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RAPPORT DE STAGE DE BACTERIOLOGIE ET
DE PARASITOLOGIE
Effectué au Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie
E.S.S.Agro.
Du 03 Août 2014 au 31 Octobre 2014
Présenté par : RAZAFINDRABE Tsiriniaina Jean Luco
Doctorant à l’A2E E.S.S.Agro.

i
REMERCIEMENTS
Nous tenons à remercier :
- Le Programme des Nations Unies pour le Developpement (PNUD), l’Organisme des
Nations Unies pour l’Education, la Science et la Culture (UNESCO) et du Comité
Scientifique (CS) ;
- L’Université d’Antananarivo à travers toute l’équipe G/DHD dirigée par Monsieur le
Vice Président de la Formation et de la Recherche ;
- Tout le personnel du Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSAgro.
Nous adressons, particulièrement, nos vifs remerciements et toutes nos chaleureuses
gratitudes à Monsieur le Professeur RAKOTOZANDRINDRAINY Raphaël, Chef de
Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSAgro. et aussi notre encadreur.
C’est avec un grand plaisir que nous réservons ces lignes en signe de gratitude et de
reconnaissance à tous ceux qui ont contribué de près ou de loin pour la réalisation de ce stage.

SOMMAIRE
REMERCIEMENTS ................................................................................................................... i
INTRODUCTION ...................................................................................................................... 1
CONTEXTE ................................................................................................................................ 1
HISTORIQUE ET ACTIVITES DU SITE D’ACCUEIL ....................................................... 2
METHODOLOGIE .................................................................................................................... 3
I. COLLECTE DE FECES DE BOVIN .............................................................................................. 3
I.1. Nature et condition de prélèvement ..................................................................................... 3
I.2. Lieu et modalité de prélèvement .......................................................................................... 3
I.3. Etiquetage............................................................................................................................... 3
I.4. Acheminement et transport .................................................................................................. 3
I.5. Réception au laboratoire ....................................................................................................... 3
II. EXAMEN BACTERIOLOGIQUE DES SELLES (COPROCULTURE)............................ 3
II.1. Examen macroscopique des prelevements ...................................................................... 3
II.2. Culture : ensemencement et isolement ............................................................................ 4
II.2.1. Milieu de culture ............................................................................................................ 4
II.2.2. Technique de culture et isolement ................................................................................ 5
II.3. Identification ...................................................................................................................... 5
II.3.1. Aspect des colonies ........................................................................................................ 5
II.3.2. Examen microscopique direct ...................................................................................... 5
II.3.3. Tests metaboliques (glucidiques, protéiques, lipidiques) ........................................... 7
II.3.4. Autres tests d’identification .......................................................................................... 7
II.4. Antibiogramme .................................................................................................................. 8
II.4.1. Technique et réalisation sur gélose Mueller Hinton ................................................... 8
II.4.2. Lecture et interprétation ............................................................................................... 8
III. EXAMEN PARASITOLOGIQUE DES SELLES .................................................................. 9
III.1. Technique de sédimentation ............................................................................................. 9
III.2. Différents types d’œuf d’helminthes des bovins observés .............................................. 9
Pages

RESULTATS ............................................................................................................................ 10
CONCLUSION ET PERSPECTIVES .................................................................................... 11
ANNEXES ................................................................................................................................. 12
REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES ............................................................................... 15

1
INTRODUCTION
Dans le cadre de la préparation du doctorat en santé animale au sein de l’Ecole
doctorale A2E ESSAgro de l’Université d’Antananarivo, le Programme des Nations Unies
pour le Developpement (PNUD), l’Organisme des Ntions Unies pour l’Education, la Science
et la Culture (UNESCO) en coopération avec l’ Université d’Antananarivo à travers la
Gouvernance et Développement Humain Durable (G/DHD) nous a offert un stage académique
3 mois au sein du Laboratoire de Microbiologie et de Parasitologie ESSA-Université
d’Antananarivo.
Notre thème concerne « la diarrhéé bovine : causes microbienne et parasitaire dans
les régions d’Amoron’i Mania et Vakinankaratra ». C’est pourquoi l’objectif de notre
stage focalisé sur le savoir-faire des analyses bactériologiques et parasitologiques relatifs à la
connaissance des causes de la diarrhée bovine.
CONTEXTE
A Madagascar, l’elevage bovin occupe une place très importante dans le cadre du
développement en intervenant dans plusieurs domaines économiques, sociologiques et
culturels (1). Comme toute spéculation, il rencontre des problèmes de maladies telles que la
diarrhée banale, le météorisme, les helminthoses (2). La diarrhée entraine des pertes
économiques pour les éleveurs alors que sa cause exacte reste encore méconnue.