La structure des protéines

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Laurent FINET, Dorothée OXOBY
Lille
STRUCTURE DES PROTEINES
Travaux des Actions Académiques Mutualisées
Niveau •Première STL-BGB
Thème du
programme
•1STL CBSV, Thème 1, 1.5 Les molécules des organismes vivants présentant
des structures et des propriétés spécifiques.
Situations
pédagogique
s
• AT de CBSV: Structure des protéines
Liens
internet
•http://www.biologieenflash.net/bio/flash/0026.swf
•http://www.cegep-ste-
foy.qc.ca/profs/gbourbonnais/pascal/fya/chimcell/notesmolecules/proteines_2.htm
•http://fr.wikipedia.org/wiki/Liaison_peptidique
Compétences
B2i
•Domaine 1 : s'approprier un environnement informatique de travail.
•Domaine 3 : créer, produire, traiter , exploiter des données.
•Domaine 4 : s'informer et se documenter.
Matériels
TICE
•Un poste PC par binôme
•Une connexion internet
•Logiciel de traitement de texte
Mots clés
• Acides aminés, structures primaire, secondaire, tertiaire, quaternaire, liaisons hydrogènes,
liaisons électrostatiques, intéractions hydrophobes, ponts disulfures...
Approfondir •structure des acides aminés, ionisation des acides aminés
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Animation 1 :
Animation 2 :
Schéma 1 :
Complément : une autre animation est disponible sur la transcription (de l’ADN à l’ARN):
http://www.snv.jussieu.fr/vie/dossiers/ADN_Prot/ADN_ARN/ADN_ARN.swf
Activité n° 1 Synthèse et structure primaire des
protéines
• Découvrir l'origine de l'enchaînement des acides aminés dans
la structure primaire des protéines.
Objectifs
• 15 minutes
Durée
conseillée
•Cliquer sur l'image pour accéder à l'animation sur la structure des
protéines. Répondre aux questions ci-dessous en utilisant comme
support de réponse un document de type traitement de texte.
Consignes
Questions
1- A partir de l’animation n°1, quel est l’organite qui permet la synthèse des protéines
au sein des cellules ?
2- Que représentent les lettres sur l’ARN messager ?
3- L’enchaînement des acides aminés est-il dû au hasard ? Justifier.
4- A partir du schéma n°1 qui présente la liaison peptidique, citer les fonctions
chimiques mises en jeu dans la formation de cette liaison.
5- Comment sont classés les acides aminés dans la partie acides aminés de l’animation
2 ?

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Activité n° 2 Structure secondaire des protéines
•Comprendre le mécanisme de formation des deux structures
principales (hélice alpha et feuillet béta)
Objectifs
• 15 minutes
Durée
conseillée
• Répondre aux questions ci-dessous en utilisant comme support de réponse
un document de type traitement de texte.
Consigne
Questions
1- D’après l’animation 2, quels sont les deux types d’organisation de structure
secondaire ?
2- Quelles sont les liaisons qui permettent la formation et le maintien de ces
structures ? Entre quels atomes se forment-elles ?
3- De quel type de liaison s’agit-il ?
4- Que signifie le terme « antiparallèle » ?

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Activité n° 3 Les structures tertiaire et quaternaire
• Comprendre le mécanisme de formation de la structure tertiaire.
Objectifs
• 15 minutes
Durée
conseillée
•Poursuivre l'animation n 1 et répondre aux questions ci-dessous en utilisant
comme support de réponse un document de type traitement de texte.
Consigne
Questions
1- D’après l’animation 2 dans la partie structure des protéines, quel est le seul acide
aminé mis en jeu dans la formation du pont disulfure ?
2- De quel type de liaison s’agit-il ?
3- Justifier la localisation des domaines hydrophobes et hydrophiles.
4- Quelles sont les deux autres interactions mises en jeu dans la formation de la
structure tertiaire ?
5- Quels sont les acides aminés impliqués dans ces deux autres interactions ?
Justifier.
6- Quel est le but de la formation de ces différentes interactions ?
7- Décrire la structure quaternaire.
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