جامعة قاصدي مرابح ورقلة قسم هندسة الطرائق الكيمياء احليوية وميكروبيولوجيا:مقياس Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E) Durée 1H30 Exercice-1: Les endorphines ont été isolés de la glande pituitaire on 1976. Ce sont des calmants. β-Endorphine est un polypeptide contenant 32 aminoacides bruts. La digestion de β-Endorphine avec trypsine donne les fragments suivants: (1) (2) (3) (4) (5) (6) Lys Gly-Gln Asn-Ala-His-Lys Asn-Ala-Ile-Val-Lys Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys Ser-Glu-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys 1- A partir de ces donnés seulement quel est l’acide aminé C-terminal. Le traitement avec bromure de cyanogène (CNBr) donne 26 acides aminés et hexapeptide suivants: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met 2- A partir de ces donnés seulement, quel est l’acide aminé Nterminal. La digestion de β-Endorphine avec chymotrypsine donne parmi les autres fragments, un fragment de 15 unités identifié: Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys-Ser-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe Vous pouvez maintenant de placer 22 des 32 unités d’acides aminés. 3- Ecrivez autant que vous pouvez de l'ordre. Exercice-2: Compléter: a) H 2NCH2 COOH + NaOH (aq) H 2NCH2 COOH + HCl H 2NCH2 COOH + NaNO2 + HCl H 2NCH2 COOH + C 2H 5 OH + H2 SO4 O A + HBr NH + RCHBrCO2H H 2O, H + O Phthalimide COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 C Ni R CHO + HCN +NH 3 D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 H +POCl3 + HCl Quelle sont les formules structurelles du valine: a) en milieu acide b) milieu basique c) point isoelectrique E G + HCl + SO2 Exercice-3: (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 Valine H+ P(OH) 3 + F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 H 2O Solution Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E) Durée 1H30 Exercice-1: Les endorphines ont été isolés de la glande pituitaire on 1976. Ce sont des calmants. β-Endorphine est un polypeptide contenant 32 aminoacides bruts. La digestion de β-Endorphine avec trypsine donne les fragments suivants: (1) (2) (3) (4) (5) (6) Lys Gly-Gln Asn-Ala-His-Lys Asn-Ala-Ile-Val-Lys Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys Ser-Glu-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys 1-A partir de ces donnés seulement quel est l’acide aminé C-terminal. Le traitement avec bromure de cyanogène (CNBr) donne 26 acides aminés et hexapeptide suivants: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met 2-A partir de ces donnés seulement, quel est l’acide aminé N-terminal. La digestion de β-Endorphine avec chymotrypsine donne parmi les autres fragments, un fragment de 15 unités identifié : Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys-Ser-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe Vous pouvez maintenant de placer 22 des 32 unités d’acides aminés. 3-Ecrivez autant que vous pouvez de l'ordre. Exercice-1 (Solution) :(C-terminal amino acid) C-حتديد احلمض األميين الطريف Arg ،Lys يقطع البيبتيد يف اجلهة الكربوكسيلية لـTrypsin مبا أن انزمي : وكذلك مبا أن الشظية، )Arg أندروفني ال حيتوي على الـ-β( Gly–Glnهي الوحيدة من الشظااي الناجتة من هذا التحليل اليت ال حتتوي على الـ Lysكحمض أميين طريف ،C -تكون حتما Gly–Glnهي الشظية الطرفية ،C-ومنه نستنتج أن Glnهو احلمض األميين الطريف C-للبتييد – βاندروفني. حتديد احلمض األميين الطريف:(N-terminal amino acid) N- مبا أن -βاندروفني حيتوي على وحدة واحدة من احلمض األميين ،Metكما هو مبني يف الشظية اخلامسة ،كما أن cyenagen brmideيقطع اليبتيد يف اجلهة الكربوكسيلية ل ـ Metفقط فأن الشظية : Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met هي الشظية الطرفية (N-terminal fragment) N-و الشظية ذات 26محض أميين هي الشظية الطرفية (C-terminal fragment) C-ومنه نستنتج أن الـ Tyrهو محض أميين طريف.N- حتديد 22موقع من 32محض أميين يف الـ – βأندورفني : من الشظية ذات 15وحدة متحررة بواسطة أنزمي ، chymotrypsinاليت حتتوي على Leu-Met كجزء طريف N-وهو ايضا جزء طرىف C-يف الشظية: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met املتحررة عند معاجلة الببتيد بواسطة Cyanogen bomideومنه ميكن كتابة التسلسل التايل: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-LysSer-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe والشظية اخلامسة تؤيد هذا التسلسل من جهة وتساعد من جهة أخرى على إضافة الـ Lysإليه وبذلك نكون قد رتبنا إىل هذه املرحلة 20محض أميين Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-LysSer-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys ابإلضافة إىل هذا التسلسل ،لقد مت حتديد موقعني املتمثلني يف الشظية Gly-Glnالطرفية– Cللبيبتيد -βأندروفني ،أي يكون جمموع األمحاض األمينية اليت مت حتديد مواقعها يساوي .22 Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys-Ser-GlnThr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys-..............-Gly-Gln :املعلومات اإلضافية اليت حتتاجها لتكملة هذا التسلسل .حنتاج إىل القيام ابلتحليل اجلزئي هلذا البيبتيد عدة مرات Exercice-2: Compléter: a) H 2 NCH2 COOH + NaOH (aq) H 2 NCH2 COOH + HCl H 2 NCH2 COOH + NaNO2 + HCl H 2 NCH2 COOH + C 2 H5 OH + H2 SO4 O A + HBr NH + RCHBrCO2 H H 2 O, H + O Phthalimide COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH 3 C COOH NH 3, H2 R CHO + HCN +NH3 H 3 CH 3 C COOH + PCl3 NH 2 H CH 3 C COOH + SOCl2 NH 2 H CH 3 C COOH + PCl5 NH 2 Exercice-2 (Solution) C Ni D H 2O H+ E P(OH)3 + E F + HCl + SO2 G +POCl3 + HCl a) H2 NCH 2COO- Na + H2 NCH 2COOH + NaOH (aq) Cl-H 3 N+CH2 COOH H2 NCH 2COOH + HCl H2 NCH 2COOH + NaNO 2 + HCl HOCH 2COOH + N 2 HSO4 -H 3N +CH 2CO2 Et H2 NCH 2COOH + C2 H5 OH + H 2SO4 O O NH + RCHBrCO2 H NCH(R)COOH + HBr O Phthalimide O A H2 O, H + COOH RCH(NH 2)COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 Ni R CHO + HCN +NH 3 H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 CH 3CH(NH 2 )COOH RCH(NH 2)CN D C H 2O H+ P(OH) 3 + CH 3CH(NH 2 )COCl F CH 3CH(NH 2 )COCl G + HCl + SO2 CH 3CH(NH 2 )COCl H +POCl3 + HCl Exercice-3: Quelle sont les formules structurelles du valine: (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 Valine a) milieu acide b) milieu basique c) point isoelectrique RCH(NH 2)COOH E Exercice-3 (Solution) : (a) (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 (b) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 2 (c) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 3 Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E) Durée 1H30/2012-213 Exercice-1: Compléter: a) H 2NCH2 COOH + NaOH (aq) H 2NCH2 COOH + HCl H 2NCH2 COOH + NaNO2 + HCl H 2NCH2 COOH + C 2H 5 OH + H2 SO4 O A + HBr NH + RCHBrCO2H H 2O, H + O Phthalimide COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 C Ni R CHO + HCN +NH 3 D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 H+ E P(OH) 3 + F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 H 2O G + HCl + SO2 H +POCl3 + HCl Exercice-2: Quelle sont les formules structurelles du valine: (CH3 )2 CHCH CO 2H NH2 Valine a) en milieu acide b) milieu basique c) point isoelectrique 03-مت ـ ـرين هناك عدة ببتيدات موجودة يف الدماغ تعمل كنواقل كيميائية للسياالت العصبية؛ أحد هذه . يعتقد أهنا تعمل كناقلة للسيالة العصبية،P البيبتيدات هو املادة Arg-Pro-Lys-Pro-Gln-Phe-Phe-Gly-Leu-Met (P) : انزمييا مع،P ما هي الشظااي اليت حنصل عليها من حتليل املادة a) Trypsin b) Chymotrypsin Solution Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E) Durée 1H30 Exercice-1 (Solution) a) H2 NCH 2COO- Na + H2 NCH 2COOH + NaOH (aq) Cl-H 3 N+CH2 COOH H2 NCH 2COOH + HCl H2 NCH 2COOH + NaNO 2 + HCl HOCH 2COOH + N 2 HSO4 -H 3N +CH 2CO2 Et H2 NCH 2COOH + C2 H5 OH + H 2SO4 O O NH + RCHBrCO2 H NCH(R)COOH + HBr O Phthalimide O A H2 O, H + COOH RCH(NH 2)COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 Ni CH 3CH(NH 2 )COOH R CHO + HCN +NH 3 RCH(NH 2)CN D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 C H 2O H+ RCH(NH 2)COOH E P(OH) 3 + CH 3CH(NH 2 )COCl F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 CH 3CH(NH 2 )COCl G + HCl + SO2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 CH 3CH(NH 2 )COCl H +POCl3 + HCl Exercice-3 (Solution) : (a) (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 (b) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 2 (c) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 3 حل التمرين:03 (aاالنزمي trypsinسيكسر البيبتيد عند اجلهة الكربوكسيلية لـ Lysو الـ Argليعطي: Arg and Pro-Lys and Pro-Gln-Phe-Phe-Gly-Leu-Met (bمبا أن اإلنزمي chymotrypsinسيكسر البيبتيد عند اجلهة الكربوكسيلية للـ Trp, Tyrو الـ Phe ،فان املادة Pيطرأ عليها تغيري عند اجلهة الكربوكسيلية لـ Pheوال يطرأ عليها تغيري عند اجلهة الكربوكسيلية لـ Trp, Tyrلعدم احتوائها على هذين احلمضني األمينيني. Arg-Pro-Lys-Pro-Gln-Phe and Phe-Gly-Leu-Met Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés )Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E Durée 1H30/2012-213 Exercice-1: Compléter: a) H 2NCH2 COOH + NaOH (aq) H 2NCH2 COOH + HCl H 2NCH2 COOH + NaNO2 + HCl H 2NCH2 COOH + C 2H 5 OH + H2 SO4 O A + HBr NH + RCHBrCO2H H 2O, H + O Phthalimide COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 C Ni R CHO + HCN +NH 3 D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 H+ E P(OH) 3 + F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 H 2O G + HCl + SO2 H +POCl3 + HCl Exercice-2: Quelle sont les formules structurelles du valine: (CH3 )2 CHCH CO 2H NH2 Valine a) en milieu acide b) milieu basique c) point isoelectrique 03-مت ـ ـرين هناك عدة ببتيدات موجودة يف الدماغ تعمل كنواقل كيميائية للسياالت العصبية؛ أحد هذه . يعتقد أهنا تعمل كناقلة للسيالة العصبية،P البيبتيدات هو املادة Arg-Pro-Lys-Pro-Gln-Phe-Phe-Gly-Leu-Met (P) : انزمييا مع،P ما هي الشظااي اليت حنصل عليها من حتليل املادة a) Trypsin b) Chymotrypsin Solution Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E) Durée 1H30 Exercice-1 (Solution) a) H2 NCH 2COO- Na + H2 NCH 2COOH + NaOH (aq) Cl-H 3 N+CH2 COOH H2 NCH 2COOH + HCl H2 NCH 2COOH + NaNO 2 + HCl HOCH 2COOH + N 2 HSO4 -H 3N +CH 2CO2 Et H2 NCH 2COOH + C2 H5 OH + H 2SO4 O O NH + RCHBrCO2 H NCH(R)COOH + HBr O Phthalimide O A H2 O, H + COOH RCH(NH 2)COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 Ni CH 3CH(NH 2 )COOH R CHO + HCN +NH 3 RCH(NH 2)CN D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 C H 2O H+ RCH(NH 2)COOH E P(OH) 3 + CH 3CH(NH 2 )COCl F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 CH 3CH(NH 2 )COCl G + HCl + SO2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 CH 3CH(NH 2 )COCl H +POCl3 + HCl Exercice-3 (Solution) : (a) (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 (b) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 2 (c) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 3 حل التمرين:03 (aاالنزمي trypsinسيكسر البيبتيد عند اجلهة الكربوكسيلية لـ Lysو الـ Argليعطي: Arg and Pro-Lys and Pro-Gln-Phe-Phe-Gly-Leu-Met (bمبا أن اإلنزمي chymotrypsinسيكسر البيبتيد عند اجلهة الكربوكسيلية للـ Trp, Tyrو الـ Phe ،فان املادة Pيطرأ عليها تغيري عند اجلهة الكربوكسيلية لـ Pheوال يطرأ عليها تغيري عند اجلهة الكربوكسيلية لـ Trp, Tyrلعدم احتوائها على هذين احلمضني األمينيني. Arg-Pro-Lys-Pro-Gln-Phe and Phe-Gly-Leu-Met جامعة قاصدي مرابح ورقلة قسم هندسة الطرائق مقياس :الكيمياء احليوية وميكروبيولوجيا Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés )Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E Durée 1H30 Exercice-1: Compléter: a) H 2NCH2 COOH + NaOH (aq) H 2NCH2 COOH + HCl H 2NCH2 COOH + NaNO2 + HCl H 2NCH2 COOH + C 2H 5 OH + H2 SO4 O A + HBr NH + RCHBrCO2H H 2O, H + O Phthalimide COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 C Ni R CHO + HCN +NH 3 D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 H +POCl3 + HCl Quelle sont les formules structurelles du valine: d) en milieu acide e) milieu basique f) point isoelectrique E G + HCl + SO2 Exercice-2: (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 Valine H+ P(OH) 3 + F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 H 2O Exercice-3: Les endorphines ont été isolés de la glande pituitaire on 1976. Ce sont des calmants. β-Endorphine est un polypeptide contenant 32 aminoacides bruts. La digestion de β-Endorphine avec trypsine donne les fragments suivants: (1) (2) (3) (4) (5) (6) Lys Gly-Gln Asn-Ala-His-Lys Asn-Ala-Ile-Val-Lys Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys Ser-Glu-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys 4- A partir de ces donnés seulement quel est l’acide aminé C-terminal. Le traitement avec bromure de cyanogène (CNBr) donne 26 acides aminés et hexapeptide suivants: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met 5- A partir de ces donnés seulement, quel est l’acide aminé Nterminal. La digestion de β-Endorphine avec chymotrypsine donne parmi les autres fragments, un fragment de 15 unités identifié: Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys-Ser-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe Vous pouvez maintenant de placer 22 des 32 unités d’acides aminés. 6- Ecrivez autant que vous pouvez de l'ordre. Solution Université Kasdi Merbah-Ouargla Dept. Génié des procédés )Module : Biochimie et Microbilogie (Master-G.E Durée 1H30 )Exercice-3 (Solution حتديد احلمض األميين الطريف:(C-terminal amino acid) C- مبا أن انزمي Trypsinيقطع البيبتيد يف اجلهة الكربوكسيلية لـ Arg ،Lys (-βأندروفني ال حيتوي على الـ ، )Argوكذلك مبا أن الشظية: Gly–Glnهي الوحيدة من الشظااي الناجتة من هذا التحليل اليت ال حتتوي على الـ Lysكحمض أميين طريف ،C -تكون حتما Gly–Glnهي الشظية الطرفية ،C-ومنه نستنتج أن Glnهو احلمض األميين الطريف C-للبتييد – βاندروفني. حتديد احلمض األميين الطريف:(N-terminal amino acid) N- مبا أن -βاندروفني حيتوي على وحدة واحدة من احلمض األميين ،Metكما هو مبني يف الشظية اخلامسة ،كما أن cyenagen brmideيقطع اليبتيد يف اجلهة الكربوكسيلية ل ـ Metفقط فأن الشظية : Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met هي الشظية الطرفية (N-terminal fragment) N-و الشظية ذات 26محض أميين هي الشظية الطرفية (C-terminal fragment) C-ومنه نستنتج أن الـ Tyrهو محض أميين طريف.N- حتديد 22موقع من 32محض أميين يف الـ – βأندورفني : من الشظية ذات 15وحدة متحررة بواسطة أنزمي ، chymotrypsinاليت حتتوي على Leu-Met كجزء طريف N-وهو ايضا جزء طرىف C-يف الشظية: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met املتحررة عند معاجلة الببتيد بواسطة Cyanogen bomideومنه ميكن كتابة التسلسل التايل: Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-LysSer-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe والشظية اخلامسة تؤيد هذا التسلسل من جهة وتساعد من جهة أخرى على إضافة الـ Lysإليه وبذلك نكون قد رتبنا إىل هذه املرحلة 20محض أميين Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-LysSer-Gln-Thr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys ابإلضافة إىل هذا التسلسل ،لقد مت حتديد موقعني املتمثلني يف الشظية Gly-Glnالطرفية– Cللبيبتيد -βأندروفني ،أي يكون جمموع األمحاض األمينية اليت مت حتديد مواقعها يساوي .22 Tyr-Gly-Gly-Phe-Leu-Met-Thr-Ser-Glu-Lys-Ser-GlnThr-Pro-Leu-Val-Thr-Leu-Phe-Lys-..............-Gly-Gln املعلومات اإلضافية اليت حتتاجها لتكملة هذا التسلسل: حنتاج إىل القيام ابلتحليل اجلزئي هلذا البيبتيد عدة مرات. )Exercice-2 (Solution a) H2 NCH 2COO- Na + H2 NCH 2COOH + NaOH (aq) Cl-H 3 N+CH2 COOH H2 NCH 2COOH + HCl H2 NCH 2COOH + NaNO 2 + HCl HOCH 2COOH + N 2 HSO4 -H 3N +CH 2CO2 Et H2 NCH 2COOH + C2 H5 OH + H 2SO4 O O NH + RCHBrCO2 H NCH(R)COOH + HBr O Phthalimide O A H2 O, H + COOH RCH(NH 2)COOH B + COOh Acide o-phthalique b) O CH3 C COOH NH3 , H 2 Ni CH 3CH(NH 2 )COOH R CHO + HCN +NH 3 RCH(NH 2)CN D H 3 CH3 C COOH + PCl3 NH2 C H 2O H+ RCH(NH 2)COOH E P(OH) 3 + CH 3CH(NH 2 )COCl F H CH3 C COOH + SOCl2 NH2 CH 3CH(NH 2 )COCl G + HCl + SO2 H CH3 C COOH + PCl5 NH2 CH 3CH(NH 2 )COCl H +POCl3 + HCl Exercice-1 (Solution) : (a) (CH 3 )2 CHCH CO 2H NH 3 (b) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 2 (c) (CH 3 )2 CHCH CO 2NH 3