Recherche documentaire en médecine

Recherche documentaire en médecine
Parcours sur la Toile effectué avec Internet Explorer sur une machine de type PC
Les liens
Entrer dans l’espace « liens » des favoris (Internet Explorer) les adresses des sites suivants:
Google, CISMeF, Sante.fr, Service-Public, UMVF, article@inist, PubMed.
Entrer l'adresse dans la barre d'adresse et cliquer sur OK ou sur la touche Enter.
La page correspondante s'affiche à l'écran.
Cliquer sur "favoris", puis sur "ajouter", puis sur "créer dans" et sélectionner l'espace "liens".
Cliquer sur « OK »
L'espace "liens" des favoris permet d'avoir à portée de clics la dizaine de sites que
vous visitez régulièrement.
Rechercher (dans cette page)
Dans Google, faire une recherche sur le traitement de l'insuffisance cardiaque.
Cliquer sur le premier lien et rechercher dans la page qui s'affiche le mot bêta-bloquant.
L'équation s'écrit :
traitement "insuffisance cardiaque"
Dans la première page de résultat, la recherche du mot bêta-bloquant passe par le menu
déroulant édition
 rechercher (dans cette page)
 entrer le mot bêta-bloquant dans la fenêtre qui s'affiche
 cliquer sur "suivant" autant de fois que nécessaire.
Note : la réussite de cette manoeuvre dépend beaucoup de la façon dont vous écrivez bêtabloquant. L'outil recherche une chaîne de caractères et rien d'autre.
Dans Google plus que dans un autre outil de recherche, vous pouvez être
désorienté par les pages affichées en réponse à votre requête. La recherche de
l'emplacement d’un mot est une bonne façon de savoir pourquoi certains liens sont
affichés.
Les documents médicaux
Dans Google, faire une recherche sur le traitement de l'insuffisance cardiaque par les bêta
bloquants.
Dans la première page de résultats, repérer :
- un article original ;
- un article didactique ;
- une recommandation.
L'équation s'écrit :
traitement bêta-bloquants "insuffisance cardiaque"
Il y a peu de chances de trouver un article original.
En revanche, les articles didactiques ne manquent et il doit être possible de repérer une
recommandation.
Un article original est un article scientifique qui s'appuie sur une étude.
Un article didactique est un article qui s'appuie sur plusieurs articles originaux et
sur la sensibilité de son auteur.
Une recommandation est un document qui s'appuie sur une analyse exhaustive de
la littérature et sur des avis d'expert.
L'indexation
Dans Google, rechercher des documents sur les explorations fonctionnelles respiratoires
dans le diagnostic de l'asthme.
L'équation s'écrit :
asthme diagnostic "exploration fonctionnelle respiratoire"
Dans le premier lien qui s'affiche, rechercher les mots asthme, diagnostic et exploration
fonctionnelle respiratoire en utilisant la fonction "rechercher dans cette page" du menu
édition.
Constat : les mots sont disséminés dans la page.
Dans CISMeF, faire la même recherche (dans le module recherche avancée).
Dans le formulaire du module de recherche avancée :
- entrer asthme dans la fenêtre mot clé MeSH ;
- sélectionner diagnostic dans le menu déroulant qualificatif ;
- entrer exploration fonctionnelle respiratoire dans la 1ère fenêtre "tous les champs" (en
sélectionnant « mot clé »).
Résultat : 7 ressources dans le bordereau d'indexation (la liste des mots clés) desquelles on
retrouve les 3 mots asthme, diagnostic et exploration fonctionnelle.
Google est un robot qui constitue un index géant avec tous les mots de toutes les
pages qu'il rencontre. Chaque document est indexé par 200 à 2000 mots (selon la
longueur du texte).
CISMeF est un répertoire de pages indexées par des documentalistes
professionnels. Chaque document est indexé par 5 à 20 mots.
La mode d’emploi de Google
Entrer Cirrhose biliaire dans la fenêtre d'interrogation de Google.
Entrer "cirrhose biliaire".
Constater que le nombre de liens s'est réduit de façon sensible.
Cirrhose biliaire recherche toutes les pages contenant les mots cirrhose et biliaire, sans que
ces 2 mots soient nécessairement associés.
"Cirrhose biliaire" recherche toutes les pages contenant l'expression cirrhose biliaire.
Dans Google, les expressions et les mots composés sont entrés entre guillemets.
Entrer successivement et noter à chaque fois le nombre de liens (pages France)
cirrhose biliaire
cirrhose AND biliaire
"cirrhose biliaire"
cirrhose OR biliaire
cirrhose -biliaire
Dans Google
cirrhose biliaire = cirrhose AND biliaire
cirrhose -biliaire = cirrhose NOT biliaire
cirrhose OR biliaire recherche toutes les pages contenant le mot cirrhose, toutes
celles contenant le mot biliaire et toutes celles contenant à la fois le mot cirrhose
et le mot biliaire (et/ou).
Exercice : rechercher des documents sur l’alcoolisation septale des cardiomyopathies
hypertrophiques
Dans la page d'accueil de Google, cliquer sur "recherche avancée".
Entrer cirrhose biliaire dans la fenêtre "tous les mots".
Sélectionner :
- le format de fichier (pdf) ;
- l'emplacement (le titre de la page) ;
- le domaine (ne pas .....com
Résultat
Des liens :
- dans lesquels le mot cirrhose biliaire est dans le titre ;
- qui sont des documents au format pdf ;
- qui n'appartiennent pas à des sites en .com.
Le module de recherche avancée de Google est injustement méconnu et sous
utilisé.
Il s'avère très utile quand le "bruit"est "assourdissant" (très grand nombre de
liens dont une majorité semble inadéquats).
Exercice : rechercher des documents au format pdf sur la corticothérapie inhalée dans
l’asthme (écarter les sites en .com)
La mode d’emploi de CISMeF
L'interrogation en langage naturel
Recherche des documents sur la rééducation des lombalgiques.
Entrer rééducation lombalgie dans la fenêtre d'interrogation de la page d'accueil de CISMeF.
Résultat : une ressource
Dans ce cas, c'est le "mapping" de CISMeF qui est sollicité.
L'outil de mapping accepte lombalgie comme mot clé MeSH (mot réservé) et recherche
rééducation dans la description des ressources. L'interprétation (2 étoiles sur une échelle de
1 à 5) montre que l'adéquation de la requête avec le langage de CISMeF est médiocre.
L'interrogation en langage MeSH
La même recherche est envisagée (la rééducation des lombalgiques).
La première étape consiste à trouver les équivalents MeSH à lombalgie et rééducation. Pour
cela, il faut passer par la case "terminologie".
Cliquer sur "terminologie" dans la page d'accueil.
Entrer lombalgie dans la fenêtre "recherche". Résultat : le mot clé MeSH est lombalgie.
Entrer rééducation dans la fenêtre "recherche". Résultat : 8 mots clés sont proposés.
Celui qui convient est « rééducation et réadaptation » considéré comme un mot clé et
un qualificatif.
La 2è étape consiste à "croiser" les 2 mots clés. Pour cela, il faut solliciter le module de
recherche avancée.
Cliquer sur "avancée" dans la page d'accueil (sous la fenêtre d'interrogation).
Entrer :
- lombalgie dans la fenêtre "mot clé MeSH" .
- rééducation et réadaptation dans la première fenêtre "tous les champs" en sélectionnant
"mot clé".
Résultat : 6 ressources.
Note
Si la recherche se limite aux documents sur la lombalgie, c'est l'index alphabétique qui est
sollicité.
Index alphabétique  lettre L  lombalgie
Dans la page "lombalgie", deux possibilités :
- soit consulter les principales ressources (notion de "pondération") ;
- soit consulter toutes les ressources.
Exercice : rechercher des documents sur la corticothérapie inhalée dans l’asthme
Les banques de données bibliographiques
article@inist
 interface d'interrogation du fonds documentaire de l'Inist
 interrogation en langage naturel
 recherche d'un article en consultation experte
 syntaxe
recommandation <AND> réanimation <AND> arrêt cardiaque
Exercice : recherche des notices bibliographiques sur les troubles de l’apprentissage chez
l’enfant et l’adolescent (5 dernières années)
MEDLINE/PubMed
 PubMed est l’interface d’interrogation de la banque de données bibliographiques
MEDLINE.
 MEDLINE s’interroge en langage MeSH et à l’aide d’une syntaxe originale (notions
de champ, de qualificatif et d’explosion).
 Les équations de recherche sont du type :
mot clé [champ] Opérateur booléen mot clé [champ] Opérateur booléen mot clé
[champ]
Le langage
Il a été abordé rapidement dans le mode d’emploi de CISMeF.
Le langage MeSH est le langage d’interrogation privilégié de CISMeF et de MEDLINE.
Traduire un mot clé du langage courant en descripteur MeSH nécessite de solliciter le
module « Terminologie » de CISMeF.
Exemple rechercher le descripteur MeSH correspondant à bête-bloquant.
Entrée de bloquant dans la fenêtre recherche – Clic de souris sur OK
Sous le cadre de la recherche s’affiche un cadre intitulé « bloquant » qui propose 5
mots clés (ou descripteurs).
Parmi ces 5 mots clés figure le « bon » : adrenergic beta-antagonists (antagonistes
bêta adrénergiques)
Question  pourquoi « bloquant » et non pas « bêta-bloquant » ?
Pour 2 raisons :
- parce que l’outil tient compte de la façon dont est saisi le mot bêta-bloquant (et que
le risque qu’il soit saisi « n’importe comment » est élevé) ;
- parce que, par défaut, chaque mot clé entré dans la fenêtre « recherche » bénéficie
d’une double troncature.
Règle  dans la fenêtre « recherche » est entré un seul mot (au singulier) ; si le mot
est composé, seul un des composants (celui qui risque d’afficher le plus petit nombre
de réponses est affiché) est entré dans la fenêtre.
Exercices  rechercher le descripteur MeSH correspondant à :
- drépanocytose ;
- arrêt cardiaque ;
- cancer colorectal ;
- histoire naturelle (d’une maladie). Attention ! Piège.
La syntaxe
Deux obstacles syntaxiques : les qualificatifs et les champs.
Les qualificatifs
A chaque descripteur peut être affilié un qualificatif
Exemples :
diagnostic de l’asthme  asthma/diagnosis
 effets secondaires des bêta-bloquants  Adrenergic beta
antagonists/adverse effects
 instrumentation de l’angioplastie transluminale : Angioplasty, Transluminal.
Percutaneous Coronary/instrumentation.
Exercices : rechercher les descripteurs et qualificatifs correspondant à :
 épidémiologie du cancer colorectal
 pharmacologie des antiarythmiques
 contre-indications de la ponction lombaire
Les champs
Ils précisent le sens ou la localisation du mot clé.
Ils doivent être systématiquement utilisés.
Exemple : le mot clé kidney peut être :
- un descripteur  Kidney [mh]
- un auteur  Kidney [au]
- un mot du titre  kidney [ti]
- un mot du titre ou du résumé  kidney [tiab]
- un mot clé  kidney [tw]
La formulation
Elle est du type :
mot clé [champ] opérateur booléen mot clé [champ] opérateur booléen mot clé
[champ]
ou
asthma/diagnosis [mh] AND french [la] AND review [pt] AND 2004:2005
[dp]
Aujourd’hui, il est conseillé d’oublier les formulations semi-automatiques (type Limits)
et automatiques (type Preview/index).
Exercices : faire une recherche dans MEDLINE sur :
 les mises au point publiées en 2004 et 2005 sur le traitement antibiotique des infections
respiratoires de la mucoviscidose
 les publications en langue française sur le débit expiratoire de pointe dans la surveillance
de l’asthme
 les recommandations publiées au cours des 5 dernières années sur l’aide au sevrage
tabagique.
NOTE
Gestion des parenthèses quand les opérateurs booléens OR et AND cohabitent
dans la même équation
Règle : les mots clés qui encadrent l’opérateur booléen OR sont mis entre parenthèses (sauf
dans Google).
Exemples :
Dans Google : réanimation arrêt cardiaque OR arrêt cardiorespiratoire
Dans article@inist : réanimation <AND> (arrêt cardiaque <OR> arrêt cardiorespiratoire)
Dans CISMeF (recherche booléenne) réanimation.mc ET (arrêt cardiaque.mc OR arrêt
cardiorespiratoire.pt)
Les sites
Les institutions de santé (le portail des agences sanitaires)
Dans la page d'accueil de sante.fr
 la liste des agences sanitaires
 les nouveautés des agences
Le ministère
 les dossiers (accès dans la page d'accueil par thème)
 les publications de la DREES (accès dans la cadre de gauche
études-statistiques).
recherches-
Exercice : rechercher le dossier « bronchopneumopathie chronique obstructive »
Afssaps (dans la barre de menus)
 sécurité sanitaire et vigilances
 alertes
 point sur
 vigilances
 interactions médicamenteuses
 documentation et publication
 recommandations de bonne pratique
 répertoires des médicaments génériques
 répertoire des spécialités pharmaceutiques
Exercices :
Rechercher « le point sur » le traitement hormonal de la ménopause.
Rechercher la recommandation de bonne pratique sur « l’antibiothérapie par voie générale
en pratique courante ».
InVS
 actualités (barre de menus et page d’accueil)
 bulletin épidémiologique hebdomadaire (page d'accueil)
 surveillance (barre de menus et page d’accueil)
 dossiers thématiques sur les maladies infectieuses, les maladies à déclaration
obligatoire, la santé publique
Exercice
Rechercher la liste des maladies à déclaration obligatoire
Rechercher le dernier point sur l’épidémie de grippe aviaire
Anaes – HAS
Note
La bibliothèque médicale AF Lemanissier (http://www.bmlweb.org) recense à la fois toutes
les recommandations de l'Anaes et celles des sociétés savantes.
Exercices :
Retrouver la conférence de consensus sur l’accompagnement du sujet alcoolodépendant
après sevrage (dans les conférences de consensus de la bibliothèque Lemanissier).
Les données législatives et administratives - Service Public
Le site Service-Public donne accès à plusieurs sites d'un grand intérêt.
Legifrance
 pour retrouver les textes publiés au JO, cliquer sur « les autres textes
législatifs » dans la page d’accueil.
Exercice :
Rechercher le texte de la loi du 13 août 2004 relative à l’assurance maladie
Rechercher le texte de loi sur les droits des malades
Documentation française (les rapports publics)
 exemple : le rapport Berland sur la démographie médicale
 la médecine est dans l'espace "questions sociales" de la recherche thématique.
Les données médicales - "actualisation des connaissances"
UMVF
 campus numériques des spécialités médicales et chirurgicales
Sites pluridisciplinaires
 corpus médical de la faculté de médecine de Grenoble
 cours en ligne de la faculté de médecine de Strasbourg
Les stratégies
Recherche d'un document sur un sujet général : CISMeF
 recommandations sur la mucoviscidose
 traitement de la maladie de Parkinson
 épidémiologie de la polyarthrite rhumatoïde
Recherche d'un document sur un sujet précis : Google (ou, éventuellement
article@inist)
 la ventilation non invasive dans les décompensations aiguës d'insuffisance
respiratoire chronique
 les classifications radiologiques de l'ostéochondrite primitive de hanche
 traitement des maladies coeliaques résistantes au régime sans gluten
Recherche d'un document (ou d’un site) dont on connaît l'intitulé exact : Google
superstar
 guide du bon usage des examens d’imagerie
 site de la nouvelle société française d’athérosclérose
 proposition de classification des Hallux Valgus
Recherche d'un document dont on connaît la localisation précise
 la loi du 4 mars 2002 (Legifrance)
 l’étude d’évaluation de l’Anaes sur le risque cardiovasculaire global (Anaes-HAS)
 les services départementaux de PMI d’Indre et Loire (Finess)
 le syndrome de l’Xfragile
 les médecins à consulter en cas de problème de santé au Honduras
 la chimioprohylaxie du paludisme chez une femme enceinte de six mois se rendant
au Sénégal (CAT)
Philippe Eveillard