Résumé L`infection par le virus de l`hépatite C est le problème

Résumé
L!infection par le virus de l'hépatite C est le problème majeur de santé publique qui
affecte la mortalité et la morbidité dans le monde entier. L!évolution naturelle et la
pathogenèse de l'hépatite C impliquent des processus d'interaction complexe entre
l!hôte et le virus. Plusieurs facteurs de l!hôte incluant des polymorphismes
génétiques et les réponses immunitaires influent sur l'infection et les réponses au
traitement. Le traitement le plus courant actuellement consiste en une combinaison
de peg-IFNĮ et de Ribavirine (RBV) qui permet une guérison d!environ 50 % des
patients infectés par le VHC de génotype 1. Aussi, il est important d'identifier en
amont les facteurs pour prédire la réponse au traitement. L'objectif de la thèse est
d'étudier l!influence de certains polymorphismes génétiques de l'hôte sur la réponse
à la bithérapie et sur le statut immunitaire du foie dans l'infection chronique par le
VHC. L'étude a porté sur les polymorphismes des gènes de l!interféron lambda 3 et 4
(IFNL : rs12979860 C/T, rs8099917 T/G, et ss469415590 TT/¨G), l'interféron gamma
(IFN-Ȗ : rs2430561 T/A)), l'interleukine 10 (IL-10 : rs1800896 A/G), et l'interleukine 17
(IL-17 : rs2275913 A/G), conjointement à la réponse au traitement avec le peg-IFNĮ
et la RBV et aux réponses immunitaires du foie chez les patients.
Dans un premier temps, nous avons établi une nouvelle méthode simple et fiable
pour le typage de deux polymorphismes de l!IFNL3. Après une amplification par
PCR, la présence d!un site de coupure par les enzymes de restriction BstUI et BrsDI
permet le génotypage de deux variantes de IFNL3 (rs12979860 C/T et rs8099917
T/G, respectivement). Les résultats indiquent que cette méthode PCR-RFLP donne
des résultats similaires à ceux des méthodes standard et présente un intérêt pour

des analyses de routine en laboratoire clinique car elle est peu couteuse.
Nous avons analysé l'association des polymorphismes avec la réponse à la thérapie
de combinaison peg-IFNĮ et RBV sur une cohorte de 108 patients infectés par le
VHC de génotype 1 traités dont 50% ont eu une réponse virologique soutenue et
50% considérés comme en rechute. Nous avons ainsi démontré que le génotype de
l!IFNL4 TT/TT de ss469415590 et une réponse virologique rapide sont des facteurs
prédictifs indépendants pour atteindre un taux de réponse virologique soutenue (OR
= 3,93, IC = 1,53 -10,08, p = 0,004 et OR = 6,74, IC = 1,33 - 34,06, p = 0,021).
D!autre part, une charge virale initiale haute est associée à l'échec au traitement (OR
= 0,34, IC = 0,13 - 0,87, p = 0,023). Ainsi, ces paramètres sont utiles pour la
définition d'un traitement personnalisé.
Pour expliquer l'influence de ces polymorphismes dans l'infection chronique par le
VHC, nous avons étudié l'association des polymorphismes IFNL3 et 4 avec la
réponse immunitaire du foie chez les patients atteints d'une infection chronique par le
VHC. En utilisant l!expression de CD107a comme marqueur de l!activité sécrétoires
des lymphocytes (molécules cytotoxiques ou cytokines), nous avons observé une
activité de dégranulation des lymphocytes du foie plus importante les patients
porteurs des génotypes de IFNL4 favorables en comparaison avec les patients
porteurs de l!allèle défavorable. En utilisant des analyses de régression, les taux
d'ALT sont en corrélation avec la fréquence des cellules NKT CD107a+ dans le foie.
Enfin, chez les patients traités par le thérapie de peg-IFNĮ et RBV, une forte activité
de dégranulation est observée chez les patients avec les génotypes favorables
IFNL3 et 4. Nous suggérons que les polymorphismes des gènes de l'interféron
lambda sont associés à l'activité de la dégranulation des lymphocytes intra-

hépatiques et contribuent à un mécanisme de clairance du VHC sous le bithérapie
de peg-IFNĮ et RBV.
Nous avons également étudié l'impact de plusieurs polymorphismes génétiques sur
la gravité de l'hépatite C chronique. Les résultats de l'étude montrent une association
significative observée entre le polymorphisme de l'IFN-Ȗ et la gravité de l'hépatite C
chronique. En utilisant l'analyse de régression logistique, l'allèle T et la présence
d'une stéatose sont des facteurs prédictifs indépendants de la sévérité de la maladie
hépatique chronique associée au VHC. L!utilisation du génotypage de l'IFN-Ȗ pourrait
être utile dans la gestion de la prise en charge des patients.
En conclusion, nous avons montré que les polymorphismes des gènes des IFNL3 et
4 et de l'IFN-Ȗ de l'hôte jouent un rôle important dans l!efficacité du traitement et les
réponses immunitaires hépatiques. Ces résultats aident à définir un traitement peg-
IFNĮ et RBV personnalisé pour le contrôle de l'infection chronique par le VHC, en
particulier dans les régions aux ressources limitées où les nouveaux traitements ne
sont pas accessibles.