors l'hypothèse de son association à la gastrite et aux ulcères [250].
En 1984, ZANGENBERG et coll. montrèrent la production d'une grande
quantité d’uréase par Hp en culture.
En 1985, l'ingestion volontaire d'une suspension de 10
9
de Hp par MARSHALL
est suivie d’un syndrome dyspeptique aigu avec apparition d’une gastrite aiguë
sur les biopsies effectuées au dixième jour.
Ainsi la découverte du rôle pathogène de Hp pour la muqueuse gastro-duodénale
a bouleversé les conceptions sur la maladie ulcéreuse.

Et les multiples travaux effectués apportant un niveau de preuve scientifique
élevé ont entraîné une refonte complète de l'approche physiopathologique, des
implications diagnostiques et, du traitement de la MUGD .
La réduction des récidives ulcéreuses après éradication réussie renforce la
responsabilité de Hp dans la pathologie gastro-duodénale [143].
A partir de 1990, des conférences de consensus furent organisées ça et là pour
harmoniser les démarches des uns et des autres afin d'instaurer des schémas
diagnostiques et thérapeutiques consensuels.

II Caractères Bactériologiques
II-1 Taxonomie
Les classifications taxonomiques sont basées sur l’hybridation et le séquençage
de l’ARN ribosomal.
Hp fait partie d’un nouveau groupe taxonomique de bactéries caractérisées par
leur adaptation au mucus digestif de l’homme et des animaux..
Le genre Helicobacter appartient au Groupe VI des bactéries à Gram négatif qui
comprend 4 genres : Campylobacter - Arcobacter et Wolinella [124,155].
Le genre Helicobacter comprend une dizaine d'espèces chacune adaptée à la
muqueuse gastrique d'animaux différents(Tableau I ).
Tableau I : Caractères phénotypiques de 15 espèces d'Helicobacter [124].
Espèces
Hôte habituel GC% Nbre Fla
Ox
Cat Ure NO3
Red Pase
g Glut
Trans
4
Nal
Cft
H.pylori
H.mustelœ
H.felis
H.muridarm
H.acinonyx
H.nemestrinœ
H.fennelliœ
H.cinaedi
H.hepaticus
H.bilis
H.pulorum
H.pametensis
H.canis
F. rappini
H.heilmanii
Homme
Furet
Chat
Rongeurs
Guépard
Singe
Homme
(Intestin)
Homme
(Intestin)
Souris
Foie
Foie
Foie
Foie
Chien
Cosmopolite
Cosmopolite
35-37
36
42
10
30
24
35
37-38
NF
NF
34-35
38
48
34
NF
4-8 pol
4-8 per
14-20 pol
14 pol
2-5 pol
4-8 pol
2 pol
1-2 pol
2 pol
3-14 pol
1 pol
2 pol
2 pol
10-20 pol
x pol
+
+
+
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+
+
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+
NF
+
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+
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-
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NF
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NF
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-
NF
+
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-
NF
NF
-
+
+
-
NF
+
+
+
+
+
NF
-
-
NF
NF
NF
-
+
NF
R
S
R
R
R
R
S
S
R
R
S
S
S
R
NF
S
R
S
R
S
S
S
I
R
R
R
S
I
R
NF
GC % : pourcentage guanine - cytosine ; Fla : Flagelles ; NO3 Red : Nitrate réductase ;
Ox : Oxydase ; Cat : Catalase ; Ure : Uréase
g Glut Trans 4 : Gamma Glutamyl transpeptidase ; Nal : Acide nalidixique ;
Cef : Cefotaxime PAS :Phosphatase acide ; NF : Non fait
F rappini : Flexispira rappini

II - 2 Caractères morphologiques
Hp se présente sous forme d’un bacille à Gram négatif spiralé ou incurvé de 2,5
à 5 micromètres de long sur 0,5 à 1 micromètre de large ou sous forme coccoïde
dans les vieilles cultures.
Ces bactéries sont capables de se déplacer rapidement par frétillement et par des
mouvements de rotation caractéristique [216] grâce à des flagelles polaires
engainés.
Cette gaine résiste à l’acide donc protège la protéine de la flagelle.
A l’extrémité distale de ses flagelles on observe un disque ou bulbe que l’on
retrouve dans aucune autre espèce d’Helicobacter [106].
Figure1.Morphologie de Hp au microscope électronique
II - 3 Caractères culturaux
La culture se fait sur milieu spécifique, avec association de gélose, de plasma de
cheval et d’antibiotiques pour éviter la prolifération de germes buccaux ayant pu
contaminer les biopsies.
La culture est lente 2 à 7 jours en atmosphère microaérophile à 37°C sur la
gélose au sang pour la primoculture ou en 2 à 4 jours pour un repiquage.
La concentration d’oxygène optimale est de l’ordre de 3 à 5% (5% d’O
2
, 7% de
CO
2
, 8% de H
2
, 70% de N
2
et 10% autres gaz) [216].