UMR CNRS 6023 Laboratoire Microorganismes : Génome et Environnement, Clermont Université (T. SIME-NGANDO) Directeur de thèse : Christiane FORESTIER (PR-UdA) [email protected] Mécanismes moléculaires et conséquences in vivo du détachement de biofilms à Klebsiella pneumoniae Les bactéries adhérentes, regroupées en amas dénommés biofilms, sont particulièrement problématiques en milieu hospitalier puisqu’elles présentent une résistance accrue aux agents antimicrobiens et au système immunitaire. Le développement d’un biofilm est un processus séquentiel complexe qui conduit à la formation de structures tridimensionnelles formées de bactéries englobées dans une matrice extracellulaire à partir desquels se détachent des microorganismes. Cette dernière étape est d’un intérêt particulier puisque c’est elle qui permet aux bactéries de disséminer et de coloniser d’autres surfaces. Les mécanismes moléculaires de ce phénomène sont relativement peu connus, mais résulteraient plutôt de processus programmés et contrôlés génétiquement. Le projet a pour but, d’une part, de comprendre les mécanismes moléculaires mis en jeu lors du détachement d’un biofilm à K. pneumoniae en utlisant des systèmes expérimentaux de formation de biofilms couplés à une analyse transcriptiomique à grande échelle. D’autre part, il consistera à l’étude des propriétés spécifiques des bactéries présentes dans ces agrégats dans des modèles in vitro et in vivo afin de mieux comprendre le déclenchement d’infections systèmiques secondairement au décrochement des bactéries à partir d’un biofilm bactérien. Balestrino D, et al. (2008) The characterization of functions involved in the establishment and maturation of Klebsiella pneumoniae in vitro biofilm revealed multiple and opposite roles for surface exopolysaccharides. Environ Microbiol, 10 :685-701. Da Re S, et al. (2013) Identification of commensal Escherichia coli genes involved in biofilm resistance to pathogen colonization. PLoS ONE, accepté