Certains individus ont dû mal à assimiler certains acides aminés. Ces personnes ont une
carboxypeptidase inactive ne parvenant pas à fixer ou à catalyser la transformation du substrat. La
carboxypeptidase (CPA) est une enzyme pancréatique impliquée dans la digestion des protéines.
Pourquoi ?
Problèmes : Comment expliquer que certaines enzymes fonctionnent mal ? Comment
fonctionne le complexe enzyme-substrat ?
III – Le complexe enzyme-substrat :
A – L'exemple de la carboxypeptidase :
Activité 4 : Etude d’une enzyme : la carboxypeptidase
Bilan : L'enzyme a une structure géométrique tridimensionnelle de forme globulaire. Une partie de
cette enzyme est une petite cavité qui est capable d'épouser parfaitement le substrat : il s'agit du site
actif. Il est subdivisé en 2 : un site de fixation (ou de reconnaissance) et un site catalytique.
Le site de fixation est la partie strictement complémentaire au substrat : elle est constituée de
quelques acides aminés qui construisent une cavité. Il permet la formation du complexe enzyme-
substrat et explique la spécificité de l'enzyme pour son substrat.
Le site catalytique est la zone de l'enzyme qui assure la réaction chimique et qui explique la
spécificité de réaction de l'enzyme. Il est constitué de quelques acides aminés qui interviennent dans
une réaction chimique précise à l'origine d'un produit précis.
Question : Comment expliquer le problème de fonctionnement de la CPA ?
Activité 5 : Structure des enzymes
Bilan : Une modification de la séquence protéique d'une enzyme peut entraîner le changement de la
structure spatiale et donc entraîner un problème de fonctionnement du site actif ou soit créer un
nouveau fonctionnement.
Question : Existe-t-il d'autres facteurs influençant le fonctionnement du site actif ?
B – Des facteurs influençant le fonctionnement d'une enzyme :
Activité 6 : Etude du pH et de la température sur l'activité enzymatique
Bilan : Chaque enzyme possède une activité maximale pour une gamme de températures que l'on
nomme optimum thermique : pour des températures inférieures à cet optimum, l'agitation thermique
des molécules est trop faible et les enzymes mettent du temps pour rencontrer leur substrat. Au-delà
de l'optimum thermique, la protéine perd sa forme spatiale, le site actif disparaît : il n'y a plus de
réaction possible.
Il existe aussi un pH optimal qui correspond à une gamme de pH pour lesquels l'enzyme a une
activité maximale : dès que le pH du milieu s'écarte du pH optimal, les acides aminés qui
constituent l'enzyme se chargent différemment (ils deviennent des anions ou des cations selon le
pH). Les interactions entre les acides aminés de l'enzyme sont modifiées, elle perd son activité.