UMR 6023 LMGE Processus de dispersion d`un biofilm à Klebsiella

UMR CNRS 6023 - LMGE, Université Clermont Auvergne (T. SIME NGANDO)
Directeur de thèse : Damien BALESTRINO (MCU-HDR)
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Processus de dispersion d’un biofilm à Klebsiella pneumoniae
Les biofilms, agrégats bactériens composés de cellules organisées en communautés et entourées d’une gangue
protectrice, représentent le mode de vie privilégié des bactéries dans la nature. Leur développement est un
processus séquentiel complexe qui conduit à la formation de structures tridimensionnelles à partir desquelles se
détachent des microorganismes. Cette dernière étape, appelée dispersion, est d’un intérêt particulier puisqu’elle
permet aux bactéries de disséminer et de coloniser d’autres surfaces ; les mécanismes moléculaires mis en jeu
restent cependant méconnus. Nous avons récemment montré que les bactéries Klebsiella pneumoniae issues de
la dispersion présentent un profil transcriptionnel unique, différent de ceux des formes planctonique et biofilm
(Guilhen et al., 2016). De plus, des résultats préliminaires indiquent que ces bactéries présentent également des
propriétés spécifiques notamment en terme de virulence.
Le projet de thèse à pour but d’identifier de façon exhaustive les gènes potentiellement impliqués dans le
processus de dispersion en utilisant les données de transcriptomiques établies. Leur rôle sera ensuite confirmé via
la création et l’analyse de mutants de délétion ou de surexpression dans des modèles in vitro. La détermination du
phénotype des bactéries dispersées complétera cette approche, via la détermination dans des modèles
expérimentaux in vitro et in vivo, de leurs propriétés d’adhésion, de colonisation et de la réponse immunitaire
engendrée.
Guilhen, et al. (2016). Transcriptional profiling of Klebsiella pneumoniae defines signatures for planktonic, sessile
and biofilm-dispersed cells. BMC Genomics. 17(1):237