Habilitation à diriger des Recherches Marie Bodinier 2014

Habilitation à diriger des Recherches
Université de Nantes
Ecole Doctorale VENAM
Marie Bodinier
2014
« Etudes mécanistiques du système immunitaire pour
aider à la compréhension, au diagnostic et au
traitement de certaines pathologies notamment des
allergies alimentaires. »
UR 1268 BIA
Equipe Allergie
Rue de la géraudière BP 71627, 44316 Nantes cedex 01
Illustration issue de Gurumed, 11 fév. 2013 : Des cellules de notre système immunitaire se rappellent de
microbes qu'elles n'ont jamais rencontrés auparavant

1
SOMMAIRE
DOSSIER SCIENTIFIQUE……………………………………………………………….....4
Curriculum Vitae……………………………………………………………………………..5
Liste des publications…………………………………………………………………………9
Introduction……………………………………………………………………………….…15
I. Le système immunitaire....15
A. Deux systèmes 15
B. La reconnaissance par le système immunitaire..16
C. La médiation du système immunitaire.16
D. Les lymphocytes T
1.Les différents types de lymphocytes T et leur fonction16
2.Les récepteurs des lymphocytes T.19
II. Les Allergies Alimentaires
A. Généralités sur les allergies..21
1. Prévalence.21
2. Les allergies alimentaires..22
3. 23
B. Les mécanismes de la tolérance orale et 24
1. La tolérance .24
2. La réponse allergique26
3. Modèles cellulaires et animaux.29
a. Modèles cellulaires et organes ex vivo.29
b. Modèles animaux30
III. Des stratégies nutritionnelles pour lutter contre le.31
A. La stratégie des prébiotiques, des probiotiques et des synbiotiques ...31
B. La stratégie des p
Notice des titres et travaux retraçant les résultats les plus significatifs depuis le début de
carrière………………………………….……………………………………………………34
De 1998 à 2001 : Résultats marquants au cours de mon doctorat : les mécanismes associés
aux lymphocytes T CD8 dans le cancer et les infections virales..35
I. Etude 1 : Rôle du CD8 et du TCR dans la sélection des lymphocytes T anti-viraux...35
A. But et intérêt scientifique.35
B. Programme et méthode de recherche....35
C. Résultats
II. Etude 2 -viraux...36
A. Programme et méthode de recherche....36
B. Résultats37
III. Etudes collaboratives visant à développer des stratégies immuno-thérapeutiques pour
          -
peptide38
A. M...38
B. Résultats38

2
IV. Bilan du doctorat...39
De 2002 à 2003 : Expérience marquante au cours de ma carrière de chercheur hospitalier :
application potentielle des tétramères CMH-peptide en recherche fondamentale et en
recherche clinique39
De 2003 à maintenant : Résultats marquants obtenus au cours de ma carrière de chercheur à
: 40
I. Problématique de recherche.40
II. Etude des mécanismes des allergies alimentaires...42
A. Action 1 : Etude de la translocation des allergènes à travers l'épithélium
intestinal...43
1. Problématique .43
2. Résultats...44
B. Action 2 natifs ou modifiés sur le système
 in vivo ..46
1. Problématique 
2. 
C. Action 3 : Etude de la phase de déclenchement correspondant à la
dégranulation mastocytaire induite par les allergènes..48
1. Problématique 
2. Résultats.....49
D. Action 4 50
1. Problématique 50
2.  
E. Conclusion 
III. Prévention ou réduction de la réaction allergique par  : la stratégie des
53
A. Action 5 : Effet des prébiotiques sur le système immunitaire et la prévention
des allergies.53
1. Problématique 53
2. Résultats......54
B. Projet complémentaire aux prébiotiques: effets des fibres sur le système
immuni.56
1. ...56
2. .....57
C. Conclusion sur la prévention ou la réduction de la réaction allergique par
......58
Projet de recherche original pour l’avenir : « Compréhension des mécanismes
d’interaction de l’aliment (natif, modifié, supplémenté) avec le système immunitaire et la
barrière de l’intestin pour élaborer des stratégies pour agir sur les
allergies. »……………………………………………………………………………………60

3
I. Etude des mécanismes précoces de la réaction allergique engendrés par
60
A. Contexte60
B. Objectifs scientifiques.62
C. Méthodologie
D. Résultats attendus et retombées scientifiques 67
E. Projets envisagés pour réaliser cette étude....68
II. Stratégies nutritionnelles pour réduire ou prévenir les allergies
......................................................................................................69
A. Contexte
B. Objectifs scientifiques...70
C. Méthodologie
D. Résultats attendus et retombées scientifiques .....76
E. Projets envisagés pour réaliser cette étude76
III. Conclusion sur le projet de recherche original..78
Bibliographie………………………………………………………………………………...79
ACTIVITES D’ENCADREMENT…………………………………………………………93
1998 à 2003
2003 à maintenant
Liste des étudiants encadrés.95
I. Post-doctorats ...95
II. Thèses96
III. Masters..96
A. Master 
et des Techniques de Nantes.96
B. Master II INAPG- ENSIA Science des Aliments, Massy, ...96
C. Master II BBRT (Biologie, Biotechnologies et Recherche Thérapeutique), UFR de
Nantes96
D. Master II ENSA, Biologie Production animale et Qualité, UFR de Rennes97
E. Master I en « Biologie cellulaire, spécialité physiologie animale », UFR de Rennes..97
IV. Licence professionnelle97
ANNEXES……………………………………………………………………………………99
Annexe 1 : Organigramme de l’unité Biopolymères Interactions et Assemblages…….100
Annexe 2 : Liste des 5 publications représentatives de mes activités…………………...101

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DOSSIER SCIENTIFIQUE