ECOLE DOCTORALE DES SCIENCES DE LA VIE ET DE LA SANTE

EA 4678 CIDAM Conception, Ingénierie et Développement de l’Aliment et du Médicament, Clermont
Université (M. Alric)
Directeur de thèse : Stéphanie Blanquet-Diot (MCU-HDR), co-directeur Tom Van de Wiele (Pr, Labmet, Université
de Gand, Belgique)
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Intérêt des probiotiques dans la lutte contre les infections à Escherichia coli entérotoxinogènes et
détermination des mécanismes d’action associés
Les Escherichia coli entérotoxinogènes (ETEC) sont une cause majeure de diarrhées infantiles dans les pays
en voie de développement et de diarrhées du voyageur. La survie des ETEC et la régulation des gènes de
virulence dans l’environnement digestif humain, ainsi que leur interaction avec l’hôte, sont des éléments clés dans
la physiopathologie de l’infection mais restent insuffisamment décrits à ce jour. Devant l’ampleur des phénomènes
d’antibiorésistance, des stratégies thérapeutiques alternatives aux antibiotiques, comme l’utilisation de
probiotiques, sont envisagées pour lutter contre ces infections. L’objectif de la thèse est d’utiliser les systèmes
digestifs artificiels TIM (EA CIDAM) et SHIME (Labmet), actuellement les plus pertinents au niveau mondial pour
reproduire les conditions rencontrées respectivement dans l’estomac/intestin grêle et le côlon, couplés à des
modèles cellulaires, afin de mieux comprendre le comportement des ETEC dans l’environnement digestif humain
(adulte et enfant -population à risque-). Les propriétés antagonistes vis-à-vis des ETEC de souches probiotiques
(bactéries, levures) seront également évaluées et les mécanismes d’action associés recherchés.
Etienne-Mesmin, et al. (2011). Effect of a new probiotic Saccharomyces cerevisiae strain on the survival of
Escherichia coli O157:H7 in a dynamic gastrointestinal model. Appl Environ Microbiol 77:1127-31.
Marzorati, et al. (2014). The HMITM module: a new tool to study the Host-Microbiota interaction in the human
gastrointestinal tract in vitro. BMC Microbiol 14:133.