N° d’Ordre : Année : 2011

N°d’Ordre:215‐2011Année:2011
THESEENCOTUTELLE
ENTRE
L’UNIVERSITEDELYON(FRANCE)
ET
L’UNIVERSITED’ANTANANARIVO(MADAGASCAR)
Délivréepar
L’UNIVERSITECLAUDEBERNARDLYONIETL’UNIVERSITED’ANTANANARIVO
ECOLESDOCTORALES
DIPLOMEDEDOCTORAT
(Arrêtédu6janvier2005relatifàlacotutelleinternationaledethèse.)
(Arrêtédu7août2006relatifàlaformationdoctorale)
Présentéeetsoutenuepubliquementle8novembre2011
Par
FaraNantenainaRAHARIMALALA
ROLEDESMOUSTIQUESCULICIDAE,DELEURSCOMMUNAUTESMICROBIENNES,ETDES
RESERVOIRSVERTEBRES,DANSLATRANSMISSIOND’ARBOVIRUSAMADAGASCAR
DirecteurdeThèse:MonsieurPatrickMAVINGUI
Co‐DirecteurdeThèse:MadameBakolyOlgaRALISOA
JURY:
PRESIDENT:MonsieurVictorJEANNODA,Professeur,Universitéd’Antananarivo
RAPPORTEUR:MadameAnna‐BellaFAILLOUX,Directricederecherche,InstitutPasteur,Paris
RAPPORTEUR:MonsieurA.RASAMINDRAKOTROKA,ProfesseurTitulaire,Universitéd’Antananarivo
RAPPORTEUR:MonsieurHenriJonahRATSIMBAZAFY,ProfesseurHDR,Universitéd’Antananarivo
EXAMINATEUR:MonsieurMarcLEMAIRE,Professeur,UniversitédeLyon1
EXAMINATEUR:MadameBakolyOlgaRALISOA,ProfesseurTitulaire,Universitéd’Antananarivo
EXAMINATEUR:MonsieurPatrickMAVINGUI,DirecteurdeRecherche,CNRS,Lyon1

1
UNIVERSITECLAUDEBERNARD‐LYON1
Présidentdel’Université
Vice‐présidentduConseild’Administration
Vice‐présidentduConseildesEtudesetdelaVieUniversitaire
Vice‐présidentduConseilScientifique
SecrétaireGénéral
M.A.Bonmartin
M.leProfesseurG.Annat
M.leProfesseurD.Simon
M.leProfesseurJ‐F.Mornex
M.G.Gay
COMPOSANTESSANTE
FacultédeMédecineLyonEst
–
ClaudeBernard
FacultédeMédecineetdeMaïeutiqueLyonSud–CharlesMérieux
UFRd’Odontologie
InstitutdesSciencesPharmaceutiquesetBiologiques
InstitutdesSciencesetTechniquesdelaRéadaptation
DépartementdeformationetCentredeRechercheenBiologie
Humaine
Directeur :M.leProfesseurJ.Etienne
Directeur:M.leProfesseurF‐N.Gilly
Directeur:M.leProfesseurD.Bourgeois
Directeur:M.leProfesseurF.Locher
Directeur:M.leProfesseurY.Matillon
Directeur:M.leProfesseurP.Farge
COMPOSANTESETDEPARTEMENTSDESCIENCESETTECHNOLOGIE
FacultédesSciencesetTechnologies
DépartementBiologie
DépartementChimieBiochimie
DépartementGEP
DépartementInformatique
DépartementMathématiques
DépartementMécanique
DépartementPhysique
DépartementSciencesdelaTerre
UFRSciencesetTechniquesdesActivitésPhysiquesetSportives
ObservatoiredeLyon
EcolePolytechniqueUniversitairedeLyon1
EcoleSupérieurdeChimiePhysiqueElectronique
InstitutUniversitairedeTechnologiedeLyon1
InstitutdeScienceFinancièreetd'Assurances
InstitutUniversitairedeFormationdesMaîtres
Directeur :M.leProfesseurF.Gieres
Directeur:M.leProfesseurF.Fleury
Directeur:MmeleProfesseurH.Parrot
Directeur:M.N.Siauve
Directeur:M.leProfesseurS.Akkouche
Directeur:M.leProfesseurA.Goldman
Directeur:M.leProfesseurH.BenHadid
Directeur:MmeS.Fleck
Directeur:MmeleProfesseurI.Daniel
Directeur:M.C.Collignon
Directeur:M.B.Guiderdoni
Directeur:M.P.Fournier
Directeur:M.G.Pignault
Directeur:M.leProfesseurC.Coulet
Directeur:M.leProfesseurJ‐C.Augros
Directeur:M.R.Bernard

2
UNIVERSITED’ANTANANARIVO
Présidentdel’Université
Vice‐PrésidentchargédelaFormation,delaRechercheetdes
RelationsInternationales
Vice‐PrésidentchargédesRessources
Vice‐PrésidentchargéduPartenariatetdesTIC
M.lePr.ANDRIANTSIMAHAVANDYAbel
MmelePr.ANDRIAMIHAJABakolinirina
M.lePr.RAKOTOARISOAJeanEric
M.leDr.HARIJAONAJean‐Jules
COMPOSANTESDEL’UNIVERSITE
FacultédeMédecine
FacultédesSciences
FacultédeDroit,d’Economie,deGestionetdeSociologie
FacultédesLettresetSciencesHumaines
EcoleSupérieuredesSciencesAgronomiques
EcoleSupérieurePolytechniqued’Antananarivo
EcoleNormaleSupérieure
M.leDoyenlePrRAPELANORORABENJAF.
M.leDoyenANDRIANANTENAINABruno
M.leDoyenRANOVONAAndriamaro
M.leDoyenRANARIVONYRichard
M.leDirecteurRASOARAHONAJean
M.leDirecteurlePrANDRIANARYPhilippe
M.leDirecteur:Pr.d’ESRANDRIANARIMANANAJ.C.

3
REMERCIEMENTS
Faireunethèseestparmilesplusgrandesdécisionsdelaviequ’ilnefautjamaisprendreàlalégère.
JeremercieDieuToutPuissantpourlaforceetlasantéqu’Ilm’adonnéestoutaulongdemavie.
Cetravaildethèsen’auraitpaspuêtreeffectuésansl’aidetechniqueetmoraledenombreuses
personnes.Jetiensàremercierdetoutmoncœurtouteslespersonnesquiontcontribuéàsa
réalisation.Enpremierlieu:
‐ AuxDirigeantsdesdeuxUniversitésdecotutelle:UniversitéClaudeBernardetUniversité
d’Antananarivo,sansvotreautorisationdepartenariat,cettethèsen’auraitpaseulieu,je
vousenremercie.
‐ AmesdeuxDirecteursdethèse:MadameRalisoaBakolyOlgaetMonsieurMavinguiPatrick.
Sansl’aideinconditionnelledevotrepart,jeneseraipascapabled’arriverauboutdeces
quatreannéesdethèse.Toutesmesreconnaissancesvousserontàjamaisdues.
‐ MadameRalisoa,mercid’avoircruenmoietd’avoiracceptéd’êtremon«modèle
scientifique»,vousêtesl’unedespersonneslesplusstrictesmaisdeplusgrandcœurque
Dieum’apermisdecôtoyer.
‐ MonsieurPatrickMavingui,formerunepureentomologistepourdevenirun«expert»en
microbiologien’apasétéunechosefacileàfaire.Maisvotregrandegénérositéetvotre
patienceontétélaforcequimepoussaitàpersévérerjusqu’aubout.
‐ AMonsieurJeannodaquiaacceptédePrésiderlejury.AMadameFailloux,Monsieur
Rasamindrakotroka,MonsieurRatsimbazafyetMonsieurLemaire,membresdejurydecette
thèse.C’estungrandhonneuretungrandprivilègepourmoidevousavoircommejuges
dansl’examendecetravail.Mercipourvotretempsprécieux.
‐ AtouslesenseignantsdelaFacultédesSciencesdel’Universitéd’Antananarivo,jevous
remerciedetoutcœurdem’avoirformépourdevenir«unerelève»dignedevotrerang.
‐ Mesplusprofondesgratitudess’adressentaussiàtouslesenseignants,technicienset
étudiantsduDépartementd’Entomologie.
‐ Merciàtousmescollèguesdulaboratoired’EcologieMicrobiennedeLyon.Sansvotre
soutienetvotreaide,jen’auraijamaispufinirtouslestravauxquej’aieffectuéslà‐bas.

4
‐ Jetiensaussiàremerciertoutparticulièrementtousmesamis:Claire,Karima,Vincent,
Amélie,MariaPia,Amel,Lamia,Florence,Bonnie,Paule,Rondro,Sasa(Sahondra),Doria.
Sansvotresoutienetamitiécetravaildethèseauraitétéencoreplusduràeffectuer.
‐ MerciàVan,TahianaetAinapourlesaidestechniquesqu’ilsm’ontapporté,quelquefoisau‐
dessusdeleurforce!!!
‐ JevoudraiaussiremerciertoutparticulièrementlafamilleRatefiarivony(Mamisoa,Hianja,
MisetraetTsatsangy)pourm’avoirsigénéreusementprêtéleurordinateurquandj’avaiseu
laplusgrossefrayeurdemavie!!
Ungrandmercipour«LaFondationpourlaRecherchesurlaBiodiversité(FRB,ancienIFB)»quia
financécettethèse.CetravailaétésubventionnéparlecontratFRB‐CD‐AOOI‐07‐012,etmenéà
biendanslecadreduGDRI“BiodiversitéetDéveloppementDurableàMadagascar”etduCOST
actionF0701“ArthropodSymbioses:fromfundamentaltopestdiseasemanagement”.
JetiensàremercierenparticulierMadameRaveloson,notreChefdeDépartementd’Entomologie,
etMonsieurRavelonandro,DirecteurduCNRE,tousdeuxco‐coordonnateursduprojetIFBà
Madagascar,quim’ontapportéungrandsoutienlorsdesdifficultésquej’airencontréesaucours
decettethèse.
Etpourfinir,maplusprofondegratitudeestpourtoutemafamille.Mercid’avoirététoujourslà
pourmoi,danstouteslesépreuves.Maman,tuasfaitbeaucoupdesacrificespourquejesoislà
aujourd’hui,jen’aiqu’unseulmotàdire«merci!».