Ecole Doctorale Chimie et Sciences du Vivant

Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie
Sujet de stage de Master 2 Recherche
Année 2009/2010
Laboratoire : Institut de Biologie Structurale
Intitulé de l'équipe : Pathogénie Bactérienne
Directeur : E. Pebay-Peyroula
Responsable : A. Dessen
Nom et qualité du responsable du stage : Andrea DESSEN
HDR
Adresse : Institut de Biologie Structurale – 41 rue Jules Horowitz - Grenoble
Tél : 04-38-78-95-90
email : [email protected]
oui
non
Spécialité MASTER :
Biologie Cellulaire et Intégrative
Biodiversité - Ecologie – Environnement
Biochimie, Biologie Structurale
Titre du sujet : ETUDES STRUCTURALES D’UN NOUVEAU MECANISME D’INFECTION
EMPLOYE PAR DES PATHOGENES MAJEURS
Objectifs recherchés (3 lignes max) : Le stagiaire utilisera la biochimie et la cristallographie aux rayons
X pour étudier des protéines bactériennes qui forment un système de sécrétion de toxines chez les
pathogènes majeurs. Ces informations structurales pourront être utilisées à plus long terme dans le
développement de nouveaux antibiotiques qui affaiblissent l’arsenal de défense de pathogènes divers.
Résumé (10 lignes max) :
Des pathogènes majeurs pour l'homme, comme des souches infectieuses d’Escherichia coli, utilisent des
systèmes moléculaires complexes pour initier leur processus d'infection. Récemment, un nouveau système
bactérien utilise pour l’injection de toxines dans les cellules cibles a été découvert (le système de sécrétion
de type VI). Au laboratoire, nous employons des techniques comme la production de protéines
recombinantes, la cristallogenèse, et la cristallographie aux rayons X, entre autres, pour étudier le repliement
et l'assemblage de protéines qui sont essentielles pour la virulence de plusieurs bactéries. Le stagiaire
travaillera dans un groupe très expérimenté en termes d'études structurales de protéines bactériennes et sur
une thématique qui s'encadre dans l'axe "Immunité et Interaction Hôte-Pathogènes" de l'IBS. Les
connaissances apportées par l’analyse structurale de protéines importantes pour différents processus
d’infection seront d’une importance centrale pour le développement de nouveaux médicaments et vaccins.
Approches & matériel utilisés (3 lignes max) : L’étudiant apprendra a surexprimer et purifier des
protéines recombinantes, ainsi que de les cristalliser et éventuellement collecter des données de diffraction
aux rayons X. Matériel utilisé : résines de chromatographie, solutions de cristallogenèse et cryoprotection
d’échantillons, diffractomètre.
Publications pertinentes de l'équipe (3 max) :
Manzano, C., Contreras-Martel, C., El-Mortaji, L., Izoré, T., Fenel, D., Vernet, T., Schoehn, G., Di Guilmi,
A.M., and Dessen, A. (2008). Sortase-mediated pilus fiber formation in Streptococcus pneumoniae.
Structure 16, 1838-1848.
Macheboeuf, P., Fischer, D., Zervosen, A., Luxen, A., Joris, B., Dessen, A. and Schofield, C. (2007)
Structural and mechanistic basis of penicillin-binding protein inhibition by lactivicins. Nature Chem. Biol.
3, 565-569
Quinaud, M., Ple, S., Job, V., Contreras-Martel, C., Simorre, J.-P., Attree, I., and Dessen, A. (2007)
Structure of the heterotrimeric complex that regulates type III secretion needle formation. Proc. Natl. Acad.
Sci. USA 104, 7803-7808.
Master Sciences du Vivant - UFR de Biologie
Domaines de compétences souhaités (quelques mots clés) :
Pour BCI indiquez aussi la sous-spécialité (Biologie Végétale, Développement et Différenciation, Immunologie, Neurosciences,
Physiologie, Microbiologie)
Connaissances en biochimie de protéines recombinantes, intérêt par la biologie structurale