Recherche documentaire en médecine

Recherche documentaire en médecine
Parcours sur la Toile effectué avec Internet Explorer sur une machine de type PC
Les liens
Entrer dans l’espace « liens » des favoris (Internet Explorer) les adresses des sites suivants:
Google, CISMeF, Sante.fr, Service-Public, UMVF, article@inist, PubMed.
Entrer l'adresse dans la barre d'adresse et cliquer sur OK ou sur la touche Enter.
La page correspondante s'affiche à l'écran.
Cliquer sur "favoris", puis sur "ajouter", puis sur "créer dans" et sélectionner l'espace "liens".
Cliquer sur « OK »
L'espace "liens" des favoris permet d'avoir à portée de clics la dizaine de sites que
vous visitez régulièrement.
Rechercher (dans cette page)
Dans Google, faire une recherche sur le traitement de l'insuffisance cardiaque.
Cliquer sur le premier lien et rechercher dans la page qui s'affiche le mot bêta-bloquant.
L'équation s'écrit :
traitement "insuffisance cardiaque"
Dans la première page de résultat, la recherche du mot bêta-bloquant passe par le menu
déroulant édition
 rechercher (dans cette page)
 entrer le mot bêta-bloquant dans la fenêtre qui s'affiche
 cliquer sur "suivant" autant de fois que nécessaire.
Note : la réussite de cette manoeuvre dépend beaucoup de la façon dont vous écrivez bêta-
bloquant. L'outil recherche une chaîne de caractères et rien d'autre.
Dans Google plus que dans un autre outil de recherche, vous pouvez être
désorienté par les pages affichées en réponse à votre requête. La recherche de
l'emplacement d’un mot est une bonne façon de savoir pourquoi certains liens sont
affichés.
Les documents médicaux
Dans Google, faire une recherche sur le traitement de l'insuffisance cardiaque par les bêta
bloquants.
Dans la première page de résultats, repérer :
- un article original ;
- un article didactique ;
- une recommandation.
L'équation s'écrit :
traitement bêta-bloquants "insuffisance cardiaque"
Il y a peu de chances de trouver un article original.

En revanche, les articles didactiques ne manquent et il doit être possible de repérer une
recommandation.
Un article original est un article scientifique qui s'appuie sur une étude.
Un article didactique est un article qui s'appuie sur plusieurs articles originaux et
sur la sensibilité de son auteur.
Une recommandation est un document qui s'appuie sur une analyse exhaustive de
la littérature et sur des avis d'expert.
L'indexation
Dans Google, rechercher des documents sur les explorations fonctionnelles respiratoires
dans le diagnostic de l'asthme.
L'équation s'écrit :
asthme diagnostic "exploration fonctionnelle respiratoire"
Dans le premier lien qui s'affiche, rechercher les mots asthme, diagnostic et exploration
fonctionnelle respiratoire en utilisant la fonction "rechercher dans cette page" du menu
édition.
Constat : les mots sont disséminés dans la page.
Dans CISMeF, faire la même recherche (dans le module recherche avancée).
Dans le formulaire du module de recherche avancée :
- entrer asthme dans la fenêtre mot clé MeSH ;
- sélectionner diagnostic dans le menu déroulant qualificatif ;
- entrer exploration fonctionnelle respiratoire dans la 1ère fenêtre "tous les champs" (en
sélectionnant « mot clé »).
Résultat : 7 ressources dans le bordereau d'indexation (la liste des mots clés) desquelles on
retrouve les 3 mots asthme, diagnostic et exploration fonctionnelle.
Google est un robot qui constitue un index géant avec tous les mots de toutes les
pages qu'il rencontre. Chaque document est indexé par 200 à 2000 mots (selon la
longueur du texte).
CISMeF est un répertoire de pages indexées par des documentalistes
professionnels. Chaque document est indexé par 5 à 20 mots.
La mode d’emploi de Google
Entrer Cirrhose biliaire dans la fenêtre d'interrogation de Google.
Entrer "cirrhose biliaire".
Constater que le nombre de liens s'est réduit de façon sensible.
Cirrhose biliaire recherche toutes les pages contenant les mots cirrhose et biliaire, sans que
ces 2 mots soient nécessairement associés.
"Cirrhose biliaire" recherche toutes les pages contenant l'expression cirrhose biliaire.
Dans Google, les expressions et les mots composés sont entrés entre guillemets.
Entrer successivement et noter à chaque fois le nombre de liens (pages France)
cirrhose biliaire
cirrhose AND biliaire
"cirrhose biliaire"
cirrhose OR biliaire
cirrhose -biliaire

Dans Google
cirrhose biliaire = cirrhose AND biliaire
cirrhose -biliaire = cirrhose NOT biliaire
cirrhose OR biliaire recherche toutes les pages contenant le mot cirrhose, toutes
celles contenant le mot biliaire et toutes celles contenant à la fois le mot cirrhose
et le mot biliaire (et/ou).
Exercice : rechercher des documents sur l’alcoolisation septale des cardiomyopathies
hypertrophiques
Dans la page d'accueil de Google, cliquer sur "recherche avancée".
Entrer cirrhose biliaire dans la fenêtre "tous les mots".
Sélectionner :
- le format de fichier (pdf) ;
- l'emplacement (le titre de la page) ;
- le domaine (ne pas .....com
Résultat
Des liens :
- dans lesquels le mot cirrhose biliaire est dans le titre ;
- qui sont des documents au format pdf ;
- qui n'appartiennent pas à des sites en .com.
Le module de recherche avancée de Google est injustement méconnu et sous
utilisé.
Il s'avère très utile quand le "bruit"est "assourdissant" (très grand nombre de
liens dont une majorité semble inadéquats).
Exercice : rechercher des documents au format pdf sur la corticothérapie inhalée dans
l’asthme (écarter les sites en .com)
La mode d’emploi de CISMeF
L'interrogation en langage naturel
Recherche des documents sur la rééducation des lombalgiques.
Entrer rééducation lombalgie dans la fenêtre d'interrogation de la page d'accueil de CISMeF.
Résultat : une ressource
Dans ce cas, c'est le "mapping" de CISMeF qui est sollicité.
L'outil de mapping accepte lombalgie comme mot clé MeSH (mot réservé) et recherche
rééducation dans la description des ressources. L'interprétation (2 étoiles sur une échelle de
1 à 5) montre que l'adéquation de la requête avec le langage de CISMeF est médiocre.
L'interrogation en langage MeSH
La même recherche est envisagée (la rééducation des lombalgiques).
La première étape consiste à trouver les équivalents MeSH à lombalgie et rééducation. Pour
cela, il faut passer par la case "terminologie".
Cliquer sur "terminologie" dans la page d'accueil.
Entrer lombalgie dans la fenêtre "recherche". Résultat : le mot clé MeSH est lombalgie.
Entrer rééducation dans la fenêtre "recherche". Résultat : 8 mots clés sont proposés.
Celui qui convient est « rééducation et réadaptation » considéré comme un mot clé et
un qualificatif.

La 2è étape consiste à "croiser" les 2 mots clés. Pour cela, il faut solliciter le module de
recherche avancée.
Cliquer sur "avancée" dans la page d'accueil (sous la fenêtre d'interrogation).
Entrer :
- lombalgie dans la fenêtre "mot clé MeSH" .
- rééducation et réadaptation dans la première fenêtre "tous les champs" en sélectionnant
"mot clé".
Résultat : 6 ressources.
Note
Si la recherche se limite aux documents sur la lombalgie, c'est l'index alphabétique qui est
sollicité.
Index alphabétique  lettre L  lombalgie
Dans la page "lombalgie", deux possibilités :
- soit consulter les principales ressources (notion de "pondération") ;
- soit consulter toutes les ressources.
Exercice : rechercher des documents sur la corticothérapie inhalée dans l’asthme
Les banques de données bibliographiques
article@inist
 interface d'interrogation du fonds documentaire de l'Inist
 interrogation en langage naturel
 recherche d'un article en consultation experte
 syntaxe
recommandation <AND> réanimation <AND> arrêt cardiaque
Exercice : recherche des notices bibliographiques sur les troubles de l’apprentissage chez
l’enfant et l’adolescent (5 dernières années)
MEDLINE/PubMed
 PubMed est l’interface d’interrogation de la banque de données bibliographiques
MEDLINE.
 MEDLINE s’interroge en langage MeSH et à l’aide d’une syntaxe originale (notions
de champ, de qualificatif et d’explosion).
 Les équations de recherche sont du type :
mot clé [champ] Opérateur booléen mot clé [champ] Opérateur booléen mot clé
[champ]
Le langage
Il a été abordé rapidement dans le mode d’emploi de CISMeF.
Le langage MeSH est le langage d’interrogation privilégié de CISMeF et de MEDLINE.
Traduire un mot clé du langage courant en descripteur MeSH nécessite de solliciter le
module « Terminologie » de CISMeF.
Exemple rechercher le descripteur MeSH correspondant à bête-bloquant.
Entrée de bloquant dans la fenêtre recherche – Clic de souris sur OK
Sous le cadre de la recherche s’affiche un cadre intitulé « bloquant » qui propose 5
mots clés (ou descripteurs).

Parmi ces 5 mots clés figure le « bon » : adrenergic beta-antagonists (antagonistes
bêta adrénergiques)
Question  pourquoi « bloquant » et non pas « bêta-bloquant » ?
Pour 2 raisons :
- parce que l’outil tient compte de la façon dont est saisi le mot bêta-bloquant (et que
le risque qu’il soit saisi « n’importe comment » est élevé) ;
- parce que, par défaut, chaque mot clé entré dans la fenêtre « recherche » bénéficie
d’une double troncature.
Règle  dans la fenêtre « recherche » est entré un seul mot (au singulier) ; si le mot
est composé, seul un des composants (celui qui risque d’afficher le plus petit nombre
de réponses est affiché) est entré dans la fenêtre.
Exercices  rechercher le descripteur MeSH correspondant à :
- drépanocytose ;
- arrêt cardiaque ;
- cancer colorectal ;
- histoire naturelle (d’une maladie). Attention ! Piège.
La syntaxe
Deux obstacles syntaxiques : les qualificatifs et les champs.
Les qualificatifs
A chaque descripteur peut être affilié un qualificatif
Exemples :
diagnostic de l’asthme  asthma/diagnosis
 effets secondaires des bêta-bloquants  Adrenergic beta
antagonists/adverse effects
 instrumentation de l’angioplastie transluminale : Angioplasty, Transluminal.
Percutaneous Coronary/instrumentation.
Exercices : rechercher les descripteurs et qualificatifs correspondant à :
 épidémiologie du cancer colorectal
 pharmacologie des antiarythmiques
 contre-indications de la ponction lombaire
Les champs
Ils précisent le sens ou la localisation du mot clé.
Ils doivent être systématiquement utilisés.
Exemple : le mot clé kidney peut être :
- un descripteur  Kidney [mh]
- un auteur  Kidney [au]
- un mot du titre  kidney [ti]
- un mot du titre ou du résumé  kidney [tiab]
- un mot clé  kidney [tw]
La formulation
Elle est du type :
mot clé [champ] opérateur booléen mot clé [champ] opérateur booléen mot clé
[champ]
ou
asthma/diagnosis [mh] AND french [la] AND review [pt] AND 2004:2005
[dp]
Aujourd’hui, il est conseillé d’oublier les formulations semi-automatiques (type Limits)
et automatiques (type Preview/index).