Nom : Habert

Stage proposé par PATRAT Catherine
: Laboratoire d’Histologie – Embryologie – Biologie de la Reproduction
Hôpital COCHIN
123 bd de Port Royal
75014 PARIS
Téléphone : 01 58 41 15 71
Mail : [email protected]hop-paris.fr
Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : JOUANNET Pierre
(WOLF Jean-Philippe à compter du 01/09/2007)
Intitulé de l ‘équipe d’accueil : Equipe Epigenèse et Développement des Mammifères
Nom et adresse du Laboratoire ou de l’Unité :
Unité UMR 218 « Dynamique nucléaire et Plasticité du Génome » du CNRS
26 rue d’Ulm
75005 Paris
Téléphone : 01 42 34 66 91
Directeur du Laboratoire ou de l’Unité : ALMOUZNI Geneviève
Prénom et NOM du Responsable de l’équipe : Edith HEARD
Résumé du thème de recherche de l’équipe
L’inactivation du chromosome X constitue la thématique de recherche de l’équipe dirigée par Edith
Heard. Elle s’articule principalement autour de trois sujets :
- la mise en place de ce processus au cours du développement embryonnaire pré- et post
implantatoire chez la souris.
- L’organisation nucléaire existant au cours de la mise en place de l’inactivation du X.
- La détermination des régions du centre d’inactivation impliquées dans les différentes phases du
processus.
Le modèle d’étude des deux derniers axes du projet est principalement constitué par les cellules
souches embryonnaires murines.
Titre du projet de stage : Etude de l’impact épigénétique de la fécondation et culture in vitro chez la
souris en utilisant le modèle de l’inactivation du chromosome X
Responsable du stage : Catherine PATRAT – Tél : [phone] - [email protected]
Projet de stage :
L’inactivation du chromosome X, du fait de sa régulation épigénétique, constitue un excellent modèle
d’étude des anomalies éventuelles de la mise en place du programme d’expression génique qui
pourraient survenir au cours du développement d’embryons obtenus par FIV. L’objectif principal du
projet est d’étudier l’effet potentiel de la superovulation et la culture in vitro des gamètes et des
embryons sur la mise en place de l’inactivation du chromosome X au cours du développement pré-
implantatoire chez la souris. Les cinétiques d’expression du gène Xist et de différents gènes situés sur
le chromosome X seront étudiées par RNA-FISH. Les modifications des histones à type
d’hypoacétylation ou d’hyperméthylation, et du recrutement des protéines du groupe polycomb sur le
chromosome X paternel seront analysées par immunofluorescence. Ces techniques, seules ou
combinées, seront réalisées sur embryon unique à tous les stades du développement pré-
implantatoire (2, 4, 8 cellules, morula et blastocyste) et comparées à celles observées chez les
embryons conçus in vivo sans super ovulation (groupe contrôle). En autorisant une analyse directe sur
un seul embryon, elles permettront de s’affranchir de la variabilité inter embryonnaire et du mosaïsme
cellulaire et d’évaluer précisément les stades éventuellement critiques de la FIV, en ciblant sur la
fécondation et l’activation du génome embryonnaire.

Techniques mises en œuvre par le stagiaire :
Fécondation in vitro chez la souris
RNA FISH et/ou immunofluorescence et/ou DNA FISH sur embryons de souris
Publications du Responsable de stage au cours des 5 dernières années :
1. Patrat C., Serres C., Jouannet P. Progesterone induces hyperpolarization after a transient depolarization in
human spermatozoa. (2002) Biol. Reprod., 66, 1775-1780.
2. Papageargiou T., Guibert J., Goffinet F., Patrat C., Fulla Y., Janssens Y ? Zorn J.R. Percentile curves of
serum estradiol levels during controlled ovarian stimulation in 905 cycles stimulated with recombinant FSH
show that high estradiol is not detrimental to IVF outcome. (2002) Hum. Reprod., 17, 2846-2850.
3. Lepretre A.C., Patrat C., Jouannet P., Bienvenu T. Mutation analysis of the BOULE gene in men with
obstructive azoospermia : identification of a novel polymorphic variant in the black population (2004) Int. J.
Androl., 27, 301-3.
4. Aknin-Seifer I.E., Touraine R.L., Lejeune H., Jimenez C., Chouteau J., Siffroi J.P., McElreavey K., Bienvenu
T., Patrat C., Durand P., Paulhac S., Levy R. Is the CAG repeat of mitochondrial DNA polymerase gamma
(POLG) associated with male infertility? A multicentre French study (2005). Hum Reprod., 20, 736-740.
5. Lepretre A.C., Patrat C., Mitchell M., Jouannet P., Bienvenu T. No partial DAZ deletions but frequent gene
conversion events on the Y chromosome of fertile men. (2005) J. Assist. Reprod. Genet. 22, 141-8.
6. Buffat C., Patrat C., Merlet F., Guibert J., Epelboin S., Thiounn N., Vieillefond A., Lebon C., Lievin-Adda A.,
Jouannet P. (2006) ICSI outcomes in obstructive azoospermia: influence of the origin of surgically retrieved
spermatozoa and the cause of obstruction. Hum. Reprod., 21, 1232-1236 .
7. Hubert D., Patrat C., Guibert J., Thiounn N., Bienvenu T., Viot G.,. Jouannet P., Epelboin S. (2006)
Management of assisted reproductive techniques in men with cystic fibrosis. Hum. Reprod., 21, 1018-1024.
8. Patrat C., Auer J., Fauque P., Leandri R., Jouannet P., Serres C. (2006) Zona pellucida from fertilised
human oocytes induces a voltage-dependent calcium influx and the acrosome reaction in spermatozoa, but
cannot be penetrated BMC Dev. Biol., 6, 59.
9. Fauque P., Léandri R., Merlet F., Juillard J.C., Epelboin S., Guibert J., Jouannet P. and Patrat C. Pregnancy
outcomes of ART procedures according to embryonic factors. JARG (sous presse).
10. Fauque P., Guibert J., Jouannet P. and Patrat C. Successful delivery after the transfer of embryos obtained
from a cohort of incomplete in vivo matured oocytes at retrieval time Fert. Steril. (sous presse)
Autres informations
Etudiants actuellement en thèse ou en M2 dans l’équipe d’accueil. Pour chaque étudiant indiquez
le nom du responsable de thèse, l’année du début de la thèse et l’Ecole Doctorale de rattachement
Thèse (Ecole Doctorale numéro 426 : genes, genomes, cellules – Université Paris XI – Directeur : G.
Baldacci) :
Sandrine AUGUI (resp. Edith HEARD) année de début 2005
Neil MURPHY (resp. Edith HEARD) année de début 2007
M2 recherche
Elphège NORA (resp. Edith HEARD) 2006-2007
Etudiants ayant préparé ou soutenu leur thèse, leur DEA ou leur M2 dans l’équipe d’accueil au
cours des cinq dernières années. Pour chaque étudiant indiquez le nom du responsable de
l’étudiant, l’année du début de la thèse et de fin de la thèse, l’Ecole Doctorale de rattachement et le
devenir de l’étudiant.
Julie CHAUMEIL (resp. Edith HEARD) Thèse de sciences 2002-2006 (Ecole Doctorale numéro 426 :
genes, genomes, cellules – Université Paris XI – Directeur : G. Baldacci)
Sandrine AUGUI (resp. Edith HEARD) M2 recherche 2005- 2006
Cette proposition de stage s’adresse-t-elle spécifiquement à un étudiant scientifique, médecin
ou vétérinaire ou bien est-il ouvert à tous les profils ?
Ce sujet peut-il donner lieu à une thèse ?
Oui, avec la perspective d’un travail sur l’embryon humain