Cours DCEM 3 Def Intell Handicap mental V des Portes

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Centre de référence national maladies rares
“X fragile et autres Déficiences intellectuelles
liées au chromosome X
Réseau national des Centres de compétence
“Déficiences intellectuelles de causes rares”
déficience intellectuelle / handicap mental
Pr Vincent des Portes
Centre de référence national “déficiences intellectuelles de causes rares : X fragile et autres DILX
Service de Neuro-pédiatrie, Hôpital HFME, Hospices Civils de Lyon
Université Claude Bernard Lyon 1, Faculté de médecine Lyon Sud
Institut des Sciences Cognitives, Cognitoscope, CNRS, Bron
Déficience intellectuelle
Et autres troubles du neurodéveloppement
Troubles
spécifiques
d’apprentissage
Déficience
intellectuelle
Patients souvent
concernés par
plusieurs troubles
Infirmité Motrice
Surdité / Basse vision
Autisme
Processus de Production du Handicap
(PPH/ Classification québécoise)
Facteurs de risque
Cause
Modèle systémique
de Patrick Fougeyrollas
Facteurs personnels
Systèmes
organiques
Intégrité
Déficience
RIPPH/SCCIDH 1998
C.P. 225
Lac St Charles (Québec)
G3G 3C1 CANADA
Facteurs environnementaux
Aptitudes
Capacité
Facilitateur
Incapacité
Interaction
Habitudes de vie
Diapositive empruntée à
Mme Catherine Barral,
Sociologue, CTNERHI
Participation sociale
Situation de handicap
Obstacle
Interaction entre vulnérabilité biologique et histoire singulière
Environnement
Familial
Social
scolaire
« une histoire singulière »
Psychodynamique
motivation
affectivité
estime de soi
émotions
Enfant
« Un cerveau qui apprend »
Compétences cognitives
élève
patient
langage, praxies,
mémoire, attention
raisonnement, planification
compétences sociales
Biologie / Pathologie
génétique
infection / toxique
anoxie / ischémie
Déficience intellectuelle (retard mental)
DSM-IV, American Psychiatric Association, 1994
• Fonctionnement intellectuel général < -2 DS (QI < 70)
= Insuffisance stable et définitive du développement intellectuel
=> Test psychométrique standardisé adapté à l’âge
• Limitations significatives du fonctionnement adaptatif
dans les secteurs d'aptitudes tels que
• communication
• apprentissage scolaire
• autonomie
• responsabilité individuelle
• vie sociale
• travail
=> Evaluation des capacités adaptatives (intelligence pratique)
• Le tout doit survenir avant l'âge de 18 ans.
• loisirs
• santé
• sécurité
Tests Psychométriques de Wechsler
David Wechsler
Totale
Compréhension
Verbale
Similitudes
Vocabulaire
Compréhension
Organisation
Perceptive
Cubes
Identification. C.
Matrices
Mémoire de Travail
Mémoire Chiffres
Séquence L.C.
Vitesse de
Traitement
Code
Symboles
Diapositive de René Pry, professeur de psychologie, Montpellier 1
Distribution du QI dans la population générale
95%
Prévalence
théorique
(aire sous la courbe)
• RM « léger » : 50 ≤ QI < 70
Logique concrète, lecture, écriture
• RM « modéré » : 35 ≤ QI < 50
Langage social, préscolaire
• RM « sévère/grave » : 20 < QI < 35
Quelques mots, schèmes circulaires
• RM « profond » : QI ≤ 20
Absence langage, ≤ 2 ans
-3
40
2,27%
2,27%
0,23%
50
?
-2
M
70
100
RM Sévère RM Léger
0,4 %
1,5 à 2 % ?
+2
130
+ 3 DS (déviations standard)
QI (quotient intellectuel)
Évaluation du fonctionnement adaptatif
Vineland Adaptive Behavior Scales (VABS 1984)
Communication : - compréhension
- expression
0.51
- écrit
Autonomie Vie : - personnel
0.31
Quotidienne
Socialisation :
0.27
- domestique
* Notes standards
- collectif
* Ages de
Développement
- relations interpersonnelles
- jeux et loisirs
- capacités d’adaptation
Motricité :
- globale
- fine
Degré de corrélation chez les adultes handicapés mentaux
entre le QI Total (WAIS ou WAIS R) et le score de Vineland
Déficience intellectuelle :
un trouble du raisonnement
Subtests très « chargés » en facteur G
(saturation > .70)
Subtests « verbaux »
Information
Similitudes
Vocabulaire
Compréhension
Subtests « non verbaux »
Cubes
+/- complètement d’images
Raisonnement visuel analogique
« Bas niveau » de traitement
perceptif
« Haut niveau » de traitement
Raisonnement / catégorisation
Déficience intellectuelle :
Altération des Processus généraux d’apprentissage
Inhibition
Jugement
Prise de décision
Raisonnement
Anticipation,
Flexibilité mentale
Mémoire de travail, Attention
Vitesse de traitement / Automatisation
Stratégies de Catégorisation
traitement de l’information : global / local
Diagnostics différentiels
de la Déficience intellectuelle :
Troubles spécifiques des
apprentissages
Olivier, 10 ans
Né à 41 SA,
PN 3380g, T 49 cm, PC 36.5 cm
Marche 19 mois
Retard massif du langage
=> CMP à 3 ans : psychomotricité + orthophonie
Scolarisé en CP à 6 ans, puis CLIS.
Arrêt de l’orthophonie pendant 2 ans…
A 10 ans,
Tr. phonologiques majeurs / agrammatisme,
Compréhension préservée
WISC-IV : Raisonnement perceptif normal (92)
Très rapide en matrices analogiques visuelles
= Dysphasie expressive phonologicosyntaxique sévère
 Scolarisation : CLIS TSL
+ orthophonie intensive
Guillaume, 15 ans
Né à 40 SA, poids 3240g, T 50 cm.
Marche 19 mois
Retard massif du langage
En PSM à 3 ans : phrases de 2 mots
Orthophonie libéral +++
CAMSP (4 à 7 ans) psychothérapie, psychomot.
CP puis Hop de Jour puis IME à 12 ans
A 15 ans, adressé par l’IME
pour suspicion de dysphasie
Contact agréable. Très sociable
Motricité fine : pince pouce index malhabile
Dyspraxie bucco-linguale
Troubles articulatoires Ne comprend pas.
Réponses brèves et stéréotypées.
WISC-III : QI 42 (QIV 46, QI P 48)
= Déficience intellectuelle modérée
=> Mutation gène ARX identifiée
Fonctions motricité
exécutives
Mémoire de
Travail
visuospatiales
Langage écrit
inhibition
Attention
Praxies gestuelles
Langage
expressif
Mémoire Court
Terme
Intelligence
Langage réceptif
Gnosies
Visuelles
Raisonnement
Gnosies
auditives
Mémoire
Long Terme
Attention
automatisation
Déficience intellectuelle :
Diagnostic étiologique
Causes des déficiences intellectuelles (retards mentaux)
*
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________
ETUDE
Auteur
Hagberg
Fernell
Hou
Cans
Stromme
Hagberg
Hou
Stromme
Pays
Suède
suède
Taiwan
France
Norvège
Suède
Taiwan
Norvège
Année
1983
1998
1998
1999
2000
1983
1998
2000
Nombre de sujets
73
64
3080
1150
79
91
3484
99
Sexe ratio (garçons / filles)
1,7
(1,4)
1,4
(1,3)
(1,4)
(1,3)
Tranche d'âge étudiée (années)
10 - 13
3 - 16
6 - 18
7 - 16
8 - 13
10 - 13
6 - 18
8 - 13
Degré de Retard Mental
RMS
RMS
RMS
RMS
RMS
RML
RML
RML
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________
ETIOLOGIE Nature de la cause (et/ou signe clinique associé)
Prénatal
55
Génétique
Acquis
- Aberration chromosomique (nombre / structure)
- Microdélétion : gènes contigüs
- Monogénique : mutation d'un gène (dont X fragile)
- Syndrome clinique bien défini (sans gène connu)
(infection, toxique, vasculaire…)
Indeterminé
20
12
(prématurité, anoxie à terme, infection néonatale)
8
1
12
- Malformation cérébrale
- Poly-malformations / dysmorphie
- Retard Familial ** : sans mutation retrouvée
Périnatal
66
31
70
34
70
23
46
51
37
30
0,7
5
20
18
42
22
5
16
4
2
2,5
4
8
13
8
11
7
1
3
<1
5
32
11,5
24
10
35
29
9
9
6
20
7
13
9
12
14
8
14
13
8
2
15
6
11
12
4
18
9
5
12
5
5
5
5
4
2
1
1,4
2
2
[début travail à J28]
Postnatal
[≥ 1 mois post natal]
Inconnu
- méningite, encéphalite
- accident : TC / noyade / toxique
- tumeur
0,4
0,3
18
23
14
49
22
55
43
43
(Proportion de cas familiaux)
1/4
1/2
_____________________________________________________________________________________________________________________________________________
* Hagberg B, Kyllerman M. Brain and Dev. , 1983 ; 5 : 441-9. Fernell E et al. Dev Med and Child Neurol., 1998 ; 40 : 608-11. Hou J W et al. J of Intellectual Disability
Research. 1998 ; 42 : 137-43. Cans C et al. Dev Med and Child Neurol., 1999 ; 41 : 233-9. Stromme P et al. Dev Med and Child Neurol., 2000 ; 42 : 76-86.
** Attention ! Tous les retards mentaux familiaux ne sont pas forcément d'origine génétique. Eliminer un facteur environnemental (alcool, médicament, diabète maternel,
carence affective majeure…) avant de considérer par défaut l'origine génétique du retard.
Causes des déficiences intellectuelles
(d'après cinq études de la littérature)
Retards mentaux inexpliqués :
Cause inconnue ou « anténatale indéterminée »
RM Sévère (QI < 50)
RM Léger (50 <QI < 70)
23 à 60 %
moyenne : 41 %
65 à 78 %
moyenne : 71 %
40 % RM inexpliqués
70 % RM inexpliqués
DI « organique » et « culturelle-familiale »
Déficience intellectuelle
« organique »
Déficience Intellectuelle
« familiale ou culturelle »
Atteinte du système nerveux.
Désavantage psycho-social
Déprivation environnementale.
Etiologies :
- toxique,
- infectieuse,
- traumatique
- génétique
Facteurs étiologiques :
- carence stimulation,
- troubles psycho-affectifs
- patrimoine génétique… ?
« Organique »
« Culturel-familial »
10
50
70
100
155
d’après René Pry, professeur de psychologie, Montpellier 1
QI
Cause périnatale :
Un Diagnostic positif rigoureux !
I- Souffrance cérébrale pendant la Période périnatale (48 heures)
 Dépression cérébrale
 hypotonie
 trouble de conscience
 trouble alimentation
 Dépression respiratoire
 Hyperexcitabilité corticale
 Hyperexcitabilité
 Crises épileptiques
II- Explication obstétricale de ce drame néonatal
Souvent la situation est plus complexe !
Souffrance périnatale : oui, mais…
Signes de souffrance antenatale chronique
 MAP, hypomobilité, toxémie, RCIU, microcéphalie
 palais ogival, sutures chevauchantes, pouces adductus
Période périnatale difficile à décrypter
 SFA objective mais pas de cause claire : aucune cause obstétricale évidente
ATCD familiaux particuliers
Autre enfant atteint d’encéphalopathie, consanguinité
Sémiologie clinique inhabituelle
 Intervalle libre prolongé, « aggravation », retard mental prédominant
 Dysmorphie, lésion cutanée, viscéromégalie, malformations
 Décompensation aiguë inexpliquée, trouble endocrinien
Diagnostic étiologique d’un retard mental :
A quoi ça sert ?
 Connaître la cause
Pourquoi mon enfant a-t-il un retard de développement ?
Affiner le pronostic
Risque –t-il de régresser ou continuera-t-il à faire des progrès ?
Arrivera-t-il à marcher, parler, apprendre un métier ?
Guider le traitement
Est-ce qu’il y a un traitement pour améliorer ses capacités ?
Y a-t-il des complications à éviter ?
Préciser le conseil génétique
Quel est le risque d’avoir un autre enfant retardé ?
Clinique : Martin et Bell, 1943
Cytogénétique : Lubs, 1969
Signes cliniques habituels
Comportement
Déficience intellectuelle
Troubles dysexécutifs
Anxiété sociale
Autisme
hyperactivité
distractibilité
anxiété sociale
mâchouillement
évitement du regard
persévérations motrices
mouvements stéréotypés
difficultés à gérer les émotions
peu de tolérance au changement
Langage
débit rapide
parole hachée
impulsions verbales
intelligibilité réduite
troubles articulatoires
écholalie / Soliloquie
persévérations verbales
tr planification discursive
Paradoxe de Sherman : hommes transmetteurs sains
Syndrome de l’X fragile : mutation dynamique
Oberlé I et al. Instability of a 550-base pair DNA segment and abnormal methylation
in fragile X syndrome. Science, 1991; 252: 1097-102.
Syndrome de l’X fragile
De la « mauvaise mère » à la « mère conductrice »…
tomber de Charybdes en Scylla !
FXTAS :
Fragile X Tremor Ataxia Syndrome
Prémutation 55 à 200 (homme >> femme)
Taux d’ARN : x 2 à 4 normale
Taux Protéine FMR1 : 75 % normale
38 % < 69 ans, 47% < 79 ans, 75 % > 80 ans
Clinique :
Proche des MSA (Atrophie Multi Systémique)
- Ataxie / Tremblement intentionnel
- Syndrome Parkinsonien
- Syndrome dysautonomique
+ Neuropathie périphérique
+ Démence secondaire
pédoncules cérébelleux moyens
Jacquemont et al., 2003 Am J Hum Genet
Penser à l’X fragile chez les filles !
•
•
•
•
Inactivation de l’X
Mammifères
Décrite par Mary Lyon
Inactivation au hasard d’1 des 2 X
Débute au stade blastocyste
« Etre » une fille porteuse de l’X fragile,
qu’est-ce que cela veut dire ?
« Génotype »
« Phénotype »
Mutation complète
Aucun symptôme
> 200 CGG
Timidité / anxiété
Difficultés mathématiques
Profil d’inactivation
Difficultés de planification
des chromosomes X
Déficit attentionnel / impulsivité
Trouble d’organisation spatiale
Taux de protéine FMRP
Isolement social
Déficience intellectuelle légère
Anomalies Cérébrales en IRM
Déficience intellectuelle sévère
Etiologie / cause
Conséquences / handicap
Diagnostic étiologique d’un retard mental :
A quoi ça sert ?
Connaître la cause
Pourquoi mon enfant a-t-il un retard de développement ?
Affiner le pronostic
Risque –t-il de régresser ou continuera-t-il à faire des progrès ?
Arrivera-t-il à marcher, parler, apprendre un métier ?
Va-t-il continuer à progresser
ou risque –t-il
de perdre ce qu’il a déjà acquis ?
Retard fixé ou
maladie progressive ?
Maladie de San Filippo
mucopolysaccharidose
Syndrome d’Angelman
Diagnostic étiologique d’un retard mental :
A quoi ça sert ?
Connaître la cause
Pourquoi mon enfant a-t-il un retard de développement ?
Affiner le pronostic
Risque –t-il de régresser ou continuera-t-il à faire des progrès ?
Arrivera-t-il à marcher, parler, apprendre un métier ?
 Guider le traitement
Est-ce qu’il y a un traitement pour améliorer ses
Y a-t-il des complications à éviter ?
capacités ?
Gravité d’un retard mental
Niveau cognitif
• RM « léger » : 50 ≤ QI < 70
« Sur-handicap »
• Troubles du comportement
Logique concrète, lecture, écriture
Sommeil, alimentation, agressivité...
• RM « modéré » : 35 ≤ QI < 50
• Trouble sensoriel : œil, oreille
Langage social, préscolaire
• RM « sévère » : 20 < QI < 35
Quelques mots, schèmes circulaires
• RM « profond » : QI ≤ 20
Absence langage, ≤ 2 ans
• Motricité, orthopédie
• Pathologie viscérale
Cardiaque, digestive, hormonale
• Epilepsie
Syndrome de Smith – Magenis : délétion en 17 p11
DISSOCIATIONS COGNITIVES INTER SYNDROMIQUES
des compétences plus faibles ou plus fortes selon les syndromes
Fonctions motricité
exécutives
Mémoire de
Travail
visuospatiales
Langage écrit
inhibition
Attention
Praxies gestuelles
Langage
expressif
Mémoire Court
Terme
Langage réceptif
Gnosies
Visuelles
Gnosies
auditives
Mémoire
Long Terme
Attention
automatisation
Syndrome de Williams – Beuren : délétion en 7 q11
Langage
Visuo-spatial
Mémoire verbale
Mémoire visuospatiale
Fonctions
exécutives/attention
Traitement
simultané/séquentiel
Mémoire Implicite
Trisomie 21
Williams
Beuren
X Fragile
-
+
+/-
Phono syntaxe Pragmatique +
Phono syntaxe +
Pragmatique -
Phono syntaxe +/Pragmatique +/-
+
+
+
+
+
+/+
-
simultané
simultané
simultané
+
-
?
Diagnostic étiologique d’un retard mental :
A quoi ça sert ?
Connaître la cause
Pourquoi mon enfant a-t-il un retard de développement ?
Affiner le pronostic
Risque –t-il de régresser ou continuera-t-il à faire des progrès ?
Arrivera-t-il à marcher, parler, apprendre un métier ?
Guider le traitement
Est-ce qu’il y a un traitement pour améliorer ses capacités ?
Y a-t-il des complications à éviter ?
 Préciser le conseil génétique
Quel est le risque d’avoir un autre enfant retardé ?
Gène MCT8
Family P30
I
.
1
2
II
1
2
3
Mutation gène MCT8 : Profil des Hormones thyroïdiennes
T3
T4
TSH
frère atteint
II 3
7.2
élevé
8.9
bas
2.4
normal
Soeur atteinte
II 1
5.6
élevé
10.7
bas
2.4
normal
Mère conduct.
I1
4.6
normal
11.0
bas
2.7
normal
Père sain
I2
5.0
normal
17.2
normal
1.54
normal
Valeurs usuelles (RIA)
T3 : free tri iodothyronine. Usual values : 2.8 to 5.3 pmol/L
T4 : free thyroxine. Usual values : 13.0 to 22.6 pmol/L
TSH : Usual values : 0.29 to 3.80 mU/L
TBG (thyroid Binding Globulin) : 10.9 to 30.1 mg/L
Thomas, encéphalopathie profonde, pas de tenue assise
spasmes infantiles puis épilepsie active
visage particulier
FISH : Hybridation In Situ par sondes Fluorescentes
délétion 1p ter
Stratégie de diagnostic étiologique
d’une Déficience intellectuelle :
Une démarche clinique
Démarche diagnostique d’une déficience intellectuelle
neuropédiatre
généticien
+/- pédopsychiatre
• Arbre généalogique
• Période ante et néonatale
• Développement psychomoteur
• Examen morphologique et neurologique
• Comportement, sommeil, alimentation
• Régression, épisodes aigus (coma, déficit)
• Atteinte multiviscérale (rein, foie)
• Audition (+/- PEA), vision (AV, FO, +/- LAF)
• Crises épileptiques (EEG)
Orientation clinique
DIAGNOSTIC CIBLE
• FISH sur caryotype
• Séquençage d’un gène
• MLPA (délétions / duplis)
• Bilan métabolique +/- PL
Démarche diagnostique d’une déficience intellectuelle
neuropédiatre
généticien
+/- pédopsychiatre
• Arbre généalogique
• Période ante et néonatale
• Développement psychomoteur
• Examen morphologique et neurologique
• Comportement, sommeil, alimentation
• Régression, épisodes aigus (coma, déficit)
• Atteinte multiviscérale (rein, foie)
• Audition (+/- PEA), vision (AV, FO, +/- LAF)
• Crises épileptiques (EEG)
Orientation clinique
DIAGNOSTIC CIBLE
IRM 1ère intention
Épilepsie
Marche > 2 ans
Signe neurologique
Micro/ macrocéphalie
FISH sur caryotype
Séquençage d’un gène
MLPA (délétions / duplis)
Bilan métabolique +/- PL
IRM cérébrale
Malformation cérébrale
leucodystrophie
Spectroscopie
+/- TDM
Si Microcéphalie
Anom. Subst blanche
Démarche diagnostique d’une déficience intellectuelle
neuropédiatre
généticien
+/- pédopsychiatre
• Arbre généalogique
• Période ante et néonatale
• Développement psychomoteur
• Examen morphologique et neurologique
• Comportement, sommeil, alimentation
• Régression, épisodes aigus (coma, déficit)
• Atteinte multiviscérale (rein, foie)
• Audition (+/- PEA), vision (AV, FO, +/- LAF)
• Crises épileptiques (EEG)
Retard « non spécifique »
Orientation clinique
Bilan
SANS
Caryotype
(600orientation
bandes)
FRAXA (sauf PC<-3DS)
• X fragile, CPK, NFS, ionogramme
• T3, T4, TSH, ASAT, ALAT
• Amoniémie post prandiale
• créatine et GAA urinaire
+/- échographie cardiaque, rénale
Si signes morphologiques mineurs
• Caryotype (600 bandes) ?
DIAGNOSTIC CIBLE
IRM 1ère intention
Épilepsie
Marche > 2 ans
Signe neurologique
Micro/ macrocéphalie
IRM cérébrale
Spectroscopie
FISH sur caryotype
Séquençage d’un gène
MLPA (délétions / duplis)
Bilan métabolique +/- PL
Malformation cérébrale
leucodystrophie
Démarche diagnostique d’une déficience intellectuelle
neuropédiatre
généticien
+/- pédopsychiatre
• Arbre généalogique
• Période ante et néonatale
• Développement psychomoteur
• Examen morphologique et neurologique
• Comportement, sommeil, alimentation
• Régression, épisodes aigus (coma, déficit)
• Atteinte multiviscérale (rein, foie)
• Audition (+/- PEA), vision (AV, FO, +/- LAF)
• Crises épileptiques (EEG)
Retard « non spécifique »
Orientation clinique
Bilan SANS orientation
• X fragile, CPK, NFS, ionogramme
• T3, T4, TSH, ASAT, ALAT
• Amoniémie post prandiale
• créatine et GAA urinaire
+/- échographie cardiaque, rénale
Si signes morphologiques mineurs
• Caryotype (600 bandes) ?
?
DIAGNOSTIC CIBLE
IRM 1ère intention
Épilepsie
Marche > 2 ans
Signe neurologique
Micro/ macrocéphalie
IRM cérébrale
Spectroscopie
-
FISH sur caryotype
Séquençage d’un gène
MLPA (délétions / duplis)
Bilan métabolique +/- PL
Malformation cérébrale
leucodystrophie
Télomères
Puces ADN (CGH
array, SNP)
« Puces
À défaut, MLPA pour télomères
et»microdélétions
Démarche diagnostique d’une déficience intellectuelle
• Arbre généalogique
• Période ante et néonatale
• Développement psychomoteur
• Examen morphologique et neurologique
• Comportement, sommeil, alimentation
• Régression, épisodes aigus (coma, déficit)
• Atteinte multiviscérale (rein, foie)
• Audition (+/- PEA), vision (AV, FO, +/- LAF)
• Crises épileptiques (EEG)
neuropédiatre
généticien
+/- pédopsychiatre
Retard « non spécifique »
Orientation clinique
Bilan SANS orientation
• X fragile, CPK, NFS, ionogramme
• T3, T4, TSH, ASAT, ALAT
• Amoniémie post prandiale
• créatine et GAA urinaire
+/- échographie cardiaque, rénale
Si signes morphologiques mineurs
• Caryotype (600 bandes) ?
?
MONOGENIQUE ?
• Expertise clinique
• Exome sequencing…
DIAGNOSTIC CIBLE
IRM 1ère intention
Épilepsie
Marche > 2 ans
Signe neurologique
Micro/ macrocéphalie
IRM cérébrale
Spectroscopie
-
FISH sur caryotype
Séquençage d’un gène
MLPA (délétions / duplis)
Bilan métabolique +/- PL
Malformation cérébrale
leucodystrophie
Puces ADN (CGH array,
SNP)
Télomères
À défaut, MLPA pour télomères
et microdélétions
« Puces
»
-
Si DI sévère
CAA s, CAO u
+/- CDG
+/- IRM
Les techniques d’analyse génétique
• Selon la résolution
• Biologie moléculaire
Séquençage
Mutation ponctuelle
Exon: 50 à 1000 pb
ATGCACTGATGAATGCATGCAAT
MLPA / Puces ciblées ?
délétions intragéniques
Gène moyen: 2.104 pb
• Cytogénétique
moléculaire
CGH array / FISH
délétion / dupli > 5.104 pb
Sous-bande: 2.106 pb
Caryotype standard
et haute résolution
• Cytogénétique
classique
Chromosome: 2.108 pb
Génome: 3.109 pb
Analyse Chromosomique sur Puces à ADN (ACPA)
(CGH array)
Extraction
Digestion
Marquage
Hybridation
Analyse des
rapports de
fluorescence
Révélation
Mise en évidence d’anomalies
chromosomiques déséquilibrées (résolution
environ 100 kb)
Dia empruntée au Pr Damien Sanlaville, Lyon
Les puces à ADN (CGH array)
Niveau de résolution :
40-50 000 bases
Détection de tout petits remaniements,
Mais pas d’accès à la séquence des gènes
Séquençage dit à haut débit
Next Generation Sequencing
Projet 1000 génomes
=> exome sequencing en routine ?
http://www.genome.gov/Images/press_photos/lowres/20028-72.jpg Jane Ades , NHGRI
Diapo D Sanlaville
136 familles consanguines atteintes de « déficience intellectuelle »
Technique : homozygotity mapping / séquençage exonique haut débit
Résultats : mutations pathogènes retrouvées dans 78 familles
dans 23 gènes connus
dans 50 nouveaux gènes !! (dans 52 familles…)
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